Protein–RNA interactions for Protein: Q12383

TRM13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13, yeastyeast

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Length 476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM13Q12383 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 SGM1YJR134C 2124 nt2.36□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 RPO41YFL036W 4056 nt2.35□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 snR72snR72 98 nt2.35□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 ACB1YGR037C 264 nt2.35□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 SEC26YDR238C 2922 nt2.35□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 SLM1YIL105C 2061 nt2.35□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 MSC6YOR354C 2079 nt2.35□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 HOS4YIL112W 3252 nt2.34□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 YBL012CYBL012C 402 nt2.34□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 AMS1YGL156W 3252 nt2.34□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 ORC2YBR060C 1863 nt2.34□□□□□ -2.03
TRM13Q12383 ISW1YBR245C 3390 nt2.33□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 PTP3YER075C 2787 nt2.33□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 SMY2YBR172C 2223 nt2.33□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 YME2YMR302C 2553 nt2.33□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt2.33□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 RPL23BYER117W 414 nt2.33□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 YGR050CYGR050C 357 nt2.33□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 EMC6YLL014W 327 nt2.33□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 NFT1YKR103W 3657 nt2.33□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 VTC3YPL019C 2508 nt2.33□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 SIR3YLR442C 2937 nt2.33□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 RGA2YDR379W 3030 nt2.33□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 GIS1YDR096W 2685 nt2.33□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 MPT5YGL178W 2580 nt2.32□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 TCB2YNL087W 3537 nt2.32□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 SET2YJL168C 2202 nt2.32□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 SRP14YDL092W 441 nt2.32□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.32□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.32□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.32□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.32□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.32□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.32□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.32□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.32□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.32□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.32□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.32□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 PSD2YGR170W 3417 nt2.32□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 YKU80YMR106C 1890 nt2.32□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 YLL007CYLL007C 1998 nt2.32□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 PRP42YDR235W 1635 nt2.31□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 YFR016CYFR016C 3702 nt2.31□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 YIR044CYIR044C 186 nt2.31□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 TOP2YNL088W 4287 nt2.31□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 IRR1YIL026C 3453 nt2.31□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 TRA1YHR099W 11235 nt2.3□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 LYS14YDR034C 2373 nt2.3□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 STB4YMR019W 2850 nt2.3□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 SPO22YIL073C 2928 nt2.29□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 RPL33BYOR234C 324 nt2.29□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 SPF1YEL031W 3648 nt2.29□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 INP51YIL002C 2841 nt2.29□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 ARP8YOR141C 2646 nt2.29□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 MGM1YOR211C 2646 nt2.29□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 YNL018CYNL018C 1839 nt2.28□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 NIP100YPL174C 2607 nt2.28□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 CDC53YDL132W 2448 nt2.28□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 PAU10YDR542W 363 nt2.28□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 PAU11YGL261C 363 nt2.28□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 PAU4YLR461W 363 nt2.28□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 TOR1YJR066W 7413 nt2.28□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 YIL080WYIL080W 4722 nt2.28□□□□□ -2.04
TRM13Q12383 VMR1YHL035C 4779 nt2.27□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 NCA2YPR155C 1851 nt2.27□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 DCP2YNL118C 2913 nt2.27□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.27□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 YBL053WYBL053W 375 nt2.27□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 YBR174CYBR174C 315 nt2.27□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 SPC98YNL126W 2541 nt2.27□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 SMC6YLR383W 3345 nt2.27□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 MLH1YMR167W 2310 nt2.26□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 YPL150WYPL150W 2706 nt2.26□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 BUB1YGR188C 3066 nt2.26□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 ZRG17YNR039C 1818 nt2.26□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 TFC8YPL007C 1767 nt2.26□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.26□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 RPL34BYIL052C 366 nt2.26□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 YOR345CYOR345C 351 nt2.26□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 PMP1YCR024C-A 123 nt2.25□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 YCR043CYCR043C 384 nt2.25□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 PUT3YKL015W 2940 nt2.24□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 SAS3YBL052C 2496 nt2.24□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 MNE1YOR350C 1992 nt2.24□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 RPS25BYLR333C 327 nt2.24□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 KTI11YBL071W-A 249 nt2.24□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.24□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 CBF2YGR140W 2871 nt2.24□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 CSF1YLR087C 8877 nt2.24□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 YHR210CYHR210C 1026 nt2.23□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 ZIP1YDR285W 2628 nt2.23□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 VPS13YLL040C 9435 nt2.23□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 RLM1YPL089C 2031 nt2.23□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 SPO75YLL005C 2607 nt2.22□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 PDR1YGL013C 3207 nt2.22□□□□□ -2.05
TRM13Q12383 SPO21YOL091W 1830 nt2.22□□□□□ -2.05
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