Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 YJL022WYJL022W 309 nt1.32□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 YLR140WYLR140W 327 nt1.32□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 YNL114CYNL114C 372 nt1.32□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.32□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 ALK1YGL021W 2283 nt1.32□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 KAP122YGL016W 3246 nt1.32□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 MSH5YDL154W 2706 nt1.31□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 SPO23YBR250W 1572 nt1.31□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 YJL015CYJL015C 285 nt1.31□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 COF1YLL050C 432 nt1.31□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 PAU18YLL064C 363 nt1.31□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 HCH1YNL281W 462 nt1.31□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 PAU6YNR076W 363 nt1.31□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 YPL182CYPL182C 384 nt1.31□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 YBP1YBR216C 2025 nt1.31□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 EST2YLR318W 2655 nt1.3□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 YDR157WYDR157W 402 nt1.3□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.3□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 EMC5YIL027C 426 nt1.3□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 VPS55YJR044C 423 nt1.3□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 YAR047CYAR047C 321 nt1.3□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 YOR053WYOR053W 342 nt1.3□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 YPL185WYPL185W 396 nt1.3□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 SWI5YDR146C 2130 nt1.3□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 POL5YEL055C 3069 nt1.29□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 SEC21YNL287W 2808 nt1.29□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 YDL011CYDL011C 324 nt1.29□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 YDR008CYDR008C 351 nt1.29□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 MLH3YPL164C 2148 nt1.29□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 TIM13YGR181W 318 nt1.28□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 RPS27AYKL156W 249 nt1.28□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 RPL26AYLR344W 384 nt1.28□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 PCF11YDR228C 1881 nt1.28□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 HDA3YPR179C 1968 nt1.28□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 DCP2YNL118C 2913 nt1.28□□□□□ -2.2
PRP46Q12417 DGR2YKL121W 2559 nt1.27□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 CCH1YGR217W 6120 nt1.27□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 MVP1YMR004W 1536 nt1.27□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 YAP6YDR259C 1152 nt1.27□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.27□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 RPL9BYNL067W 576 nt1.27□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 MSN5YDR335W 3675 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 YKL083WYKL083W 615 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 BSC3YLR465C 309 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 YOR376WYOR376W 369 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 UFD2YDL190C 2886 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 ZRG17YNR039C 1818 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 HKR1YDR420W 5409 nt1.26□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 CDC25YLR310C 4770 nt1.25□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 PXA2YKL188C 2562 nt1.25□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 SRP14YDL092W 441 nt1.25□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.25□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 AZF1YOR113W 2745 nt1.24□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 PET127YOR017W 2403 nt1.24□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.24□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.24□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.24□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 ISF1YMR081C 1017 nt1.24□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 SEC5YDR166C 2916 nt1.24□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 YOP1YPR028W 543 nt1.23□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt1.23□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 MEC1YBR136W 7107 nt1.23□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 SMC4YLR086W 4257 nt1.23□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 AIM9YER080W 1884 nt1.22□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 RSM22YKL155C 1887 nt1.22□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 RPL40BYKR094C 387 nt1.22□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 RRT15YLR162W-A 189 nt1.22□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 LYS14YDR034C 2373 nt1.22□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 FYV8YGR196C 2454 nt1.22□□□□□ -2.21
PRP46Q12417 CYC7YEL039C 342 nt1.21□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 YHL041WYHL041W 450 nt1.21□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.21□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 YPL229WYPL229W 621 nt1.21□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 SWI6YLR182W 2412 nt1.21□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 ZIP1YDR285W 2628 nt1.2□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 MUK1YPL070W 1839 nt1.2□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 EFR3YMR212C 2349 nt1.2□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 RTR1YER139C 681 nt1.2□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.2□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.2□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 YLR334CYLR334C 381 nt1.2□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 YML003WYML003W 873 nt1.2□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.2□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 TIM18YOR297C 579 nt1.2□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 PIK1YNL267W 3201 nt1.2□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 RAD50YNL250W 3939 nt1.19□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 ATG31YDR022C 591 nt1.19□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 YIL059CYIL059C 366 nt1.19□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 HIT1YJR055W 495 nt1.19□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 YOR121CYOR121C 306 nt1.19□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 SGO1YOR073W 1773 nt1.19□□□□□ -2.22
PRP46Q12417 YGR130CYGR130C 2451 nt1.18□□□□□ -2.22
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