Protein–RNA interactions for Protein: Q04201

CUE4, CUE domain-containing protein CUE4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CUE4Q04201 MPT5YGL178W 2580 nt0.69□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 ENV11YGR071C 2583 nt0.69□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 YDR029WYDR029W 315 nt0.69□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 PAU24YBR301W 363 nt0.69□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 SET3YKR029C 2256 nt0.69□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 YPR117WYPR117W 7470 nt0.69□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 SEC3YER008C 4011 nt0.68□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 AIM9YER080W 1884 nt0.68□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 SLD3YGL113W 2007 nt0.68□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 YGR025WYGR025W 303 nt0.68□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 YGR045CYGR045C 363 nt0.68□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 KAP120YPL125W 3099 nt0.68□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 GUP1YGL084C 1683 nt0.68□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 NUP145YGL092W 3954 nt0.67□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 YDR114CYDR114C 303 nt0.67□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 CYC7YEL039C 342 nt0.67□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 NBL1YHR199C-A 222 nt0.67□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 YKL123WYKL123W 381 nt0.67□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.67□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 YBR012CYBR012C 420 nt0.67□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 snR13snR13 124 nt0.67□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 SCW11YGL028C 1629 nt0.67□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 SAS3YBL052C 2496 nt0.66□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 YDR250CYDR250C 276 nt0.66□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 YHL037CYHL037C 402 nt0.66□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 ILM1YJR118C 612 nt0.66□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 YLR255CYLR255C 354 nt0.66□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 RCN2YOR220W 798 nt0.66□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 YLL032CYLL032C 2478 nt0.65□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 STO1YMR125W 2586 nt0.65□□□□□ -2.3
CUE4Q04201 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt0.65□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt0.65□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt0.65□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt0.65□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 APQ13YJL075C 417 nt0.65□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.65□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.65□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 FIG4YNL325C 2640 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 YAP3YHL009C 993 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 RPL16AYIL133C 600 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 APL2YKL135C 2181 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 RKR1YMR247C 4689 nt0.64□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 PHS1YJL097W 654 nt0.63□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 MRPL31YKL138C 396 nt0.63□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 UPS1YLR193C 528 nt0.63□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.63□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 NUP157YER105C 4176 nt0.63□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 RFX1YLR176C 2436 nt0.63□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 YGR130CYGR130C 2451 nt0.62□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 YPP1YGR198W 2454 nt0.62□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.62□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.62□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 MET32YDR253C 576 nt0.62□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 YER076W-AYER076W-A 348 nt0.62□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 YGL239CYGL239C 315 nt0.62□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 TSC3YBR058C-A 243 nt0.62□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 YDL073WYDL073W 2955 nt0.62□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 SLY1YDR189W 2001 nt0.62□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 URM1YIL008W 300 nt0.61□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.61□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 YOR199WYOR199W 330 nt0.61□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 SWI6YLR182W 2412 nt0.61□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 LCD1YDR499W 2244 nt0.61□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 YDL206WYDL206W 2289 nt0.61□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 SEC1YDR164C 2175 nt0.6□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 YDL196WYDL196W 330 nt0.6□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 RPL9AYGL147C 576 nt0.6□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.6□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 RRT1YBL048W 312 nt0.6□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 GPI15YNL038W 690 nt0.6□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 YCL023CYCL023C 348 nt0.6□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 ALY2YJL084C 3141 nt0.6□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 IML1YJR138W 4755 nt0.6□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 AIM44YPL158C 2277 nt0.59□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 PDE2YOR360C 1581 nt0.59□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 MXR1YER042W 555 nt0.59□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 PRE4YFR050C 801 nt0.59□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 YLR269CYLR269C 351 nt0.59□□□□□ -2.31
CUE4Q04201 REV3YPL167C 4515 nt0.58□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 SWF1YDR126W 1011 nt0.58□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 YDR269CYDR269C 324 nt0.58□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 YGR042WYGR042W 816 nt0.58□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 NFU1YKL040C 771 nt0.58□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 YCR001WYCR001W 315 nt0.57□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 NHP2YDL208W 471 nt0.57□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 RPF1YHR088W 888 nt0.57□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 YIL059CYIL059C 366 nt0.57□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt0.57□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.57□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 YPR153WYPR153W 423 nt0.57□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 NPC2YDL046W 522 nt0.56□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt0.56□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 BIG1YHR101C 1008 nt0.56□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 MMS4YBR098W 2076 nt0.56□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 SLI15YBR156C 2097 nt0.55□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 YJR003CYJR003C 1560 nt0.55□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.55□□□□□ -2.32
CUE4Q04201 HCH1YNL281W 462 nt0.55□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 35.6 ms