Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 YLR366WYLR366W 306 nt0.7□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 IPP1YBR011C 864 nt0.7□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 STO1YMR125W 2586 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 LYS14YDR034C 2373 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 GPM2YDL021W 936 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 NHP2YDL208W 471 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 BMT5YIL096C 1011 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 YBR032WYBR032W 303 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 YBR071WYBR071W 636 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 AIM44YPL158C 2277 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 ENV11YGR071C 2583 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.69□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 RIM20YOR275C 1986 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 SCW11YGL028C 1629 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 snR84snR84 550 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 NBL1YHR199C-A 222 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 YJL047C-AYJL047C-A 135 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 ECM9YKR004C 1134 nt0.68□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 SLD3YGL113W 2007 nt0.67□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 SWF1YDR126W 1011 nt0.67□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.67□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 SHE9YDR393W 1371 nt0.67□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 RKR1YMR247C 4689 nt0.67□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 FIG4YNL325C 2640 nt0.67□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 PXA2YKL188C 2562 nt0.66□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 OCA6YDR067C 675 nt0.66□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.66□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 YDR521WYDR521W 336 nt0.66□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 PDE2YOR360C 1581 nt0.66□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 SDH2YLL041C 801 nt0.65□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 CMC4YMR194C-B 222 nt0.65□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 SLM6YBR266C 453 nt0.65□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 YOR248WYOR248W 303 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 AFR1YDR085C 1863 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 SLY1YDR189W 2001 nt0.64□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.63□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 YLR252WYLR252W 306 nt0.63□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 GMC2YLR445W 567 nt0.63□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 APL2YKL135C 2181 nt0.63□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.62□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 UPS1YLR193C 528 nt0.62□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 IRC16YPR038W 360 nt0.62□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 Q0255Q0255 1419 nt0.62□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 SLX9YGR081C 633 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 SPO13YHR014W 876 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 TMA22YJR014W 597 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 YOL029CYOL029C 606 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 MMS4YBR098W 2076 nt0.61□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 LCD1YDR499W 2244 nt0.6□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 YER135CYER135C 393 nt0.6□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 PRP21YJL203W 843 nt0.6□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 YPR153WYPR153W 423 nt0.59□□□□□ -2.31
YMR226CQ05016 YLL032CYLL032C 2478 nt0.59□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 PPN1YDR452W 2025 nt0.59□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt0.58□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 YIL059CYIL059C 366 nt0.58□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.58□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 YIL029CYIL029C 429 nt0.57□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 YKL044WYKL044W 321 nt0.57□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 AFB1YLR040C 675 nt0.57□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 RRT1YBL048W 312 nt0.57□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 RPL32YBL092W 393 nt0.57□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 YDL016CYDL016C 303 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 HUR1YGL168W 333 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 PAM16YJL104W 450 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 YPR039WYPR039W 336 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 UTP10YJL109C 5310 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 SWI6YLR182W 2412 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 LTE1YAL024C 4308 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 UBP3YER151C 2739 nt0.56□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.55□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 ALG13YGL047W 609 nt0.55□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 YJR141WYJR141W 1044 nt0.55□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 RPL38YLR325C 237 nt0.55□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 WAR1YML076C 2835 nt0.55□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 MET32YDR253C 576 nt0.54□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 YGR042WYGR042W 816 nt0.54□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 VMA21YGR105W 234 nt0.54□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.54□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 MRPL31YKL138C 396 nt0.54□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 IES4YOR189W 351 nt0.54□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 DBP6YNR038W 1890 nt0.54□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 RFX1YLR176C 2436 nt0.53□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.53□□□□□ -2.32
YMR226CQ05016 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.53□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 124 ms