Protein–RNA interactions for Protein: P01657

Ig kappa chain V-III region PC 2413, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01657 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01657 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01657 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01657 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01657 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01657 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01657 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01657 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01657 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01657 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01657 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01657 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01657 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01657 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01657 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01657 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01657 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01657 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01657 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01657 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01657 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01657 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01657 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01657 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01657 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01657 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01657 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01657 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01657 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01657 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01657 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01657 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01657 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01657 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01657 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01657 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01657 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01657 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01657 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01657 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01657 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01657 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01657 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01657 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01657 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01657 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01657 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01657 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01657 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01657 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01657 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01657 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01657 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01657 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01657 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01657 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01657 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01657 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01657 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01657 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01657 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01657 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01657 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01657 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01657 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01657 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01657 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01657 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01657 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01657 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01657 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01657 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01657 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01657 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01657 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01657 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01657 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01657 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01657 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01657 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms