Protein–RNA interactions for Protein: P53438

SOK2, Protein SOK2, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SOK2P53438 TFC1YBR123C 1950 nt2.8□□□□□ -1.96
SOK2P53438 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt2.8□□□□□ -1.96
SOK2P53438 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.8□□□□□ -1.96
SOK2P53438 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.8□□□□□ -1.96
SOK2P53438 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.8□□□□□ -1.96
SOK2P53438 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.8□□□□□ -1.96
SOK2P53438 AIM44YPL158C 2277 nt2.8□□□□□ -1.96
SOK2P53438 UTP14YML093W 2700 nt2.79□□□□□ -1.96
SOK2P53438 YDR186CYDR186C 2634 nt2.79□□□□□ -1.96
SOK2P53438 PAU3YCR104W 375 nt2.79□□□□□ -1.96
SOK2P53438 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.79□□□□□ -1.96
SOK2P53438 VPS16YPL045W 2397 nt2.79□□□□□ -1.96
SOK2P53438 RLM1YPL089C 2031 nt2.78□□□□□ -1.96
SOK2P53438 SRB8YCR081W 4284 nt2.78□□□□□ -1.96
SOK2P53438 YPL044CYPL044C 549 nt2.78□□□□□ -1.96
SOK2P53438 SDC25YLL016W 3147 nt2.78□□□□□ -1.96
SOK2P53438 MAK21YDR060W 3078 nt2.78□□□□□ -1.96
SOK2P53438 CIN8YEL061C 3003 nt2.78□□□□□ -1.96
SOK2P53438 YLR282CYLR282C 342 nt2.77□□□□□ -1.97
SOK2P53438 CRS5YOR031W 210 nt2.77□□□□□ -1.97
SOK2P53438 YHR080CYHR080C 4038 nt2.77□□□□□ -1.97
SOK2P53438 STE6YKL209C 3873 nt2.76□□□□□ -1.97
SOK2P53438 DUG2YBR281C 2637 nt2.76□□□□□ -1.97
SOK2P53438 DBP10YDL031W 2988 nt2.76□□□□□ -1.97
SOK2P53438 PAA1YDR071C 576 nt2.76□□□□□ -1.97
SOK2P53438 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.76□□□□□ -1.97
SOK2P53438 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.76□□□□□ -1.97
SOK2P53438 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt2.76□□□□□ -1.97
SOK2P53438 PNC1YGL037C 651 nt2.76□□□□□ -1.97
SOK2P53438 YBR277CYBR277C 402 nt2.76□□□□□ -1.97
SOK2P53438 SMY2YBR172C 2223 nt2.76□□□□□ -1.97
SOK2P53438 TFC4YGR047C 3078 nt2.75□□□□□ -1.97
SOK2P53438 SLM1YIL105C 2061 nt2.75□□□□□ -1.97
SOK2P53438 CTF4YPR135W 2784 nt2.75□□□□□ -1.97
SOK2P53438 ACB1YGR037C 264 nt2.75□□□□□ -1.97
SOK2P53438 SNC1YAL030W 354 nt2.75□□□□□ -1.97
SOK2P53438 YNL211CYNL211C 261 nt2.75□□□□□ -1.97
SOK2P53438 AHC1YOR023C 1701 nt2.75□□□□□ -1.97
SOK2P53438 NFT1YKR103W 3657 nt2.75□□□□□ -1.97
SOK2P53438 PMR1YGL167C 2853 nt2.75□□□□□ -1.97
SOK2P53438 SET2YJL168C 2202 nt2.74□□□□□ -1.97
SOK2P53438 ATP7YKL016C 525 nt2.74□□□□□ -1.97
SOK2P53438 PAU8YAL068C 363 nt2.74□□□□□ -1.97
SOK2P53438 PAU18YLL064C 363 nt2.74□□□□□ -1.97
SOK2P53438 PAU6YNR076W 363 nt2.74□□□□□ -1.97
SOK2P53438 PAU20YOL161C 363 nt2.74□□□□□ -1.97
SOK2P53438 MGM1YOR211C 2646 nt2.74□□□□□ -1.97
SOK2P53438 STT4YLR305C 5703 nt2.74□□□□□ -1.97
SOK2P53438 GCV2YMR189W 3105 nt2.73□□□□□ -1.97
SOK2P53438 MDM1YML104C 3384 nt2.73□□□□□ -1.97
