Protein–RNA interactions for Protein: Q8K467

Tmie, Transmembrane inner ear expressed protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmieQ8K467 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TmieQ8K467 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TmieQ8K467 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TmieQ8K467 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TmieQ8K467 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TmieQ8K467 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TmieQ8K467 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TmieQ8K467 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TmieQ8K467 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TmieQ8K467 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TmieQ8K467 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TmieQ8K467 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TmieQ8K467 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TmieQ8K467 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TmieQ8K467 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TmieQ8K467 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TmieQ8K467 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TmieQ8K467 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.9 ms