Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 YGL217CYGL217C 342 nt1.39□□□□□ -2.19
SEC28P40509 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.39□□□□□ -2.19
SEC28P40509 RRT15YLR162W-A 189 nt1.39□□□□□ -2.19
SEC28P40509 RUF22RUF22 515 nt1.39□□□□□ -2.19
SEC28P40509 YLL054CYLL054C 2532 nt1.39□□□□□ -2.19
SEC28P40509 SLX4YLR135W 2247 nt1.39□□□□□ -2.19
SEC28P40509 GUP1YGL084C 1683 nt1.39□□□□□ -2.19
SEC28P40509 PIG1YLR273C 1947 nt1.38□□□□□ -2.19
SEC28P40509 MUK1YPL070W 1839 nt1.38□□□□□ -2.19
SEC28P40509 RSM22YKL155C 1887 nt1.38□□□□□ -2.19
SEC28P40509 SRP14YDL092W 441 nt1.38□□□□□ -2.19
SEC28P40509 RTR1YER139C 681 nt1.38□□□□□ -2.19
SEC28P40509 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.38□□□□□ -2.19
SEC28P40509 YHL037CYHL037C 402 nt1.38□□□□□ -2.19
SEC28P40509 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.38□□□□□ -2.19
SEC28P40509 RPL9BYNL067W 576 nt1.38□□□□□ -2.19
SEC28P40509 ZEO1YOL109W 342 nt1.38□□□□□ -2.19
SEC28P40509 TRM732YMR259C 4263 nt1.37□□□□□ -2.19
SEC28P40509 YDL211CYDL211C 1119 nt1.37□□□□□ -2.19
SEC28P40509 NOC3YLR002C 1992 nt1.36□□□□□ -2.19
SEC28P40509 PHS1YJL097W 654 nt1.36□□□□□ -2.19
SEC28P40509 CDC33YOL139C 642 nt1.36□□□□□ -2.19
SEC28P40509 RVS161YCR009C 798 nt1.35□□□□□ -2.19
SEC28P40509 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt1.35□□□□□ -2.19
SEC28P40509 RPS27AYKL156W 249 nt1.35□□□□□ -2.19
SEC28P40509 ERP4YOR016C 624 nt1.35□□□□□ -2.19
SEC28P40509 RFX1YLR176C 2436 nt1.35□□□□□ -2.19
SEC28P40509 YIL059CYIL059C 366 nt1.34□□□□□ -2.19
SEC28P40509 YPR063CYPR063C 423 nt1.34□□□□□ -2.19
SEC28P40509 SWI4YER111C 3282 nt1.34□□□□□ -2.2
SEC28P40509 PBY1YBR094W 2262 nt1.33□□□□□ -2.2
SEC28P40509 SEC3YER008C 4011 nt1.33□□□□□ -2.2
SEC28P40509 CDC36YDL165W 576 nt1.33□□□□□ -2.2
SEC28P40509 YDR269CYDR269C 324 nt1.33□□□□□ -2.2
SEC28P40509 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.33□□□□□ -2.2
SEC28P40509 PRE4YFR050C 801 nt1.33□□□□□ -2.2
SEC28P40509 YBL071CYBL071C 309 nt1.33□□□□□ -2.2
SEC28P40509 ATP19YOL077W-A 207 nt1.33□□□□□ -2.2
SEC28P40509 ENV11YGR071C 2583 nt1.33□□□□□ -2.2
SEC28P40509 SLY1YDR189W 2001 nt1.32□□□□□ -2.2
SEC28P40509 YLL032CYLL032C 2478 nt1.32□□□□□ -2.2
SEC28P40509 NUP188YML103C 4968 nt1.32□□□□□ -2.2
SEC28P40509 RAD9YDR217C 3930 nt1.32□□□□□ -2.2
SEC28P40509 DIE2YGR227W 1578 nt1.31□□□□□ -2.2
SEC28P40509 YLR101CYLR101C 396 nt1.31□□□□□ -2.2
SEC28P40509 SAS3YBL052C 2496 nt1.3□□□□□ -2.2
SEC28P40509 CDC25YLR310C 4770 nt1.3□□□□□ -2.2
SEC28P40509 APL2YKL135C 2181 nt1.3□□□□□ -2.2
SEC28P40509 TIM13YGR181W 318 nt1.3□□□□□ -2.2
SEC28P40509 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.3□□□□□ -2.2
SEC28P40509 MRPL31YKL138C 396 nt1.3□□□□□ -2.2
SEC28P40509 YLR287CYLR287C 1068 nt1.3□□□□□ -2.2
