Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 YFH1YDL120W 525 nt2.1□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 SPG3YDR504C 384 nt2.1□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 ALG13YGL047W 609 nt2.1□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 YHL042WYHL042W 453 nt2.1□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.1□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 DGR1YNL130C-A 147 nt2.1□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 RAD61YDR014W 1944 nt2.1□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 CFT2YLR115W 2580 nt2.1□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 YPR097WYPR097W 3222 nt2.1□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 TOR2YKL203C 7425 nt2.1□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 RPH1YER169W 2391 nt2.09□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 MNE1YOR350C 1992 nt2.09□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 YCR043CYCR043C 384 nt2.09□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt2.09□□□□□ -2.07
LCB4Q12246 MCD1YDL003W 1701 nt2.08□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 YGR250CYGR250C 2346 nt2.08□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 BRE1YDL074C 2103 nt2.08□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 NOP14YDL148C 2433 nt2.07□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 snR60snR60 104 nt2.07□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.07□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.07□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 YPR063CYPR063C 423 nt2.07□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 NEO1YIL048W 3456 nt2.07□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 SEC16YPL085W 6588 nt2.07□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 MET18YIL128W 3099 nt2.07□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 COG8YML071C 1824 nt2.07□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 CHC1YGL206C 4962 nt2.07□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 MUK1YPL070W 1839 nt2.06□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.06□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.06□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 RPB10YOR210W 213 nt2.06□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 SPP41YDR464W 4308 nt2.05□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 IRR1YIL026C 3453 nt2.05□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.05□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 snR80snR80 171 nt2.05□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 TIM9YEL020W-A 264 nt2.05□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 YJL135WYJL135W 318 nt2.05□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.05□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 PAU18YLL064C 363 nt2.05□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 JLP2YMR132C 627 nt2.05□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 PAU6YNR076W 363 nt2.05□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 snR49snR49 165 nt2.05□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.05□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 MVP1YMR004W 1536 nt2.05□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 RFX1YLR176C 2436 nt2.05□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 SLY1YDR189W 2001 nt2.04□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.04□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 TRL1YJL087C 2484 nt2.04□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 TRX1YLR043C 312 nt2.04□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 INP2YMR163C 2118 nt2.03□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 YCL046WYCL046W 324 nt2.03□□□□□ -2.08
LCB4Q12246 YDR341CYDR341C 1824 nt2.03□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 KIP1YBL063W 3336 nt2.02□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 CDC60YPL160W 3273 nt2.02□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 ARP7YPR034W 1434 nt2.02□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 RGA1YOR127W 3024 nt2.02□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 LYS14YDR034C 2373 nt2.01□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 TFC8YPL007C 1767 nt2.01□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 PLC1YPL268W 2610 nt2.01□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 YGL041CYGL041C 204 nt2.01□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 SDH2YLL041C 801 nt2.01□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 CYB5YNL111C 363 nt2.01□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 MMS22YLR320W 4365 nt2.01□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 UBP2YOR124C 3819 nt2□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 HCS1YKL017C 2052 nt2□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 SCW11YGL028C 1629 nt2□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 ANS1YHR126C 480 nt2□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 YBR064WYBR064W 429 nt2□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 snR72snR72 98 nt1.99□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 CDC36YDL165W 576 nt1.99□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt1.99□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.99□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt1.99□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 KOG1YHR186C 4674 nt1.99□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 VPS8YAL002W 3825 nt1.98□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 NAM7YMR080C 2916 nt1.98□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 PET309YLR067C 2898 nt1.98□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 SSS1YDR086C 243 nt1.98□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 ABF2YMR072W 552 nt1.98□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 ZRG17YNR039C 1818 nt1.98□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 LCD1YDR499W 2244 nt1.98□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 SYH1YPL105C 2550 nt1.98□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 YMR045CYMR045C 5268 nt1.97□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 DCP2YNL118C 2913 nt1.97□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.97□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 RPL37BYDR500C 267 nt1.97□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt1.97□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 BLI1YKL061W 342 nt1.97□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 YNL028WYNL028W 318 nt1.97□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 YOR093CYOR093C 4947 nt1.97□□□□□ -2.09
LCB4Q12246 USO1YDL058W 5373 nt1.96□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 SPT21YMR179W 2277 nt1.96□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 CSE2YNR010W 450 nt1.96□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 RTT101YJL047C 2529 nt1.96□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 HSL1YKL101W 4557 nt1.96□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 HER1YOR227W 3741 nt1.96□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 YLL032CYLL032C 2478 nt1.95□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 snR55snR55 98 nt1.95□□□□□ -2.1
LCB4Q12246 ZIP1YDR285W 2628 nt1.95□□□□□ -2.1
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