Protein–RNA interactions for Protein: Q12405

LPX1, Peroxisomal membrane protein LPX1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LPX1Q12405 YIR044CYIR044C 186 nt2.82□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 YOR345CYOR345C 351 nt2.82□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 SET1YHR119W 3243 nt2.81□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 GRR1YJR090C 3456 nt2.81□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 BUB1YGR188C 3066 nt2.81□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 ENA5YDR038C 3276 nt2.81□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 snR72snR72 98 nt2.81□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.81□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.81□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.81□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.81□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.81□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.81□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.81□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 DNA2YHR164C 4569 nt2.8□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 snR70snR70 164 nt2.8□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 MPT5YGL178W 2580 nt2.8□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 ELG1YOR144C 2376 nt2.8□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 SAK1YER129W 3429 nt2.8□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 VPS35YJL154C 2835 nt2.79□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.79□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 RPB10YOR210W 213 nt2.79□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 RRP12YPL012W 3687 nt2.79□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 SNF5YBR289W 2718 nt2.79□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 PIG1YLR273C 1947 nt2.79□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 DBP7YKR024C 2229 nt2.78□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 SEF1YBL066C 3447 nt2.78□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 UBP11YKR098C 2154 nt2.78□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.78□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt2.78□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 TFC8YPL007C 1767 nt2.78□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 DYN1YKR054C 12279 nt2.78□□□□□ -1.96
LPX1Q12405 PXA2YKL188C 2562 nt2.77□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 TCB2YNL087W 3537 nt2.77□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 NUP120YKL057C 3114 nt2.77□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 KSP1YHR082C 3090 nt2.77□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 YAT2YER024W 2772 nt2.77□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 NAB6YML117W 3405 nt2.77□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 YPL150WYPL150W 2706 nt2.77□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.76□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 snR76snR76 109 nt2.76□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.76□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 PMP2YEL017C-A 132 nt2.76□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.76□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 RGM1YMR182C 636 nt2.76□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 TSC11YER093C 4293 nt2.76□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 PSY2YNL201C 2577 nt2.76□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 SMY1YKL079W 1971 nt2.76□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 BUD4YJR092W 4344 nt2.75□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 SPO21YOL091W 1830 nt2.75□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 YDL242WYDL242W 354 nt2.75□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 BRP1YGL007W 378 nt2.75□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 SWI6YLR182W 2412 nt2.75□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 YLR278CYLR278C 4026 nt2.75□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 SIR3YLR442C 2937 nt2.75□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 COY1YKL179C 2040 nt2.75□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 SRB8YCR081W 4284 nt2.74□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt2.74□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 YJL022WYJL022W 309 nt2.74□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 YNL103W-AYNL103W-A 90 nt2.74□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 ACM1YPL267W 630 nt2.74□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 SNQ2YDR011W 4506 nt2.74□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 HYP2YEL034W 474 nt2.73□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 YGR050CYGR050C 357 nt2.73□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 EMC6YLL014W 327 nt2.73□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 RPS17AYML024W 411 nt2.73□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 YOR102WYOR102W 351 nt2.73□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 snR43snR43 209 nt2.73□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 PFF1YBR074W 2931 nt2.73□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 YPR089WYPR089W 2667 nt2.73□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 PEP3YLR148W 2757 nt2.72□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 INP52YNL106C 3552 nt2.71□□□□□ -1.97
LPX1Q12405 BPT1YLL015W 4680 nt2.71□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 DNL4YOR005C 2835 nt2.71□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 RTT10YPL183C 3042 nt2.71□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 SMC2YFR031C 3513 nt2.71□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 RPL42BYHR141C 321 nt2.7□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 RPL42AYNL162W 321 nt2.7□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 NEW1YPL226W 3591 nt2.7□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 UBP14YBR058C 2346 nt2.69□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt2.69□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt2.69□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt2.69□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt2.69□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 SLY1YDR189W 2001 nt2.69□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 ATG13YPR185W 2217 nt2.69□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 TFC4YGR047C 3078 nt2.69□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 YBT1YLL048C 4986 nt2.68□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 NFT1YKR103W 3657 nt2.68□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 FMP16YDR070C 282 nt2.68□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.68□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 NOP10YHR072W-A 177 nt2.68□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 YNL114CYNL114C 372 nt2.68□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 MSC6YOR354C 2079 nt2.68□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 RPH1YER169W 2391 nt2.68□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 FKS3YMR306W 5358 nt2.68□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 YIL080WYIL080W 4722 nt2.68□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 GIS1YDR096W 2685 nt2.67□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 YGR067CYGR067C 2415 nt2.67□□□□□ -1.98
LPX1Q12405 YER053C-AYER053C-A 114 nt2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.2 ms