Protein–RNA interactions for Protein: Q03530

RCE1, CAAX prenyl protease 2, yeastyeast

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RCE1Q03530 YBR032WYBR032W 303 nt0.75□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 SLM6YBR266C 453 nt0.75□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 SWI5YDR146C 2130 nt0.74□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 STB6YKL072W 2301 nt0.74□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 YDR029WYDR029W 315 nt0.74□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 RTR1YER139C 681 nt0.74□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 BER1YLR412W 825 nt0.74□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 YPR039WYPR039W 336 nt0.74□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 UBP3YER151C 2739 nt0.74□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 SEC5YDR166C 2916 nt0.74□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 GDS1YOR355W 1569 nt0.74□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 OCA6YDR067C 675 nt0.73□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 HUR1YGL168W 333 nt0.73□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 SPR3YGR059W 1539 nt0.73□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.72□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 RPS30BYOR182C 192 nt0.72□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 RCN2YOR220W 798 nt0.72□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 SGO1YOR073W 1773 nt0.72□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 APL3YBL037W 3078 nt0.72□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 YKL123WYKL123W 381 nt0.71□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 YOR248WYOR248W 303 nt0.71□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 NUT2YPR168W 474 nt0.71□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 MKT1YNL085W 2493 nt0.71□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 SWI4YER111C 3282 nt0.7□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 SPO23YBR250W 1572 nt0.7□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.7□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 HIT1YJR055W 495 nt0.7□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 SDH2YLL041C 801 nt0.7□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 RPL32YBL092W 393 nt0.7□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 SVS1YPL163C 783 nt0.7□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 NUT1YGL151W 3399 nt0.7□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 YGR025WYGR025W 303 nt0.69□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.69□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 ILM1YJR118C 612 nt0.69□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.69□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 RUF22RUF22 515 nt0.69□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 RPL9BYNL067W 576 nt0.69□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 SPT21YMR179W 2277 nt0.69□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 PIG1YLR273C 1947 nt0.69□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 PXA2YKL188C 2562 nt0.69□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 LYS14YDR034C 2373 nt0.69□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.68□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 INA22YIR024C 651 nt0.68□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.68□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.68□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 NUP145YGL092W 3954 nt0.68□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 ZIP1YDR285W 2628 nt0.68□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 SAS3YBL052C 2496 nt0.67□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 TOF2YKR010C 2316 nt0.67□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 SLD3YGL113W 2007 nt0.67□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 ENV11YGR071C 2583 nt0.67□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 IRC23YOR044W 474 nt0.67□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 NBL1YHR199C-A 222 nt0.66□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 APQ13YJL075C 417 nt0.66□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.66□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 snR13snR13 124 nt0.66□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 YBR071WYBR071W 636 nt0.66□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.66□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 OST1YJL002C 1431 nt0.65□□□□□ -2.3
RCE1Q03530 YAP3YHL009C 993 nt0.65□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 YLL054CYLL054C 2532 nt0.65□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 SET3YKR029C 2256 nt0.64□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 NHP2YDL208W 471 nt0.64□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 PHS1YJL097W 654 nt0.64□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 NOC3YLR002C 1992 nt0.64□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 SEC1YDR164C 2175 nt0.64□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt0.63□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 CMC4YMR194C-B 222 nt0.63□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 GPI15YNL038W 690 nt0.63□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.63□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 MPT5YGL178W 2580 nt0.63□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 SCW11YGL028C 1629 nt0.63□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 AIM9YER080W 1884 nt0.63□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 RKR1YMR247C 4689 nt0.62□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 YJR003CYJR003C 1560 nt0.62□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 YLL032CYLL032C 2478 nt0.62□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 HMLALPHA2YCL067C 633 nt0.62□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 MATALPHA2YCR039C 633 nt0.62□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 MET32YDR253C 576 nt0.62□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 YDR521WYDR521W 336 nt0.62□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 CYC7YEL039C 342 nt0.62□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 RPL9AYGL147C 576 nt0.62□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 YGR045CYGR045C 363 nt0.62□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 RPL16AYIL133C 600 nt0.62□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 YLR269CYLR269C 351 nt0.62□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.62□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 NUP157YER105C 4176 nt0.62□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 YDR114CYDR114C 303 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 YER084W-AYER084W-A 513 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 YGL239CYGL239C 315 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 RPF1YHR088W 888 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.61□□□□□ -2.31
RCE1Q03530 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.61□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 17.8 ms