Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME9

Gtpbp4, Nucleolar GTP-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp4Q99ME9 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gtpbp4Q99ME9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Gtpbp4Q99ME9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms