Protein–RNA interactions for Protein: P53343

PAU12, Seripauperin-12, yeastyeast

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Length 120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PAU12P53343 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt0.07□□□□□ -2.4
PAU12P53343 snR34snR34 203 nt0.07□□□□□ -2.4
PAU12P53343 CHS6YJL099W 2241 nt0.06□□□□□ -2.4
PAU12P53343 RUB1YDR139C 234 nt0.06□□□□□ -2.4
PAU12P53343 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.06□□□□□ -2.4
PAU12P53343 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.06□□□□□ -2.4
PAU12P53343 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.06□□□□□ -2.4
PAU12P53343 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.06□□□□□ -2.4
PAU12P53343 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.06□□□□□ -2.4
PAU12P53343 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.06□□□□□ -2.4
PAU12P53343 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.06□□□□□ -2.4
PAU12P53343 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.06□□□□□ -2.4
PAU12P53343 DFG10YIL049W 762 nt0.06□□□□□ -2.4
PAU12P53343 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.06□□□□□ -2.4
PAU12P53343 ATP20YPR020W 348 nt0.06□□□□□ -2.4
PAU12P53343 YPR153WYPR153W 423 nt0.06□□□□□ -2.4
PAU12P53343 ALY2YJL084C 3141 nt0.06□□□□□ -2.4
PAU12P53343 SLI15YBR156C 2097 nt0.06□□□□□ -2.4
PAU12P53343 MET32YDR253C 576 nt0.05□□□□□ -2.4
PAU12P53343 YER038W-AYER038W-A 381 nt0.05□□□□□ -2.4
PAU12P53343 SPO13YHR014W 876 nt0.05□□□□□ -2.4
PAU12P53343 UPS1YLR193C 528 nt0.05□□□□□ -2.4
PAU12P53343 RPL26AYLR344W 384 nt0.05□□□□□ -2.4
PAU12P53343 BIR1YJR089W 2865 nt0.05□□□□□ -2.4
PAU12P53343 snR79snR79 84 nt0.04□□□□□ -2.4
PAU12P53343 WIP1YDR374W-A 270 nt0.04□□□□□ -2.4
PAU12P53343 RPS30AYLR287C-A 192 nt0.04□□□□□ -2.4
PAU12P53343 AFR1YDR085C 1863 nt0.03□□□□□ -2.4
PAU12P53343 RPL9AYGL147C 576 nt0.03□□□□□ -2.4
PAU12P53343 CMS1YLR003C 876 nt0.03□□□□□ -2.4
PAU12P53343 COX12YLR038C 252 nt0.03□□□□□ -2.4
PAU12P53343 MLP1YKR095W 5628 nt0.03□□□□□ -2.41
PAU12P53343 YDL152WYDL152W 366 nt0.02□□□□□ -2.41
PAU12P53343 RSM27YGR215W 333 nt0.02□□□□□ -2.41
PAU12P53343 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt0.02□□□□□ -2.41
PAU12P53343 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt0.02□□□□□ -2.41
PAU12P53343 VIK1YPL253C 1944 nt0.01□□□□□ -2.41
PAU12P53343 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.01□□□□□ -2.41
PAU12P53343 RRT1YBL048W 312 nt0.01□□□□□ -2.41
PAU12P53343 PET111YMR257C 2403 nt0.01□□□□□ -2.41
PAU12P53343 PMP1YCR024C-A 123 nt0□□□□□ -2.41
PAU12P53343 COX7YMR256C 183 nt0□□□□□ -2.41
PAU12P53343 IRC2YDR112W 309 nt-0.01□□□□□ -2.41
PAU12P53343 YGR042WYGR042W 816 nt-0.01□□□□□ -2.41
PAU12P53343 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt-0.01□□□□□ -2.41
PAU12P53343 YBR071WYBR071W 636 nt-0.01□□□□□ -2.41
PAU12P53343 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt-0.01□□□□□ -2.41
