Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 PXA2YKL188C 2562 nt1.19□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 LYS14YDR034C 2373 nt1.19□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 RAD9YDR217C 3930 nt1.19□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 ENV11YGR071C 2583 nt1.18□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 MLH3YPL164C 2148 nt1.18□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 YJL015CYJL015C 285 nt1.18□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 RUF22RUF22 515 nt1.18□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 YOR376WYOR376W 369 nt1.18□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 YSY6YBR162W-A 198 nt1.18□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 MKT1YNL085W 2493 nt1.17□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 SRP14YDL092W 441 nt1.17□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 YGL217CYGL217C 342 nt1.17□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.17□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 YLR171WYLR171W 390 nt1.17□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 ATP19YOL077W-A 207 nt1.16□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 CDC33YOL139C 642 nt1.16□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 TIM18YOR297C 579 nt1.16□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 NUP188YML103C 4968 nt1.16□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 PIG1YLR273C 1947 nt1.15□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.15□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 RTR1YER139C 681 nt1.15□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.15□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 RRT15YLR162W-A 189 nt1.15□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 YML003WYML003W 873 nt1.15□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 ZIP1YDR285W 2628 nt1.15□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 SLX4YLR135W 2247 nt1.14□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 YDR114CYDR114C 303 nt1.14□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.14□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.14□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.14□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt1.14□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 ZEO1YOL109W 342 nt1.14□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.14□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 PIP2YOR363C 2991 nt1.14□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 snR54snR54 86 nt1.14□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.14□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 AZF1YOR113W 2745 nt1.14□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 RAD50YNL250W 3939 nt1.14□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 CDC39YCR093W 6327 nt1.14□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 SIP4YJL089W 2490 nt1.13□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 SPT7YBR081C 3999 nt1.13□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 YDL211CYDL211C 1119 nt1.13□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.13□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 PHS1YJL097W 654 nt1.13□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 ERP4YOR016C 624 nt1.13□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 YPL182CYPL182C 384 nt1.13□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 SGO1YOR073W 1773 nt1.13□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 GDS1YOR355W 1569 nt1.13□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 TTI1YKL033W 3117 nt1.12□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 WIP1YDR374W-A 270 nt1.12□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.12□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 snR14snR14 160 nt1.12□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 SWI4YER111C 3282 nt1.12□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 VPS54YDR027C 2670 nt1.11□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.11□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 YER076W-AYER076W-A 348 nt1.11□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 UBC7YMR022W 498 nt1.11□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 ECL1YGR146C 636 nt1.1□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 TOM22YNL131W 459 nt1.1□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 YPR063CYPR063C 423 nt1.1□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 RFX1YLR176C 2436 nt1.1□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 YLL032CYLL032C 2478 nt1.09□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 APL3YBL037W 3078 nt1.09□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 APL2YKL135C 2181 nt1.09□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 YLR101CYLR101C 396 nt1.09□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 GAL7YBR018C 1101 nt1.09□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 NUT2YPR168W 474 nt1.09□□□□□ -2.23
RRP42Q12277 ROM2YLR371W 4071 nt1.09□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 YLL020CYLL020C 306 nt1.08□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.08□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 RPL9BYNL067W 576 nt1.08□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 YBL071CYBL071C 309 nt1.08□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 SEC5YDR166C 2916 nt1.08□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 MUK1YPL070W 1839 nt1.08□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 STB6YKL072W 2301 nt1.07□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 APL1YJR005W 2103 nt1.07□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 EAF1YDR359C 2949 nt1.07□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 YDR269CYDR269C 324 nt1.07□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 RTT102YGR275W 474 nt1.07□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 NST1YNL091W 3723 nt1.07□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 SWI6YLR182W 2412 nt1.07□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 NOC3YLR002C 1992 nt1.07□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 ALY2YJL084C 3141 nt1.06□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 YDL011CYDL011C 324 nt1.06□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 MRPL31YKL138C 396 nt1.06□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 YLR287CYLR287C 1068 nt1.06□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 snR41snR41 95 nt1.06□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 SPT21YMR179W 2277 nt1.06□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 DIE2YGR227W 1578 nt1.05□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 CBS1YDL069C 690 nt1.05□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 TIM13YGR181W 318 nt1.05□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 YIL059CYIL059C 366 nt1.05□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 YLL054CYLL054C 2532 nt1.05□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 CLU1YMR012W 3834 nt1.04□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 CYC7YEL039C 342 nt1.04□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.03□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.03□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.03□□□□□ -2.24
RRP42Q12277 YAR009CYAR009C 3591 nt1.03□□□□□ -2.25
RRP42Q12277 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.02□□□□□ -2.25
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