Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.55□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 YDR114CYDR114C 303 nt1.55□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 YPL185WYPL185W 396 nt1.55□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 SWI6YLR182W 2412 nt1.55□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 YBP1YBR216C 2025 nt1.54□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 RPS27AYKL156W 249 nt1.54□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 YML003WYML003W 873 nt1.54□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 ZIP1YDR285W 2628 nt1.54□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 MON2YNL297C 4911 nt1.54□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 MLH3YPL164C 2148 nt1.54□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 CHS1YNL192W 3396 nt1.53□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 AIM9YER080W 1884 nt1.53□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 POL5YEL055C 3069 nt1.53□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 ALK1YGL021W 2283 nt1.52□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 BST1YFL025C 3090 nt1.52□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 YER079WYER079W 633 nt1.52□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 VAR1Q0140 1197 nt1.52□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.52□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 VPS55YJR044C 423 nt1.52□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 NCA2YPR155C 1851 nt1.52□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 DGR2YKL121W 2559 nt1.52□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 YIL059CYIL059C 366 nt1.51□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 YJL022WYJL022W 309 nt1.51□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 RPL9BYNL067W 576 nt1.51□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 RFX1YLR176C 2436 nt1.5□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 YDR269CYDR269C 324 nt1.5□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 RPL40BYKR094C 387 nt1.5□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt1.5□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 CCH1YGR217W 6120 nt1.5□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 ENV11YGR071C 2583 nt1.5□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 PET127YOR017W 2403 nt1.49□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 NUT1YGL151W 3399 nt1.49□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 PIG1YLR273C 1947 nt1.49□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 YKL202WYKL202W 582 nt1.49□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 COF1YLL050C 432 nt1.49□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 YLR434CYLR434C 384 nt1.49□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 YOL159CYOL159C 516 nt1.49□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 YAR047CYAR047C 321 nt1.48□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 YPL229WYPL229W 621 nt1.48□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 EFR3YMR212C 2349 nt1.48□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 CLU1YMR012W 3834 nt1.47□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 YHR138CYHR138C 345 nt1.47□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 UFD2YDL190C 2886 nt1.47□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 SSK2YNR031C 4740 nt1.47□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 YLR419WYLR419W 4308 nt1.47□□□□□ -2.17
VPS54Q12071 FYV8YGR196C 2454 nt1.46□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 HKR1YDR420W 5409 nt1.46□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 SLY1YDR189W 2001 nt1.46□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 YAP6YDR259C 1152 nt1.46□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 PAU2YEL049W 363 nt1.46□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt1.46□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 YLL032CYLL032C 2478 nt1.46□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 MSN5YDR335W 3675 nt1.46□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 FIG2YCR089W 4830 nt1.45□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 SWF1YDR126W 1011 nt1.45□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 YOR053WYOR053W 342 nt1.45□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 MSH3YCR092C 3057 nt1.45□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 APL2YKL135C 2181 nt1.44□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.44□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 BSC3YLR465C 309 nt1.44□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.44□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 LEE1YPL054W 906 nt1.44□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 EST2YLR318W 2655 nt1.44□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 MVP1YMR004W 1536 nt1.44□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 CYC7YEL039C 342 nt1.43□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 YLR140WYLR140W 327 nt1.43□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 RPL26AYLR344W 384 nt1.43□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 ISF1YMR081C 1017 nt1.43□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 YOR376WYOR376W 369 nt1.43□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 YBR285WYBR285W 435 nt1.43□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 MUK1YPL070W 1839 nt1.43□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 SRP14YDL092W 441 nt1.42□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 YJL015CYJL015C 285 nt1.42□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 YKL083WYKL083W 615 nt1.42□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 MRPL31YKL138C 396 nt1.42□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 HCH1YNL281W 462 nt1.42□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 NUT2YPR168W 474 nt1.42□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 SEC21YNL287W 2808 nt1.41□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 TIM18YOR297C 579 nt1.41□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 PCF11YDR228C 1881 nt1.41□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 SAS3YBL052C 2496 nt1.41□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 TRM732YMR259C 4263 nt1.4□□□□□ -2.18
VPS54Q12071 NOC3YLR002C 1992 nt1.4□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 SGO1YOR073W 1773 nt1.4□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 YFL019CYFL019C 354 nt1.4□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 YGL217CYGL217C 342 nt1.4□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.4□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 YSY6YBR162W-A 198 nt1.4□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 RAD50YNL250W 3939 nt1.39□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.39□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 VPS54YDR027C 2670 nt1.39□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 LAA1YJL207C 6045 nt1.38□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 CDC25YLR310C 4770 nt1.38□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 SMC4YLR086W 4257 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.37□□□□□ -2.19
VPS54Q12071 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.37□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 49.5 ms