SOK2P53438 SIN3YOL004W 4611 nt2.73□□□□□ -1.97
SOK2P53438 RPO41YFL036W 4056 nt2.73□□□□□ -1.97
SOK2P53438 FIR1YER032W 2631 nt2.72□□□□□ -1.97
SOK2P53438 NAM7YMR080C 2916 nt2.72□□□□□ -1.97
SOK2P53438 RAD34YDR314C 2079 nt2.72□□□□□ -1.97
SOK2P53438 PIP2YOR363C 2991 nt2.72□□□□□ -1.97
SOK2P53438 OST4YDL232W 111 nt2.72□□□□□ -1.97
SOK2P53438 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.72□□□□□ -1.97
SOK2P53438 RAX2YLR084C 3663 nt2.72□□□□□ -1.97
SOK2P53438 YBR206WYBR206W 324 nt2.72□□□□□ -1.97
SOK2P53438 INP53YOR109W 3324 nt2.72□□□□□ -1.97
SOK2P53438 NOC3YLR002C 1992 nt2.72□□□□□ -1.97
SOK2P53438 RRP6YOR001W 2202 nt2.72□□□□□ -1.97
SOK2P53438 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.71□□□□□ -1.98
SOK2P53438 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.71□□□□□ -1.98
SOK2P53438 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt2.71□□□□□ -1.98
SOK2P53438 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt2.71□□□□□ -1.98
SOK2P53438 ESL1YIL151C 3357 nt2.71□□□□□ -1.98
SOK2P53438 MOT1YPL082C 5604 nt2.71□□□□□ -1.98
SOK2P53438 CDC53YDL132W 2448 nt2.71□□□□□ -1.98
SOK2P53438 PBY1YBR094W 2262 nt2.7□□□□□ -1.98
SOK2P53438 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt2.7□□□□□ -1.98
SOK2P53438 MBB1YJL199C 327 nt2.7□□□□□ -1.98
SOK2P53438 FRE2YKL220C 2136 nt2.7□□□□□ -1.98
SOK2P53438 ECM21YBL101C 3354 nt2.69□□□□□ -1.98
SOK2P53438 SKP2YNL311C 2292 nt2.69□□□□□ -1.98
SOK2P53438 CDC31YOR257W 486 nt2.69□□□□□ -1.98
SOK2P53438 BPT1YLL015W 4680 nt2.69□□□□□ -1.98
SOK2P53438 RPA190YOR341W 4995 nt2.69□□□□□ -1.98
SOK2P53438 VMR1YHL035C 4779 nt2.68□□□□□ -1.98
SOK2P53438 SPO14YKR031C 5052 nt2.68□□□□□ -1.98
SOK2P53438 ZIP2YGL249W 2115 nt2.68□□□□□ -1.98
SOK2P53438 YCL046WYCL046W 324 nt2.68□□□□□ -1.98
SOK2P53438 YDR239CYDR239C 2364 nt2.68□□□□□ -1.98
SOK2P53438 YME2YMR302C 2553 nt2.68□□□□□ -1.98
SOK2P53438 RPL31AYDL075W 342 nt2.67□□□□□ -1.98
SOK2P53438 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt2.67□□□□□ -1.98
SOK2P53438 CMC4YMR194C-B 222 nt2.67□□□□□ -1.98
SOK2P53438 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.67□□□□□ -1.98
SOK2P53438 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.67□□□□□ -1.98
SOK2P53438 SLD3YGL113W 2007 nt2.66□□□□□ -1.98
SOK2P53438 FLO1YAR050W 4614 nt2.66□□□□□ -1.98
SOK2P53438 EDS1YBR033W 2760 nt2.66□□□□□ -1.98
SOK2P53438 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt2.66□□□□□ -1.98
SOK2P53438 ENV11YGR071C 2583 nt2.66□□□□□ -1.98
SOK2P53438 VTC3YPL019C 2508 nt2.66□□□□□ -1.98
SOK2P53438 TOM1YDR457W 9807 nt2.65□□□□□ -1.98
SOK2P53438 SSN2YDR443C 4263 nt2.65□□□□□ -1.98
SOK2P53438 RGC1YPR115W 3252 nt2.65□□□□□ -1.99
SOK2P53438 MAD1YGL086W 2250 nt2.65□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 69.2 ms