Protein–RNA interactions for Protein: Q02821

SRP1, Importin subunit alpha, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SRP1Q02821 VPS54YDR027C 2670 nt2.6□□□□□ -1.99
SRP1Q02821 REV3YPL167C 4515 nt2.6□□□□□ -1.99
SRP1Q02821 MDM1YML104C 3384 nt2.59□□□□□ -1.99
SRP1Q02821 COS111YBR203W 2775 nt2.59□□□□□ -1.99
SRP1Q02821 YLR278CYLR278C 4026 nt2.59□□□□□ -1.99
SRP1Q02821 VPS55YJR044C 423 nt2.59□□□□□ -1.99
SRP1Q02821 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.59□□□□□ -1.99
SRP1Q02821 RFX1YLR176C 2436 nt2.59□□□□□ -2
SRP1Q02821 SWI6YLR182W 2412 nt2.59□□□□□ -2
SRP1Q02821 SLM1YIL105C 2061 nt2.58□□□□□ -2
SRP1Q02821 YCR043CYCR043C 384 nt2.58□□□□□ -2
SRP1Q02821 snR72snR72 98 nt2.58□□□□□ -2
SRP1Q02821 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.58□□□□□ -2
SRP1Q02821 RRT15YLR162W-A 189 nt2.58□□□□□ -2
SRP1Q02821 YNL338WYNL338W 159 nt2.58□□□□□ -2
SRP1Q02821 DNA2YHR164C 4569 nt2.58□□□□□ -2
SRP1Q02821 NIP100YPL174C 2607 nt2.57□□□□□ -2
SRP1Q02821 NMD2YHR077C 3270 nt2.57□□□□□ -2
SRP1Q02821 ESL2YKR096W 3588 nt2.57□□□□□ -2
SRP1Q02821 YHL005CYHL005C 393 nt2.57□□□□□ -2
SRP1Q02821 PAU8YAL068C 363 nt2.57□□□□□ -2
SRP1Q02821 PAU18YLL064C 363 nt2.57□□□□□ -2
SRP1Q02821 PAU6YNR076W 363 nt2.57□□□□□ -2
SRP1Q02821 PAU20YOL161C 363 nt2.57□□□□□ -2
SRP1Q02821 ZRG8YER033C 3231 nt2.57□□□□□ -2
SRP1Q02821 SIR4YDR227W 4077 nt2.56□□□□□ -2
SRP1Q02821 SWI5YDR146C 2130 nt2.56□□□□□ -2
SRP1Q02821 LYS14YDR034C 2373 nt2.56□□□□□ -2
SRP1Q02821 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt2.55□□□□□ -2
SRP1Q02821 RPB10YOR210W 213 nt2.55□□□□□ -2
SRP1Q02821 ATG11YPR049C 3537 nt2.55□□□□□ -2
SRP1Q02821 YPR092WYPR092W 306 nt2.55□□□□□ -2
SRP1Q02821 TRS65YGR166W 1683 nt2.54□□□□□ -2
SRP1Q02821 OLI1Q0130 231 nt2.54□□□□□ -2
SRP1Q02821 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt2.54□□□□□ -2
SRP1Q02821 HEH2YDR458C 1992 nt2.54□□□□□ -2
SRP1Q02821 snR74snR74 88 nt2.53□□□□□ -2
SRP1Q02821 ATP8Q0080 147 nt2.53□□□□□ -2
SRP1Q02821 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt2.53□□□□□ -2
SRP1Q02821 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt2.53□□□□□ -2
SRP1Q02821 SPC98YNL126W 2541 nt2.53□□□□□ -2
SRP1Q02821 MET18YIL128W 3099 nt2.53□□□□□ -2
SRP1Q02821 PRP39YML046W 1890 nt2.52□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 YLR140WYLR140W 327 nt2.52□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 UBR1YGR184C 5853 nt2.52□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 SLY1YDR189W 2001 nt2.51□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 SCP160YJL080C 3669 nt2.51□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 YEL014CYEL014C 306 nt2.51□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt2.51□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.51□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.51□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt2.51□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 YCL046WYCL046W 324 nt2.51□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 VPS8YAL002W 3825 nt2.51□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 TUS1YLR425W 3924 nt2.5□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 FKS3YMR306W 5358 nt2.5□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 INO80YGL150C 4470 nt2.5□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 EMP24YGL200C 612 nt2.5□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt2.5□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 YOR376WYOR376W 369 nt2.5□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 SEC5YDR166C 2916 nt2.5□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 SPO75YLL005C 2607 nt2.5□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 RGA1YOR127W 3024 nt2.5□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.49□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.49□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.49□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.49□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.49□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.49□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.49□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 RPS17AYML024W 411 nt2.49□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 VTC3YPL019C 2508 nt2.49□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 MNE1YOR350C 1992 nt2.49□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 TOF1YNL273W 3717 nt2.48□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 PDR3YBL005W 2931 nt2.48□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 YKU70YMR284W 1809 nt2.48□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 SGF11YPL047W 300 nt2.48□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 CLN3YAL040C 1743 nt2.47□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 RPO41YFL036W 4056 nt2.47□□□□□ -2.01
SRP1Q02821 SRO77YBL106C 3033 nt2.46□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.46□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 RPS27BYHR021C 249 nt2.46□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 RPS22AYJL190C 393 nt2.46□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 ZRG17YNR039C 1818 nt2.46□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 IST2YBR086C 2841 nt2.46□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 CSF1YLR087C 8877 nt2.45□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 YBL012CYBL012C 402 nt2.45□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 TRA1YHR099W 11235 nt2.45□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 SRP14YDL092W 441 nt2.44□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 YGL217CYGL217C 342 nt2.44□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 RPL33AYPL143W 324 nt2.44□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 PUT3YKL015W 2940 nt2.44□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 NEW1YPL226W 3591 nt2.43□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 YOR218CYOR218C 420 nt2.43□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 snR46snR46 197 nt2.43□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 HSH155YMR288W 2916 nt2.43□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 YPL150WYPL150W 2706 nt2.42□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 ENV11YGR071C 2583 nt2.42□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 STE11YLR362W 2154 nt2.42□□□□□ -2.02
SRP1Q02821 KTI11YBL071W-A 249 nt2.42□□□□□ -2.02
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