Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 YBR032WYBR032W 303 nt1.47□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 UFD2YDL190C 2886 nt1.47□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 CCH1YGR217W 6120 nt1.47□□□□□ -2.17
NFI1Q12216 RVS161YCR009C 798 nt1.46□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 STE18YJR086W 333 nt1.46□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 COA6YMR244C-A 315 nt1.46□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.46□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 snR13snR13 124 nt1.46□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 YOR376WYOR376W 369 nt1.46□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 YCL046WYCL046W 324 nt1.46□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 SWI5YDR146C 2130 nt1.45□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 DGR2YKL121W 2559 nt1.45□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 CDC36YDL165W 576 nt1.45□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.45□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 TSC3YBR058C-A 243 nt1.45□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.45□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 BRR2YER172C 6492 nt1.44□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 ZIP1YDR285W 2628 nt1.44□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 YOR093CYOR093C 4947 nt1.44□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.44□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 PBI2YNL015W 228 nt1.44□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 snR189snR189 189 nt1.44□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 MUK1YPL070W 1839 nt1.44□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 MVP1YMR004W 1536 nt1.44□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 PEX8YGR077C 1770 nt1.44□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 YDR008CYDR008C 351 nt1.43□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 YDR509WYDR509W 348 nt1.43□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.43□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 RPL16AYIL133C 600 nt1.43□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 GPI15YNL038W 690 nt1.43□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 AZF1YOR113W 2745 nt1.43□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.42□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 YGR025WYGR025W 303 nt1.42□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 RPL40BYKR094C 387 nt1.42□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 RSM22YKL155C 1887 nt1.41□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 SEC3YER008C 4011 nt1.41□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 HUR1YGL168W 333 nt1.41□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 YHR130CYHR130C 336 nt1.41□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 SEC5YDR166C 2916 nt1.41□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 RAD9YDR217C 3930 nt1.41□□□□□ -2.18
NFI1Q12216 YDR114CYDR114C 303 nt1.4□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 MTC7YEL033W 420 nt1.4□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 YEL057CYEL057C 702 nt1.4□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.4□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 TIM18YOR297C 579 nt1.4□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 YPR153WYPR153W 423 nt1.4□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 YLL054CYLL054C 2532 nt1.4□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 SGO1YOR073W 1773 nt1.39□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 YCR001WYCR001W 315 nt1.39□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 YOP1YPR028W 543 nt1.39□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 TRM3YDL112W 4311 nt1.39□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 VPS54YDR027C 2670 nt1.38□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 YGL239CYGL239C 315 nt1.38□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 RRT15YLR162W-A 189 nt1.38□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 YSY6YBR162W-A 198 nt1.38□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 NUT1YGL151W 3399 nt1.38□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 SWI6YLR182W 2412 nt1.38□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 KIP1YBL063W 3336 nt1.37□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 YIL102CYIL102C 306 nt1.37□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 RPL9BYNL067W 576 nt1.37□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 ROM2YLR371W 4071 nt1.36□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.36□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 PAU2YEL049W 363 nt1.36□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 PFD1YJL179W 330 nt1.36□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 SPO23YBR250W 1572 nt1.36□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 MKT1YNL085W 2493 nt1.35□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 CAT8YMR280C 4302 nt1.35□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 RAD50YNL250W 3939 nt1.35□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 SMC4YLR086W 4257 nt1.35□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 YGL217CYGL217C 342 nt1.35□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 YHR125WYHR125W 306 nt1.35□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt1.35□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 YPL182CYPL182C 384 nt1.35□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 MAD1YGL086W 2250 nt1.35□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 LYS14YDR034C 2373 nt1.34□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 HIT1YJR055W 495 nt1.34□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 YML108WYML108W 318 nt1.34□□□□□ -2.19
NFI1Q12216 SWI4YER111C 3282 nt1.34□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 PIG1YLR273C 1947 nt1.34□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 NOC3YLR002C 1992 nt1.34□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 GDS1YOR355W 1569 nt1.34□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 YDL211CYDL211C 1119 nt1.33□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.33□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.33□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 URM1YIL008W 300 nt1.33□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt1.33□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 GAL7YBR018C 1101 nt1.33□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 YPR177CYPR177C 372 nt1.33□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 SLX4YLR135W 2247 nt1.33□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 YER076W-AYER076W-A 348 nt1.32□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 YPR063CYPR063C 423 nt1.32□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 NBL1YHR199C-A 222 nt1.31□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 RPS27AYKL156W 249 nt1.31□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 YLR255CYLR255C 354 nt1.31□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 YNL122CYNL122C 348 nt1.31□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 NST1YNL091W 3723 nt1.3□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 SLY1YDR189W 2001 nt1.3□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 YER135CYER135C 393 nt1.3□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 RTR1YER139C 681 nt1.3□□□□□ -2.2
NFI1Q12216 YLR269CYLR269C 351 nt1.3□□□□□ -2.2
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