Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
NipblQ6KCD5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
NipblQ6KCD5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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