Protein–RNA interactions for Protein: Q3E827

LSO1, Protein LSO1, yeastyeast

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSO1Q3E827 SPO21YOL091W 1830 nt2.87□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 ESC1YMR219W 4977 nt2.87□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.87□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YBR174CYBR174C 315 nt2.87□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 UBP15YMR304W 3693 nt2.87□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 ZRG17YNR039C 1818 nt2.86□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YIL169CYIL169C 2988 nt2.86□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 ECM29YHL030W 5607 nt2.86□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YOR345CYOR345C 351 nt2.86□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 PUT3YKL015W 2940 nt2.86□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 TFC8YPL007C 1767 nt2.86□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 RLM1YPL089C 2031 nt2.86□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 SEC7YDR170C 6030 nt2.86□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YER138CYER138C 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YER160CYER160C 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YJR027WYJR027W 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YML039WYML039W 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YML045WYML045W 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YMR050CYMR050C 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 GEA1YJR031C 4227 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 RPS25BYLR333C 327 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 DCP2YNL118C 2913 nt2.85□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 MDM1YML104C 3384 nt2.84□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 ZIP1YDR285W 2628 nt2.84□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 YIR044CYIR044C 186 nt2.84□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 RPL33BYOR234C 324 nt2.84□□□□□ -1.95
LSO1Q3E827 ILS1YBL076C 3219 nt2.83□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 PMR1YGL167C 2853 nt2.83□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 SAS3YBL052C 2496 nt2.83□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.83□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 CYR1YJL005W 6081 nt2.82□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 PMP1YCR024C-A 123 nt2.82□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 ZIP2YGL249W 2115 nt2.82□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.82□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 NOP14YDL148C 2433 nt2.81□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 YME2YMR302C 2553 nt2.81□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 TRS130YMR218C 3309 nt2.81□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 YJL120WYJL120W 324 nt2.81□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 ACM1YPL267W 630 nt2.81□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 YFR016CYFR016C 3702 nt2.81□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 SGM1YJR134C 2124 nt2.8□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 PRP42YDR235W 1635 nt2.8□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 SNU13YEL026W 381 nt2.8□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 ATP7YKL016C 525 nt2.8□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 RAD34YDR314C 2079 nt2.79□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 NUP100YKL068W 2880 nt2.79□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 NCA2YPR155C 1851 nt2.78□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 MET18YIL128W 3099 nt2.78□□□□□ -1.96
LSO1Q3E827 RGC1YPR115W 3252 nt2.78□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 UBR1YGR184C 5853 nt2.77□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 NAM7YMR080C 2916 nt2.77□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 RPO41YFL036W 4056 nt2.77□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 ISW1YBR245C 3390 nt2.77□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 ORC2YBR060C 1863 nt2.76□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 YDL196WYDL196W 330 nt2.76□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 YHR210CYHR210C 1026 nt2.76□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.76□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 RPS29AYLR388W 171 nt2.76□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 CAT2YML042W 2013 nt2.76□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 VPS8YAL002W 3825 nt2.76□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 MAK10YEL053C 2202 nt2.76□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 HSH155YMR288W 2916 nt2.75□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 MAD1YGL086W 2250 nt2.75□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 COY1YKL179C 2040 nt2.75□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 NOC3YLR002C 1992 nt2.75□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 RPS22AYJL190C 393 nt2.75□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 FAR11YNL127W 2862 nt2.75□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 POL3YDL102W 3294 nt2.74□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 YLL007CYLL007C 1998 nt2.74□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 AIM44YPL158C 2277 nt2.74□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.74□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 YBL053WYBL053W 375 nt2.74□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 PAU3YCR104W 375 nt2.73□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.73□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 FIG4YNL325C 2640 nt2.72□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 ENV11YGR071C 2583 nt2.72□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 RPL31AYDL075W 342 nt2.72□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 SIR3YLR442C 2937 nt2.72□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 PIP2YOR363C 2991 nt2.72□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 TOP2YNL088W 4287 nt2.72□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 EDS1YBR033W 2760 nt2.72□□□□□ -1.97
LSO1Q3E827 APL2YKL135C 2181 nt2.71□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 SRO77YBL106C 3033 nt2.7□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 BRP1YGL007W 378 nt2.7□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 TRA1YHR099W 11235 nt2.7□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.7□□□□□ -1.98
LSO1Q3E827 DGR2YKL121W 2559 nt2.7□□□□□ -1.98
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