Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 YDR261W-BYDR261W-B 5313 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 YFL002W-AYFL002W-A 5313 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 YGR161W-BYGR161W-B 5313 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 YLR410W-BYLR410W-B 5313 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 YCL019WYCL019W 5313 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 SMC3YJL074C 3693 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 MNE1YOR350C 1992 nt3.16□□□□□ -1.9
TY1A-BLQ12266 FAS1YKL182W 6156 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 SMY1YKL079W 1971 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 IES6YEL044W 501 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 BOI1YBL085W 2943 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 YPR089WYPR089W 2667 nt3.15□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 SQS1YNL224C 2304 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 UTP14YML093W 2700 nt3.14□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 KAP104YBR017C 2757 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 MDN1YLR106C 14733 nt3.13□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 SBE22YHR103W 2559 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 PRP5YBR237W 2550 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 TCB3YML072C 4638 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 YFL065CYFL065C 309 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 YNL114CYNL114C 372 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 RPS30BYOR182C 192 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 YPR203WYPR203W 309 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 SNT1YCR033W 3681 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 PHO81YGR233C 3537 nt3.12□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 PKH1YDR490C 2301 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 POM152YMR129W 4014 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 UBP14YBR058C 2346 nt3.11□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 UBP11YKR098C 2154 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 RPL42AYNL162W 321 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 CHO2YGR157W 2610 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 LYS14YDR034C 2373 nt3.1□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 NPR3YHL023C 3441 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 RRP5YMR229C 5190 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 YNL266WYNL266W 420 nt3.09□□□□□ -1.91
TY1A-BLQ12266 MYO5YMR109W 3660 nt3.09□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 YEL025CYEL025C 3567 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 AUS1YOR011W 4185 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 DIA2YOR080W 2199 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 PUT3YKL015W 2940 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 BMS1YPL217C 3552 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 VPS3YDR495C 3036 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 YFR016CYFR016C 3702 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 UTP8YGR128C 2142 nt3.08□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 SLD3YGL113W 2007 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 RRP12YPL012W 3687 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 MIT1YEL007W 2001 nt3.07□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 SWI5YDR146C 2130 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 COX12YLR038C 252 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 YKU80YMR106C 1890 nt3.06□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 STE11YLR362W 2154 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 ROG1YGL144C 2058 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 PTP3YER075C 2787 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 QCR9YGR183C 201 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 RPS21AYKR057W 264 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 INP52YNL106C 3552 nt3.05□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 FLO9YAL063C 3969 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 STU2YLR045C 2667 nt3.04□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 EPL1YFL024C 2499 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 FUN30YAL019W 3396 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 GCN1YGL195W 8019 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 SLM1YIL105C 2061 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 SIZ1YDR409W 2715 nt3.03□□□□□ -1.92
TY1A-BLQ12266 YLL054CYLL054C 2532 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 RAD2YGR258C 3096 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 KSP1YHR082C 3090 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 COP1YDL145C 3606 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 RAD4YER162C 2265 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 NOP10YHR072W-A 177 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 IRC8YJL051W 2469 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 YNL018CYNL018C 1839 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 RPA135YPR010C 3612 nt3.02□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 MAK21YDR060W 3078 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 SET2YJL168C 2202 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 RGM1YMR182C 636 nt3.01□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 RTT10YPL183C 3042 nt3□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 RIC1YLR039C 3171 nt3□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 HSH155YMR288W 2916 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 PDR8YLR266C 2106 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 SUP56tL(CAA)A 82 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 SUP53tL(CAA)C 82 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 SUP54tL(CAA)G2 82 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 RAD34YDR314C 2079 nt2.99□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 SCH9YHR205W 2475 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 STE23YLR389C 3084 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 snR76snR76 109 nt2.98□□□□□ -1.93
TY1A-BLQ12266 YGL182CYGL182C 324 nt2.98□□□□□ -1.93
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