Protein–RNA interactions for Protein: Q12490

TY1B-BL, Transposon Ty1-BL Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BLQ12490 PFS1YHR185C 714 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt-0.03□□□□□ -2.41
TY1B-BLQ12490 YDR114CYDR114C 303 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 SWI5YDR146C 2130 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 YDL068WYDL068W 330 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 RPL35AYDL191W 363 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 SPO11YHL022C 1197 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 MMS4YBR098W 2076 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 HAL9YOL089C 3093 nt-0.04□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 YNL067W-AYNL067W-A 147 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 RPB10YOR210W 213 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 snR24snR24 89 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 SLD3YGL113W 2007 nt-0.05□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 RPL26BYGR034W 384 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 THG1YGR024C 714 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 TIM8YJR135W-A 264 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 PET20YPL159C 762 nt-0.06□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 PET111YMR257C 2403 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 YGL042CYGL042C 306 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 BIG1YHR101C 1008 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 YJL007CYJL007C 315 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 YOL118CYOL118C 309 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 NUP82YJL061W 2142 nt-0.07□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 HNT1YDL125C 477 nt-0.08□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 YER158W-AYER158W-A 216 nt-0.08□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 RPL37AYLR185W 267 nt-0.08□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 snR190snR190 190 nt-0.08□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 NIP100YPL174C 2607 nt-0.08□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 snR57snR57 88 nt-0.09□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 SBH1YER087C-B 249 nt-0.09□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 YGR042WYGR042W 816 nt-0.09□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 UPS1YLR193C 528 nt-0.09□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 YOR169CYOR169C 465 nt-0.09□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 YPR153WYPR153W 423 nt-0.09□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 VMA21YGR105W 234 nt-0.09□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 LCD1YDR499W 2244 nt-0.09□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 NOP9YJL010C 2001 nt-0.09□□□□□ -2.42
TY1B-BLQ12490 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt-0.1□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 PMP1YCR024C-A 123 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 SRP14YDL092W 441 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 snR84snR84 550 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 CMS1YLR003C 876 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 RRT1YBL048W 312 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 YPR170CYPR170C 336 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 YPL080CYPL080C 327 nt-0.11□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 REF2YDR195W 1602 nt-0.12□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 SSS1YDR086C 243 nt-0.12□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 RCN2YOR220W 798 nt-0.12□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 ZIP1YDR285W 2628 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 RPC10YHR143W-A 213 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 YLR232WYLR232W 348 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 ENV11YGR071C 2583 nt-0.13□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 NTF2YER009W 378 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 RSM18YER050C 417 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 RPL29YFR032C-A 180 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 POP6YGR030C 477 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 COX12YLR038C 252 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 YOP1YPR028W 543 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 GPG1YGL121C 381 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 ARV1YLR242C 966 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 YLR252WYLR252W 306 nt-0.14□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 KAR1YNL188W 1302 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 YBR184WYBR184W 1572 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 YGR164WYGR164W 336 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 GSP1YLR293C 660 nt-0.15□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 PRP5YBR237W 2550 nt-0.16□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 PRP42YDR235W 1635 nt-0.16□□□□□ -2.43
TY1B-BLQ12490 SPO23YBR250W 1572 nt-0.16□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 YDL152WYDL152W 366 nt-0.17□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 VPS63YLR261C 327 nt-0.17□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt-0.17□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 TIM10YHR005C-A 282 nt-0.17□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 IPI3YNL182C 1668 nt-0.17□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt-0.18□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 YOR186C-AYOR186C-A 210 nt-0.18□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 ATP20YPR020W 348 nt-0.18□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt-0.19□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 COX3Q0275 810 nt-0.19□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 HOT13YKL084W 351 nt-0.19□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 RPL26AYLR344W 384 nt-0.19□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 YGL258W-AYGL258W-A 234 nt-0.19□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 RCO1YMR075W 2055 nt-0.19□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 TFB5YDR079C-A 219 nt-0.2□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 SUS1YBR111W-A 291 nt-0.2□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 YHL042WYHL042W 453 nt-0.21□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 PRP21YJL203W 843 nt-0.21□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt-0.21□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 LEE1YPL054W 906 nt-0.21□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 FYV10YIL097W 1551 nt-0.21□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 YPR099CYPR099C 357 nt-0.22□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 YHL009W-BYHL009W-B 5409 nt-0.22□□□□□ -2.44
TY1B-BLQ12490 YCL002CYCL002C 792 nt-0.22□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt-0.23□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 snR46snR46 197 nt-0.23□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt-0.23□□□□□ -2.45
TY1B-BLQ12490 LSO2YGR169C-A 279 nt-0.24□□□□□ -2.45
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