Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sdr16c6Q05A13 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sdr16c6Q05A13 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms