Protein–RNA interactions for Protein: P53187

HOP2, Homologous-pairing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HOP2P53187 YDR509WYDR509W 348 nt0.6□□□□□ -2.31
HOP2P53187 QCR7YDR529C 384 nt0.6□□□□□ -2.31
HOP2P53187 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.6□□□□□ -2.31
HOP2P53187 YFR057WYFR057W 456 nt0.6□□□□□ -2.31
HOP2P53187 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt0.6□□□□□ -2.31
HOP2P53187 YPR099CYPR099C 357 nt0.6□□□□□ -2.31
HOP2P53187 PDE2YOR360C 1581 nt0.6□□□□□ -2.31
HOP2P53187 SPO23YBR250W 1572 nt0.6□□□□□ -2.31
HOP2P53187 MKT1YNL085W 2493 nt0.6□□□□□ -2.31
HOP2P53187 YPT6YLR262C 648 nt0.59□□□□□ -2.31
HOP2P53187 RPL38YLR325C 237 nt0.59□□□□□ -2.31
HOP2P53187 UBS1YBR165W 834 nt0.59□□□□□ -2.31
HOP2P53187 ENV11YGR071C 2583 nt0.59□□□□□ -2.32
HOP2P53187 SWI6YLR182W 2412 nt0.59□□□□□ -2.32
HOP2P53187 SCW11YGL028C 1629 nt0.58□□□□□ -2.32
HOP2P53187 HNT1YDL125C 477 nt0.58□□□□□ -2.32
HOP2P53187 OCA6YDR067C 675 nt0.58□□□□□ -2.32
HOP2P53187 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.58□□□□□ -2.32
HOP2P53187 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.58□□□□□ -2.32
HOP2P53187 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.58□□□□□ -2.32
HOP2P53187 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
HOP2P53187 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
HOP2P53187 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.58□□□□□ -2.32
HOP2P53187 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.58□□□□□ -2.32
HOP2P53187 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.58□□□□□ -2.32
HOP2P53187 YKL111CYKL111C 336 nt0.58□□□□□ -2.32
HOP2P53187 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.58□□□□□ -2.32
HOP2P53187 UTP10YJL109C 5310 nt0.57□□□□□ -2.32
HOP2P53187 YLL007CYLL007C 1998 nt0.57□□□□□ -2.32
HOP2P53187 PXA2YKL188C 2562 nt0.57□□□□□ -2.32
HOP2P53187 RPC10YHR143W-A 213 nt0.57□□□□□ -2.32
HOP2P53187 YBR032WYBR032W 303 nt0.57□□□□□ -2.32
HOP2P53187 POP7YBR167C 423 nt0.57□□□□□ -2.32
HOP2P53187 PAN3YKL025C 2040 nt0.57□□□□□ -2.32
HOP2P53187 SLD3YGL113W 2007 nt0.55□□□□□ -2.32
HOP2P53187 FIG4YNL325C 2640 nt0.55□□□□□ -2.32
HOP2P53187 LYS14YDR034C 2373 nt0.55□□□□□ -2.32
HOP2P53187 SPC2YML055W 537 nt0.55□□□□□ -2.32
HOP2P53187 SLY1YDR189W 2001 nt0.54□□□□□ -2.32
HOP2P53187 YDR220CYDR220C 294 nt0.54□□□□□ -2.32
HOP2P53187 YOR218CYOR218C 420 nt0.54□□□□□ -2.32
HOP2P53187 YBR071WYBR071W 636 nt0.54□□□□□ -2.32
HOP2P53187 KAR1YNL188W 1302 nt0.54□□□□□ -2.32
HOP2P53187 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.54□□□□□ -2.32
HOP2P53187 YGL015CYGL015C 393 nt0.53□□□□□ -2.32
HOP2P53187 YGR115CYGR115C 780 nt0.53□□□□□ -2.32
HOP2P53187 YPR096CYPR096C 303 nt0.53□□□□□ -2.32
HOP2P53187 MMS4YBR098W 2076 nt0.53□□□□□ -2.32
HOP2P53187 MRPL32YCR003W 552 nt0.52□□□□□ -2.33
HOP2P53187 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.52□□□□□ -2.33
HOP2P53187 YLR271WYLR271W 825 nt0.52□□□□□ -2.33
HOP2P53187 YPR153WYPR153W 423 nt0.52□□□□□ -2.33
HOP2P53187 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.52□□□□□ -2.33
HOP2P53187 snR5snR5 204 nt0.51□□□□□ -2.33
HOP2P53187 snR84snR84 550 nt0.51□□□□□ -2.33
HOP2P53187 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.51□□□□□ -2.33
HOP2P53187 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.51□□□□□ -2.33
HOP2P53187 ALG13YGL047W 609 nt0.51□□□□□ -2.33
HOP2P53187 YGR228WYGR228W 345 nt0.51□□□□□ -2.33
HOP2P53187 ECM12YHR021W-A 456 nt0.51□□□□□ -2.33
HOP2P53187 PHS1YJL097W 654 nt0.51□□□□□ -2.33
HOP2P53187 UPS1YLR193C 528 nt0.51□□□□□ -2.33
HOP2P53187 YSP1YHR155W 3687 nt0.51□□□□□ -2.33
HOP2P53187 LCD1YDR499W 2244 nt0.5□□□□□ -2.33
HOP2P53187 ISD11YER048W-A 285 nt0.5□□□□□ -2.33
HOP2P53187 YGL230CYGL230C 444 nt0.5□□□□□ -2.33
HOP2P53187 SDS22YKL193C 1017 nt0.5□□□□□ -2.33
HOP2P53187 SDH2YLL041C 801 nt0.5□□□□□ -2.33
HOP2P53187 CSM4YPL200W 471 nt0.5□□□□□ -2.33
HOP2P53187 LTE1YAL024C 4308 nt0.5□□□□□ -2.33
HOP2P53187 YCK3YER123W 1575 nt0.49□□□□□ -2.33
HOP2P53187 DBP6YNR038W 1890 nt0.48□□□□□ -2.33
HOP2P53187 ULP2YIL031W 3105 nt0.48□□□□□ -2.33
HOP2P53187 FMP27YLR454W 7887 nt0.48□□□□□ -2.33
HOP2P53187 YIL059CYIL059C 366 nt0.48□□□□□ -2.33
HOP2P53187 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.48□□□□□ -2.33
HOP2P53187 MRPS8YMR158W 468 nt0.48□□□□□ -2.33
HOP2P53187 RRT1YBL048W 312 nt0.48□□□□□ -2.33
HOP2P53187 YOR248WYOR248W 303 nt0.48□□□□□ -2.33
HOP2P53187 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.47□□□□□ -2.33
HOP2P53187 IES4YOR189W 351 nt0.47□□□□□ -2.33
HOP2P53187 PAN2YGL094C 3348 nt0.46□□□□□ -2.34
HOP2P53187 QCR9YGR183C 201 nt0.46□□□□□ -2.34
HOP2P53187 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.46□□□□□ -2.34
HOP2P53187 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.46□□□□□ -2.34
HOP2P53187 WAR1YML076C 2835 nt0.45□□□□□ -2.34
HOP2P53187 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.45□□□□□ -2.34
HOP2P53187 YCL002CYCL002C 792 nt0.45□□□□□ -2.34
HOP2P53187 YLL032CYLL032C 2478 nt0.45□□□□□ -2.34
HOP2P53187 MET32YDR253C 576 nt0.44□□□□□ -2.34
HOP2P53187 YJR079WYJR079W 330 nt0.44□□□□□ -2.34
HOP2P53187 GEA2YEL022W 4380 nt0.43□□□□□ -2.34
HOP2P53187 SPO13YHR014W 876 nt0.43□□□□□ -2.34
HOP2P53187 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt0.43□□□□□ -2.34
HOP2P53187 VAM3YOR106W 852 nt0.43□□□□□ -2.34
HOP2P53187 YGR042WYGR042W 816 nt0.42□□□□□ -2.34
HOP2P53187 GMC2YLR445W 567 nt0.42□□□□□ -2.34
HOP2P53187 SLI15YBR156C 2097 nt0.42□□□□□ -2.34
HOP2P53187 WIP1YDR374W-A 270 nt0.41□□□□□ -2.34
HOP2P53187 YHL042WYHL042W 453 nt0.41□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 207.9 ms