SEC28P40509 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt1.3□□□□□ -2.2
SEC28P40509 YOL159CYOL159C 516 nt1.3□□□□□ -2.2
SEC28P40509 NUT2YPR168W 474 nt1.3□□□□□ -2.2
SEC28P40509 SPT21YMR179W 2277 nt1.29□□□□□ -2.2
SEC28P40509 EFR3YMR212C 2349 nt1.29□□□□□ -2.2
SEC28P40509 YDL011CYDL011C 324 nt1.29□□□□□ -2.2
SEC28P40509 TOM22YNL131W 459 nt1.29□□□□□ -2.2
SEC28P40509 PIP2YOR363C 2991 nt1.29□□□□□ -2.2
SEC28P40509 snR41snR41 95 nt1.29□□□□□ -2.2
SEC28P40509 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt1.29□□□□□ -2.2
SEC28P40509 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.28□□□□□ -2.2
SEC28P40509 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.28□□□□□ -2.2
SEC28P40509 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.28□□□□□ -2.2
SEC28P40509 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.28□□□□□ -2.2
SEC28P40509 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.28□□□□□ -2.2
SEC28P40509 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.28□□□□□ -2.2
SEC28P40509 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.28□□□□□ -2.2
SEC28P40509 YLL020CYLL020C 306 nt1.28□□□□□ -2.2
SEC28P40509 SDH2YLL041C 801 nt1.28□□□□□ -2.2
SEC28P40509 GAL7YBR018C 1101 nt1.28□□□□□ -2.2
SEC28P40509 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.28□□□□□ -2.2
SEC28P40509 NUP145YGL092W 3954 nt1.27□□□□□ -2.21
SEC28P40509 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt1.27□□□□□ -2.21
SEC28P40509 YKL202WYKL202W 582 nt1.27□□□□□ -2.21
SEC28P40509 snR14snR14 160 nt1.27□□□□□ -2.21
SEC28P40509 SPO75YLL005C 2607 nt1.27□□□□□ -2.21
SEC28P40509 MPT5YGL178W 2580 nt1.26□□□□□ -2.21
SEC28P40509 UPS1YLR193C 528 nt1.26□□□□□ -2.21
SEC28P40509 APL3YBL037W 3078 nt1.25□□□□□ -2.21
SEC28P40509 CYC7YEL039C 342 nt1.25□□□□□ -2.21
SEC28P40509 RTT102YGR275W 474 nt1.25□□□□□ -2.21
SEC28P40509 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.25□□□□□ -2.21
SEC28P40509 Q0017Q0017 162 nt1.25□□□□□ -2.21
SEC28P40509 SCW11YGL028C 1629 nt1.25□□□□□ -2.21
SEC28P40509 ALY2YJL084C 3141 nt1.24□□□□□ -2.21
SEC28P40509 WIP1YDR374W-A 270 nt1.24□□□□□ -2.21
SEC28P40509 ANS1YHR126C 480 nt1.24□□□□□ -2.21
SEC28P40509 YBR012CYBR012C 420 nt1.24□□□□□ -2.21
SEC28P40509 AIM44YPL158C 2277 nt1.24□□□□□ -2.21
SEC28P40509 AHC1YOR023C 1701 nt1.23□□□□□ -2.21
SEC28P40509 NST1YNL091W 3723 nt1.23□□□□□ -2.21
SEC28P40509 IML1YJR138W 4755 nt1.23□□□□□ -2.21
SEC28P40509 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.23□□□□□ -2.21
SEC28P40509 EAF1YDR359C 2949 nt1.23□□□□□ -2.21
SEC28P40509 CBS1YDL069C 690 nt1.22□□□□□ -2.21
SEC28P40509 RPL33BYOR234C 324 nt1.22□□□□□ -2.21
SEC28P40509 AIM9YER080W 1884 nt1.22□□□□□ -2.21
SEC28P40509 YLR456WYLR456W 615 nt1.21□□□□□ -2.22
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