Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 UBP11YKR098C 2154 nt2.61□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 NUP100YKL068W 2880 nt2.61□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 SSD1YDR293C 3753 nt2.61□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 SVL3YPL032C 2478 nt2.61□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 RAD61YDR014W 1944 nt2.6□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 FMP16YDR070C 282 nt2.6□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 TIM9YEL020W-A 264 nt2.6□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 YIL102CYIL102C 306 nt2.6□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 YNL010WYNL010W 726 nt2.6□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 VPS35YJL154C 2835 nt2.6□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 MLH1YMR167W 2310 nt2.6□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 ARP7YPR034W 1434 nt2.59□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 MCD1YDL003W 1701 nt2.59□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.59□□□□□ -1.99
CLF1Q12309 ATG11YPR049C 3537 nt2.59□□□□□ -2
CLF1Q12309 NCL1YBL024W 2055 nt2.58□□□□□ -2
CLF1Q12309 YDL211CYDL211C 1119 nt2.58□□□□□ -2
CLF1Q12309 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.58□□□□□ -2
CLF1Q12309 ABF2YMR072W 552 nt2.58□□□□□ -2
CLF1Q12309 MDM20YOL076W 2391 nt2.57□□□□□ -2
CLF1Q12309 SMD1YGR074W 441 nt2.57□□□□□ -2
CLF1Q12309 YIL032CYIL032C 357 nt2.57□□□□□ -2
CLF1Q12309 TOF1YNL273W 3717 nt2.57□□□□□ -2
CLF1Q12309 YCK3YER123W 1575 nt2.57□□□□□ -2
CLF1Q12309 UBP1YDL122W 2430 nt2.56□□□□□ -2
CLF1Q12309 RBK1YCR036W 1002 nt2.56□□□□□ -2
CLF1Q12309 NOP10YHR072W-A 177 nt2.56□□□□□ -2
CLF1Q12309 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.56□□□□□ -2
CLF1Q12309 PAU8YAL068C 363 nt2.56□□□□□ -2
CLF1Q12309 YLR294CYLR294C 330 nt2.56□□□□□ -2
CLF1Q12309 PAU20YOL161C 363 nt2.56□□□□□ -2
CLF1Q12309 YBR064WYBR064W 429 nt2.56□□□□□ -2
CLF1Q12309 DAD3YBR233W-A 285 nt2.56□□□□□ -2
CLF1Q12309 snR49snR49 165 nt2.56□□□□□ -2
CLF1Q12309 AFI1YOR129C 2682 nt2.56□□□□□ -2
CLF1Q12309 DOT6YER088C 2013 nt2.56□□□□□ -2
CLF1Q12309 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.55□□□□□ -2
CLF1Q12309 HCS1YKL017C 2052 nt2.55□□□□□ -2
CLF1Q12309 PAN3YKL025C 2040 nt2.55□□□□□ -2
CLF1Q12309 SDH2YLL041C 801 nt2.55□□□□□ -2
CLF1Q12309 RRP6YOR001W 2202 nt2.54□□□□□ -2
CLF1Q12309 YPR097WYPR097W 3222 nt2.54□□□□□ -2
CLF1Q12309 PAM16YJL104W 450 nt2.54□□□□□ -2
CLF1Q12309 SOK2YMR016C 2358 nt2.53□□□□□ -2
CLF1Q12309 SGD1YLR336C 2700 nt2.53□□□□□ -2
CLF1Q12309 RPA34YJL148W 702 nt2.53□□□□□ -2
CLF1Q12309 UPS1YLR193C 528 nt2.53□□□□□ -2
CLF1Q12309 YMR046W-AYMR046W-A 129 nt2.53□□□□□ -2
CLF1Q12309 UTP22YGR090W 3714 nt2.53□□□□□ -2
CLF1Q12309 NPR2YEL062W 1848 nt2.53□□□□□ -2
CLF1Q12309 TAE2YPL009C 3117 nt2.53□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 COG8YML071C 1824 nt2.52□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 PRE4YFR050C 801 nt2.52□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 YIL059CYIL059C 366 nt2.52□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt2.52□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 IES4YOR189W 351 nt2.52□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 GUP1YGL084C 1683 nt2.52□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 RGA1YOR127W 3024 nt2.52□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 SPF1YEL031W 3648 nt2.51□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 YDR406W-AYDR406W-A 246 nt2.51□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 APQ12YIL040W 417 nt2.51□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 RPS27AYKL156W 249 nt2.51□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 YLR053CYLR053C 327 nt2.51□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 SNC2YOR327C 348 nt2.51□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 STH1YIL126W 4080 nt2.51□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 BNI1YNL271C 5862 nt2.5□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 ATP7YKL016C 525 nt2.5□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.5□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt2.5□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 MVP1YMR004W 1536 nt2.5□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 HDA3YPR179C 1968 nt2.5□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 SPO22YIL073C 2928 nt2.49□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 NPC2YDL046W 522 nt2.49□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.49□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 HHT1YBR010W 411 nt2.49□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 NUT2YPR168W 474 nt2.49□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 YCL023CYCL023C 348 nt2.49□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 snR60snR60 104 nt2.48□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 BRP1YGL007W 378 nt2.48□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 RPS17AYML024W 411 nt2.48□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 YMR307C-AYMR307C-A 195 nt2.48□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 YPR063CYPR063C 423 nt2.48□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 YBR224WYBR224W 516 nt2.48□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 TOF2YKR010C 2316 nt2.48□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 UBR1YGR184C 5853 nt2.48□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 FAB1YFR019W 6837 nt2.48□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 NOP53YPL146C 1368 nt2.48□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 STB4YMR019W 2850 nt2.47□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 COS111YBR203W 2775 nt2.47□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 YHL042WYHL042W 453 nt2.47□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 YOR302WYOR302W 78 nt2.47□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 KAP123YER110C 3342 nt2.47□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 CLN3YAL040C 1743 nt2.47□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 SSQ1YLR369W 1974 nt2.47□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 RAV1YJR033C 4074 nt2.47□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 VMR1YHL035C 4779 nt2.46□□□□□ -2.01
CLF1Q12309 TFC3YAL001C 3483 nt2.46□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 DFG16YOR030W 1860 nt2.46□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 RPL38YLR325C 237 nt2.46□□□□□ -2.02
CLF1Q12309 RIM20YOR275C 1986 nt2.46□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 56.8 ms