Protein–RNA interactions for Protein: P0CX85

RPL35B, 60S ribosomal protein L35-B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPL35BP0CX85 ECM12YHR021W-A 456 nt0.52□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 PHS1YJL097W 654 nt0.52□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 YKL111CYKL111C 336 nt0.52□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 COX7YMR256C 183 nt0.52□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 YMR304C-AYMR304C-A 351 nt0.52□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 YBR032WYBR032W 303 nt0.52□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 MMS4YBR098W 2076 nt0.52□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 YDR114CYDR114C 303 nt0.51□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 YCK3YER123W 1575 nt0.51□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 SDH2YLL041C 801 nt0.51□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 YPL197CYPL197C 414 nt0.51□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 MKT1YNL085W 2493 nt0.5□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 PAU12YGR294W 363 nt0.5□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 DBP6YNR038W 1890 nt0.5□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 YER158W-AYER158W-A 216 nt0.49□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 QCR9YGR183C 201 nt0.49□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.49□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 CMC1YKL137W 336 nt0.49□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 YLR217WYLR217W 324 nt0.49□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.49□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 YOL014WYOL014W 375 nt0.48□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 RKR1YMR247C 4689 nt0.47□□□□□ -2.33
RPL35BP0CX85 BI4Q0120 1917 nt0.46□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 WIP1YDR374W-A 270 nt0.46□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 TIM10YHR005C-A 282 nt0.46□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 YBR071WYBR071W 636 nt0.46□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 SWI6YLR182W 2412 nt0.46□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 WAR1YML076C 2835 nt0.46□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 SLY1YDR189W 2001 nt0.45□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 PAN3YKL025C 2040 nt0.45□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 OCA6YDR067C 675 nt0.45□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 RSM27YGR215W 333 nt0.45□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 LRP1YHR081W 555 nt0.45□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 YPR099CYPR099C 357 nt0.45□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 KAR1YNL188W 1302 nt0.44□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 LCD1YDR499W 2244 nt0.44□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 ISD11YER048W-A 285 nt0.44□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 YHR054CYHR054C 1065 nt0.44□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 YBL062WYBL062W 381 nt0.44□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 YOR218CYOR218C 420 nt0.44□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 SPO13YHR014W 876 nt0.43□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.43□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 SPO23YBR250W 1572 nt0.43□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 ALY2YJL084C 3141 nt0.42□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 LYS14YDR034C 2373 nt0.42□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 SLD3YGL113W 2007 nt0.42□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 QCR7YDR529C 384 nt0.42□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 TAD1YGL243W 1203 nt0.42□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 UPS1YLR193C 528 nt0.42□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt0.42□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt0.41□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 LTE1YAL024C 4308 nt0.41□□□□□ -2.34
RPL35BP0CX85 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt0.4□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 TRS65YGR166W 1683 nt0.4□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 YFR057WYFR057W 456 nt0.39□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 RPC10YHR143W-A 213 nt0.39□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 YPR153WYPR153W 423 nt0.39□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 YPR170CYPR170C 336 nt0.39□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 snR84snR84 550 nt0.38□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 YDR008CYDR008C 351 nt0.38□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 YDR220CYDR220C 294 nt0.38□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 YER138W-AYER138W-A 105 nt0.38□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 YGL015CYGL015C 393 nt0.38□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 YIL059CYIL059C 366 nt0.38□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 RRT1YBL048W 312 nt0.38□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt0.38□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 PAN2YGL094C 3348 nt0.38□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 MET32YDR253C 576 nt0.37□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt0.37□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 YOR282WYOR282W 321 nt0.37□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.37□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 AI1Q0050 2505 nt0.36□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 SLI15YBR156C 2097 nt0.36□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 YPR096CYPR096C 303 nt0.36□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 YGR115CYGR115C 780 nt0.35□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 UBC7YMR022W 498 nt0.35□□□□□ -2.35
RPL35BP0CX85 snR5snR5 204 nt0.34□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.34□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.34□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 YPT6YLR262C 648 nt0.34□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 UBX4YMR067C 1251 nt0.34□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 GEA2YEL022W 4380 nt0.34□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 ULP2YIL031W 3105 nt0.33□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.33□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 ISF1YMR081C 1017 nt0.33□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 YSP1YHR155W 3687 nt0.33□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 YLL032CYLL032C 2478 nt0.32□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 RPL9AYGL147C 576 nt0.32□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 YGR228WYGR228W 345 nt0.32□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 YLR271WYLR271W 825 nt0.32□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 VAM3YOR106W 852 nt0.32□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 CWC23YGL128C 852 nt0.31□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 SDS22YKL193C 1017 nt0.31□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 RPL32YBL092W 393 nt0.31□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 BFR2YDR299W 1605 nt0.31□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 NPC2YDL046W 522 nt0.3□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 YGL230CYGL230C 444 nt0.3□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 YGR042WYGR042W 816 nt0.3□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 MRPL31YKL138C 396 nt0.3□□□□□ -2.36
RPL35BP0CX85 POP7YBR167C 423 nt0.3□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 158.4 ms