Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 YOP1YPR028W 543 nt0.94□□□□□ -2.26
USB1Q12208 SLX4YLR135W 2247 nt0.93□□□□□ -2.26
USB1Q12208 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt0.93□□□□□ -2.26
USB1Q12208 EAF6YJR082C 342 nt0.93□□□□□ -2.26
USB1Q12208 YLL020CYLL020C 306 nt0.93□□□□□ -2.26
USB1Q12208 HCH1YNL281W 462 nt0.93□□□□□ -2.26
USB1Q12208 VAM6YDL077C 3150 nt0.92□□□□□ -2.26
USB1Q12208 YDR008CYDR008C 351 nt0.92□□□□□ -2.26
USB1Q12208 YGR290WYGR290W 444 nt0.92□□□□□ -2.26
USB1Q12208 RPL34BYIL052C 366 nt0.92□□□□□ -2.26
USB1Q12208 PBI2YNL015W 228 nt0.92□□□□□ -2.26
USB1Q12208 SGO1YOR073W 1773 nt0.92□□□□□ -2.26
USB1Q12208 FYV7YLR068W 456 nt0.91□□□□□ -2.26
USB1Q12208 RPL9BYNL067W 576 nt0.91□□□□□ -2.26
USB1Q12208 RPL32YBL092W 393 nt0.91□□□□□ -2.26
USB1Q12208 GDS1YOR355W 1569 nt0.91□□□□□ -2.26
USB1Q12208 BUD3YCL014W 4911 nt0.91□□□□□ -2.26
USB1Q12208 VPS54YDR027C 2670 nt0.91□□□□□ -2.26
USB1Q12208 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.9□□□□□ -2.27
USB1Q12208 YCR001WYCR001W 315 nt0.9□□□□□ -2.27
USB1Q12208 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.9□□□□□ -2.27
USB1Q12208 MXR1YER042W 555 nt0.9□□□□□ -2.27
USB1Q12208 RTR1YER139C 681 nt0.9□□□□□ -2.27
USB1Q12208 BIG1YHR101C 1008 nt0.9□□□□□ -2.27
USB1Q12208 NFU1YKL040C 771 nt0.9□□□□□ -2.27
USB1Q12208 AIM29YKR074W 468 nt0.9□□□□□ -2.27
USB1Q12208 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.9□□□□□ -2.27
USB1Q12208 TOF2YKR010C 2316 nt0.9□□□□□ -2.27
USB1Q12208 MKT1YNL085W 2493 nt0.9□□□□□ -2.27
USB1Q12208 CDC39YCR093W 6327 nt0.89□□□□□ -2.27
USB1Q12208 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.89□□□□□ -2.27
USB1Q12208 URM1YIL008W 300 nt0.89□□□□□ -2.27
USB1Q12208 PHS1YJL097W 654 nt0.89□□□□□ -2.27
USB1Q12208 PXA2YKL188C 2562 nt0.89□□□□□ -2.27
USB1Q12208 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.88□□□□□ -2.27
USB1Q12208 YNL303WYNL303W 348 nt0.88□□□□□ -2.27
USB1Q12208 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt0.88□□□□□ -2.27
USB1Q12208 ZIP1YDR285W 2628 nt0.88□□□□□ -2.27
USB1Q12208 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.88□□□□□ -2.27
USB1Q12208 SWI4YER111C 3282 nt0.88□□□□□ -2.27
USB1Q12208 SPO23YBR250W 1572 nt0.87□□□□□ -2.27
USB1Q12208 APL2YKL135C 2181 nt0.87□□□□□ -2.27
USB1Q12208 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.87□□□□□ -2.27
USB1Q12208 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.87□□□□□ -2.27
USB1Q12208 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
USB1Q12208 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.87□□□□□ -2.27
USB1Q12208 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.87□□□□□ -2.27
USB1Q12208 YGR045CYGR045C 363 nt0.87□□□□□ -2.27
USB1Q12208 YML108WYML108W 318 nt0.87□□□□□ -2.27
USB1Q12208 PIP2YOR363C 2991 nt0.87□□□□□ -2.27
USB1Q12208 LYS14YDR034C 2373 nt0.86□□□□□ -2.27
USB1Q12208 NUP145YGL092W 3954 nt0.86□□□□□ -2.27
USB1Q12208 SDH2YLL041C 801 nt0.86□□□□□ -2.27
USB1Q12208 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.86□□□□□ -2.27
USB1Q12208 RUF22RUF22 515 nt0.86□□□□□ -2.27
USB1Q12208 NUT2YPR168W 474 nt0.86□□□□□ -2.27
USB1Q12208 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.85□□□□□ -2.27
USB1Q12208 EAF1YDR359C 2949 nt0.85□□□□□ -2.27
USB1Q12208 NBL1YHR199C-A 222 nt0.85□□□□□ -2.27
USB1Q12208 RPL16AYIL133C 600 nt0.85□□□□□ -2.27
USB1Q12208 SPT21YMR179W 2277 nt0.84□□□□□ -2.27
USB1Q12208 YGL239CYGL239C 315 nt0.84□□□□□ -2.27
USB1Q12208 STF2YGR008C 255 nt0.84□□□□□ -2.27
USB1Q12208 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.84□□□□□ -2.27
USB1Q12208 YNL122CYNL122C 348 nt0.84□□□□□ -2.27
USB1Q12208 TOM22YNL131W 459 nt0.84□□□□□ -2.27
USB1Q12208 snR189snR189 189 nt0.84□□□□□ -2.27
USB1Q12208 SCC2YDR180W 4482 nt0.84□□□□□ -2.28
USB1Q12208 PIG1YLR273C 1947 nt0.83□□□□□ -2.28
USB1Q12208 WIP1YDR374W-A 270 nt0.83□□□□□ -2.28
USB1Q12208 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.83□□□□□ -2.28
USB1Q12208 PAM16YJL104W 450 nt0.83□□□□□ -2.28
USB1Q12208 HIT1YJR055W 495 nt0.83□□□□□ -2.28
USB1Q12208 HUG1YML058W-A 207 nt0.83□□□□□ -2.28
USB1Q12208 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.83□□□□□ -2.28
USB1Q12208 ROM2YLR371W 4071 nt0.83□□□□□ -2.28
USB1Q12208 YCS4YLR272C 3531 nt0.83□□□□□ -2.28
USB1Q12208 CYC7YEL039C 342 nt0.82□□□□□ -2.28
USB1Q12208 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.82□□□□□ -2.28
USB1Q12208 KAP120YPL125W 3099 nt0.81□□□□□ -2.28
USB1Q12208 AIM44YPL158C 2277 nt0.81□□□□□ -2.28
USB1Q12208 BI2Q0110 1272 nt0.81□□□□□ -2.28
USB1Q12208 MRPL31YKL138C 396 nt0.81□□□□□ -2.28
USB1Q12208 YOR029WYOR029W 336 nt0.81□□□□□ -2.28
USB1Q12208 IFH1YLR223C 3258 nt0.81□□□□□ -2.28
USB1Q12208 YLL032CYLL032C 2478 nt0.81□□□□□ -2.28
USB1Q12208 STB6YKL072W 2301 nt0.81□□□□□ -2.28
USB1Q12208 SLD3YGL113W 2007 nt0.81□□□□□ -2.28
USB1Q12208 APL3YBL037W 3078 nt0.8□□□□□ -2.28
USB1Q12208 NOC3YLR002C 1992 nt0.8□□□□□ -2.28
USB1Q12208 YDR114CYDR114C 303 nt0.8□□□□□ -2.28
USB1Q12208 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.8□□□□□ -2.28
USB1Q12208 ZEO1YOL109W 342 nt0.8□□□□□ -2.28
USB1Q12208 snR41snR41 95 nt0.8□□□□□ -2.28
USB1Q12208 BEM2YER155C 6504 nt0.8□□□□□ -2.28
USB1Q12208 RFX1YLR176C 2436 nt0.79□□□□□ -2.28
USB1Q12208 SAS3YBL052C 2496 nt0.79□□□□□ -2.28
USB1Q12208 SCW11YGL028C 1629 nt0.79□□□□□ -2.28
USB1Q12208 ENV11YGR071C 2583 nt0.79□□□□□ -2.28
USB1Q12208 YHR125WYHR125W 306 nt0.79□□□□□ -2.28
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