PAU12P53343 SPO23YBR250W 1572 nt-0.02□□□□□ -2.41
PAU12P53343 snR59snR59 78 nt-0.02□□□□□ -2.41
PAU12P53343 MLP2YIL149C 5040 nt-0.02□□□□□ -2.41
PAU12P53343 NUP120YKL057C 3114 nt-0.03□□□□□ -2.41
PAU12P53343 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt-0.03□□□□□ -2.41
PAU12P53343 TYE7YOR344C 876 nt-0.03□□□□□ -2.41
PAU12P53343 YOR364WYOR364W 369 nt-0.03□□□□□ -2.41
PAU12P53343 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt-0.04□□□□□ -2.42
PAU12P53343 RPL32YBL092W 393 nt-0.04□□□□□ -2.42
PAU12P53343 PAN3YKL025C 2040 nt-0.04□□□□□ -2.42
PAU12P53343 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt-0.05□□□□□ -2.42
PAU12P53343 YER158W-AYER158W-A 216 nt-0.05□□□□□ -2.42
PAU12P53343 YLR252WYLR252W 306 nt-0.05□□□□□ -2.42
PAU12P53343 YOL106WYOL106W 354 nt-0.05□□□□□ -2.42
PAU12P53343 NOP9YJL010C 2001 nt-0.05□□□□□ -2.42
PAU12P53343 STE5YDR103W 2754 nt-0.06□□□□□ -2.42
PAU12P53343 snR84snR84 550 nt-0.06□□□□□ -2.42
PAU12P53343 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt-0.06□□□□□ -2.42
PAU12P53343 YJL127W-AYJL127W-A 117 nt-0.06□□□□□ -2.42
PAU12P53343 YKL111CYKL111C 336 nt-0.06□□□□□ -2.42
PAU12P53343 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt-0.06□□□□□ -2.42
PAU12P53343 YPR099CYPR099C 357 nt-0.06□□□□□ -2.42
PAU12P53343 RRI2YOL117W 1938 nt-0.07□□□□□ -2.42
PAU12P53343 NPC2YDL046W 522 nt-0.07□□□□□ -2.42
PAU12P53343 TDA2YER071C 381 nt-0.07□□□□□ -2.42
PAU12P53343 RPL22BYFL034C-A 369 nt-0.07□□□□□ -2.42
PAU12P53343 GPG1YGL121C 381 nt-0.07□□□□□ -2.42
PAU12P53343 CDC33YOL139C 642 nt-0.07□□□□□ -2.42
PAU12P53343 snR13snR13 124 nt-0.07□□□□□ -2.42
PAU12P53343 QCR7YDR529C 384 nt-0.08□□□□□ -2.42
PAU12P53343 LOC1YFR001W 615 nt-0.08□□□□□ -2.42
PAU12P53343 RPC10YHR143W-A 213 nt-0.08□□□□□ -2.42
PAU12P53343 YOL014WYOL014W 375 nt-0.08□□□□□ -2.42
PAU12P53343 YOR053WYOR053W 342 nt-0.08□□□□□ -2.42
PAU12P53343 LOA1YPR139C 903 nt-0.08□□□□□ -2.42
PAU12P53343 YLL032CYLL032C 2478 nt-0.08□□□□□ -2.42
PAU12P53343 YDR344CYDR344C 444 nt-0.09□□□□□ -2.42
PAU12P53343 SPO11YHL022C 1197 nt-0.09□□□□□ -2.42
PAU12P53343 COG8YML071C 1824 nt-0.09□□□□□ -2.42
PAU12P53343 PRP5YBR237W 2550 nt-0.09□□□□□ -2.42
PAU12P53343 YDR008CYDR008C 351 nt-0.1□□□□□ -2.43
PAU12P53343 HTB1YDR224C 396 nt-0.1□□□□□ -2.43
PAU12P53343 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-0.1□□□□□ -2.43
PAU12P53343 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt-0.1□□□□□ -2.43
PAU12P53343 BIG1YHR101C 1008 nt-0.1□□□□□ -2.43
PAU12P53343 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt-0.1□□□□□ -2.43
PAU12P53343 ENV11YGR071C 2583 nt-0.1□□□□□ -2.43
PAU12P53343 PRP42YDR235W 1635 nt-0.11□□□□□ -2.43
PAU12P53343 SLX9YGR081C 633 nt-0.11□□□□□ -2.43
PAU12P53343 LIN1YHR156C 1023 nt-0.11□□□□□ -2.43
PAU12P53343 COX3Q0275 810 nt-0.11□□□□□ -2.43
PAU12P53343 BSC3YLR465C 309 nt-0.11□□□□□ -2.43
PAU12P53343 YPL197CYPL197C 414 nt-0.11□□□□□ -2.43
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