Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 BIG1YHR101C 1008 nt1.33□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 RPL42BYHR141C 321 nt1.33□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 YJL022WYJL022W 309 nt1.33□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 NOP15YNL110C 663 nt1.33□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 YNL114CYNL114C 372 nt1.33□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 RPL42AYNL162W 321 nt1.33□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 YCL046WYCL046W 324 nt1.33□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 MSS11YMR164C 2277 nt1.33□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 IRE1YHR079C 3348 nt1.33□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 YDR008CYDR008C 351 nt1.32□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 OSH6YKR003W 1347 nt1.32□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 MAD1YGL086W 2250 nt1.31□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 BST1YFL025C 3090 nt1.31□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 YDR509WYDR509W 348 nt1.31□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 YER084W-AYER084W-A 513 nt1.31□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 tQ(UUG)E2tQ(UUG)E2 72 nt1.31□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 VPS55YJR044C 423 nt1.31□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 PBI2YNL015W 228 nt1.31□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 YNL303WYNL303W 348 nt1.31□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt1.31□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 PAN3YKL025C 2040 nt1.31□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 CTF4YPR135W 2784 nt1.31□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 YCS4YLR272C 3531 nt1.3□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.3□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 YGR045CYGR045C 363 nt1.3□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 YLR140WYLR140W 327 nt1.3□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 HHT1YBR010W 411 nt1.3□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 YBR032WYBR032W 303 nt1.3□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 FMP23YBR047W 528 nt1.3□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 MXR1YER042W 555 nt1.29□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 COF1YLL050C 432 nt1.29□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 SEC21YNL287W 2808 nt1.29□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 ZRG17YNR039C 1818 nt1.29□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 HDA3YPR179C 1968 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 YCR001WYCR001W 315 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 EMC5YIL027C 426 nt1.28□□□□□ -2.2
RRP42Q12277 NCA2YPR155C 1851 nt1.27□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 PMD1YER132C 5262 nt1.27□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 DGR2YKL121W 2559 nt1.27□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 YLR422WYLR422W 5799 nt1.27□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 RPL16AYIL133C 600 nt1.26□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 RPL40BYKR094C 387 nt1.26□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 YLR269CYLR269C 351 nt1.26□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 YNL122CYNL122C 348 nt1.26□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 TSC3YBR058C-A 243 nt1.26□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 CDC25YLR310C 4770 nt1.26□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 TOF2YKR010C 2316 nt1.26□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 RPF1YHR088W 888 nt1.25□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 NFU1YKL040C 771 nt1.25□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.25□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 MAK10YEL053C 2202 nt1.25□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 EST2YLR318W 2655 nt1.25□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 FRK1YPL141C 2598 nt1.25□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 PBY1YBR094W 2262 nt1.24□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 RVS161YCR009C 798 nt1.24□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 CDC36YDL165W 576 nt1.24□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.24□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 YGR290WYGR290W 444 nt1.24□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 YML108WYML108W 318 nt1.24□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 IML1YJR138W 4755 nt1.23□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 MSN5YDR335W 3675 nt1.23□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt1.23□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 HIT1YJR055W 495 nt1.23□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 RPL32YBL092W 393 nt1.23□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 YOP1YPR028W 543 nt1.23□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 MDS3YGL197W 4464 nt1.23□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 SPO75YLL005C 2607 nt1.22□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 MVP1YMR004W 1536 nt1.22□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 YHR130CYHR130C 336 nt1.22□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 URM1YIL008W 300 nt1.22□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 AIM29YKR074W 468 nt1.22□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt1.22□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 AHC1YOR023C 1701 nt1.22□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 SWI5YDR146C 2130 nt1.22□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 UFD2YDL190C 2886 nt1.22□□□□□ -2.21
RRP42Q12277 SPO23YBR250W 1572 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 YGR130CYGR130C 2451 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 RSM22YKL155C 1887 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 YGL239CYGL239C 315 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 FYV7YLR068W 456 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 YOL159CYOL159C 516 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 LOA1YPR139C 903 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 NUT1YGL151W 3399 nt1.21□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 MTC7YEL033W 420 nt1.2□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 BI2Q0110 1272 nt1.2□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.19□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 PAU2YEL049W 363 nt1.19□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 YHR125WYHR125W 306 nt1.19□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 NBL1YHR199C-A 222 nt1.19□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.19□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 SMC4YLR086W 4257 nt1.19□□□□□ -2.22
RRP42Q12277 RPL33BYOR234C 324 nt1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 34.2 ms