Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms