Protein–RNA interactions for Protein: Q13595

TRA2A, Transformer-2 protein homolog alpha, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2AQ13595 NSD2-223ENST00000513726 648 ntTSL 311.13□□□□□ -0.632e-9■□□□□ 9.7
TRA2AQ13595 CBFA2T3-204ENST00000563640 664 ntTSL 215.41■□□□□ 0.061e-6■□□□□ 9.7
TRA2AQ13595 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.451e-6■□□□□ 9.7
TRA2AQ13595 CHD2-225ENST00000636861 146 ntTSL 53.59□□□□□ -1.833e-13■□□□□ 9.7
TRA2AQ13595 DNAJB1-207ENST00000596853 593 ntTSL 417.1■□□□□ 0.336e-13■□□□□ 9.7
TRA2AQ13595 DNAJB1-203ENST00000594099 995 ntTSL 416.29■□□□□ 0.26e-13■□□□□ 9.7
TRA2AQ13595 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.366e-13■□□□□ 9.7
TRA2AQ13595 DNAJB1-202ENST00000396969 1287 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.066e-13■□□□□ 9.7
TRA2AQ13595 DNAJB1-205ENST00000595992 601 ntTSL 24.96□□□□□ -1.626e-13■□□□□ 9.7
TRA2AQ13595 SLC6A8-203ENST00000429147 334 ntTSL 216.35■□□□□ 0.211e-6■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.031e-6■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 SLC6A8-208ENST00000467402 308 ntTSL 511.86□□□□□ -0.511e-6■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 EIF1AX-202ENST00000379607 4427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.021e-6■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.124e-10■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 SF1-221ENST00000633899 591 ntTSL 420.44■□□□□ 0.864e-10■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 SF1-213ENST00000472725 632 ntTSL 319.42■□□□□ 0.74e-10■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 SF1-212ENST00000463343 983 ntTSL 217.2■□□□□ 0.344e-10■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 SF1-207ENST00000413951 623 ntTSL 216.64■□□□□ 0.254e-10■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 SF1-215ENST00000482693 755 ntTSL 216.31■□□□□ 0.24e-10■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 SF1-208ENST00000432725 475 ntTSL 415.22■□□□□ 0.034e-10■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.054e-7■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 RIT1-203ENST00000461050 803 ntTSL 512.99□□□□□ -0.334e-7■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 POLE-201ENST00000320574 7840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.664e-7■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 POLE-207ENST00000535270 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.74e-7■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 RIT1-202ENST00000368323 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.874e-7■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 POLE-210ENST00000537064 8011 ntTSL 1 (best)9.25□□□□□ -0.934e-7■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 RIT1-201ENST00000368322 855 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.094e-7■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 RPL7A-203ENST00000426651 1057 ntTSL 519.6■□□□□ 0.731e-323■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 RPL7A-206ENST00000485706 743 ntTSL 211.7□□□□□ -0.541e-323■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC1□□□□□ -2.251e-323■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.222e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.222e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 EPB41L2-207ENST00000456097 1138 ntTSL 511.23□□□□□ -0.612e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 EPB41L2-210ENST00000525198 981 ntTSL 511.11□□□□□ -0.632e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 SAT1-209ENST00000489394 1135 ntTSL 211.06□□□□□ -0.642e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 EPB41L2-217ENST00000527423 962 ntTSL 410.22□□□□□ -0.772e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 EPB41L2-208ENST00000524581 3090 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.892e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 EPB41L2-215ENST00000527017 727 ntTSL 59.19□□□□□ -0.942e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 SAT1-208ENST00000487713 432 ntTSL 29.12□□□□□ -0.952e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 EPB41L2-230ENST00000533912 514 ntTSL 58.34□□□□□ -1.072e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 EPB41L2-228ENST00000531410 2926 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.22e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 SAT1-206ENST00000463236 735 ntTSL 35.96□□□□□ -1.462e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.562e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 AFDN-209ENST00000400825 963 ntTSL 528.27■■■□□ 2.124e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 AFDN-208ENST00000400824 875 ntTSL 526.27■■□□□ 1.84e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.414e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.24e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.654e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 UBA2-204ENST00000588585 171 ntTSL 30.48□□□□□ -2.334e-9■□□□□ 9.6
TRA2AQ13595 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.377e-8■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SAE1-211ENST00000600753 483 ntTSL 421.14■□□□□ 0.977e-8■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.587e-8■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.467e-8■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SAE1-208ENST00000597808 570 ntTSL 217.5■□□□□ 0.397e-8■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SAE1-204ENST00000414294 2211 ntTSL 217.41■□□□□ 0.387e-8■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SAE1-207ENST00000596995 2106 ntTSL 217.2■□□□□ 0.347e-8■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SAE1-205ENST00000594144 723 ntTSL 315.06■□□□□ 07e-8■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -07e-8■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.187e-8■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SAE1-206ENST00000594526 709 ntTSL 312.96□□□□□ -0.337e-8■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SAE1-210ENST00000600706 744 ntTSL 59.46□□□□□ -0.97e-8■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 ALB-203ENST00000415165 1483 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.31e-27■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.51e-27■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.541e-27■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 ALB-208ENST00000495173 445 ntTSL 35.34□□□□□ -1.551e-27■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 ALB-211ENST00000505649 1509 ntTSL 55.27□□□□□ -1.571e-27■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.611e-27■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 ALB-205ENST00000476441 1604 ntTSL 55.02□□□□□ -1.611e-27■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 ALB-216ENST00000511370 1519 ntTSL 55.02□□□□□ -1.611e-27■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.641e-27■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.661e-27■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.661e-27■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 ALB-213ENST00000508932 369 ntTSL 30.78□□□□□ -2.281e-27■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 TFPI-206ENST00000420747 685 ntTSL 37.22□□□□□ -1.256e-8■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SLTM-225ENST00000560695 594 ntTSL 26.35□□□□□ -1.396e-7■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SLTM-211ENST00000557791 334 ntTSL 35.45□□□□□ -1.546e-7■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 HSP90B1-202ENST00000540297 590 ntTSL 319.44■□□□□ 0.72e-23■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 HSP90B1-205ENST00000549334 581 ntTSL 417.09■□□□□ 0.332e-23■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 RPL7A-209ENST00000496554 947 ntTSL 217.74■□□□□ 0.431e-37■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.984e-10■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SNX5-204ENST00000431277 840 ntTSL 515.65■□□□□ 0.14e-10■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SNX5-203ENST00000419004 778 ntTSL 514.58□□□□□ -0.084e-10■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SNX5-214ENST00000490175 2025 ntTSL 1 (best)14.55□□□□□ -0.084e-10■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.194e-10■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SNX5-208ENST00000475716 715 ntTSL 310.02□□□□□ -0.814e-10■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SNX5-211ENST00000483485 3087 ntTSL 26.81□□□□□ -1.324e-10■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SNX5-216ENST00000494401 656 ntTSL 54.6□□□□□ -1.674e-10■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SNX5-207ENST00000474883 695 ntTSL 53.54□□□□□ -1.844e-10■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 SNX5-209ENST00000476648 950 ntTSL 33.03□□□□□ -1.924e-10■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 ABCC2-201ENST00000370434 1714 ntTSL 2 BASIC8.35□□□□□ -1.074e-14■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 RPL41-201ENST00000358888 551 ntTSL 310.06□□□□□ -0.81e-7■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 RPL41-206ENST00000552314 595 ntTSL 29.14□□□□□ -0.951e-7■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 RPL41-204ENST00000546591 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.11e-7■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 RPL41-202ENST00000501597 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.281e-7■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 RPL41-203ENST00000546485 335 ntTSL 26.27□□□□□ -1.411e-7■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 RPL41-205ENST00000546654 238 ntTSL 25.8□□□□□ -1.481e-7■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.41■■□□□ 1.662e-37■□□□□ 9.5
TRA2AQ13595 DANCR-203ENST00000441504 336 ntTSL 217.42■□□□□ 0.382e-37■□□□□ 9.5
Retrieved 100 of 7,337 protein–RNA pairs in 196 ms