Protein–RNA interactions for Protein: Q12175

MSH5, MutS protein homolog 5, yeastyeast

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Length 901 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSH5Q12175 CDC31YOR257W 486 nt1.1□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 YPR146CYPR146C 330 nt1.1□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 SPR3YGR059W 1539 nt1.1□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 SGO1YOR073W 1773 nt1.09□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 HNT1YDL125C 477 nt1.09□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt1.09□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 YGL217CYGL217C 342 nt1.09□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 NBP1YLR457C 960 nt1.09□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 RPS18BYML026C 441 nt1.09□□□□□ -2.23
MSH5Q12175 SLX4YLR135W 2247 nt1.09□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.09□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 YJR029WYJR029W 5268 nt1.09□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.09□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt1.08□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 YIL029CYIL029C 429 nt1.08□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 YJR079WYJR079W 330 nt1.08□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 DDR48YMR173W 1293 nt1.08□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 RPL9BYNL067W 576 nt1.08□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 VPS54YDR027C 2670 nt1.08□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 MDS3YGL197W 4464 nt1.08□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 QCR7YDR529C 384 nt1.07□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 YHL037CYHL037C 402 nt1.07□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 YLL020CYLL020C 306 nt1.07□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 MSH3YCR092C 3057 nt1.07□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 NUP188YML103C 4968 nt1.07□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 ZIP1YDR285W 2628 nt1.07□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 SWI5YDR146C 2130 nt1.07□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 snR78snR78 87 nt1.06□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 PAU2YEL049W 363 nt1.06□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 tR(UCU)Q1tR(UCU)Q1 73 nt1.06□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.06□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 CLU1YMR012W 3834 nt1.06□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 YOR248WYOR248W 303 nt1.06□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 YPR099CYPR099C 357 nt1.06□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 SCC2YDR180W 4482 nt1.06□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 YCS4YLR272C 3531 nt1.06□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 GDS1YOR355W 1569 nt1.05□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 GPM2YDL021W 936 nt1.05□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 GMC2YLR445W 567 nt1.05□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 PPN1YDR452W 2025 nt1.05□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 TRM732YMR259C 4263 nt1.04□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 tH(GUG)E1tH(GUG)E1 72 nt1.04□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 tH(GUG)E2tH(GUG)E2 72 nt1.04□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 tH(GUG)G1tH(GUG)G1 72 nt1.04□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 tH(GUG)G2tH(GUG)G2 72 nt1.04□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 tH(GUG)HtH(GUG)H 72 nt1.04□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 tH(GUG)KtH(GUG)K 72 nt1.04□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 tH(GUG)MtH(GUG)M 72 nt1.04□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 ANS1YHR126C 480 nt1.04□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 YBR071WYBR071W 636 nt1.04□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 SWI4YER111C 3282 nt1.04□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 SPT7YBR081C 3999 nt1.04□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 PAN3YKL025C 2040 nt1.04□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 ROM2YLR371W 4071 nt1.04□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 PRE4YFR050C 801 nt1.03□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.03□□□□□ -2.24
MSH5Q12175 DOP1YDR141C 5097 nt1.03□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 BEM2YER155C 6504 nt1.02□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.02□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 YOP1YPR028W 543 nt1.02□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 TOF2YKR010C 2316 nt1.01□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 YDR509WYDR509W 348 nt1.01□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 RTR1YER139C 681 nt1.01□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 NOC3YLR002C 1992 nt1.01□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 SPT21YMR179W 2277 nt1□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 PIP2YOR363C 2991 nt1□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 PRM8YGL053W 714 nt1□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 EMT1tM(CAU)D 73 nt1□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 EMT4tM(CAU)M 73 nt1□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 YBR032WYBR032W 303 nt1□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 NUT1YGL151W 3399 nt0.99□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 BER1YLR412W 825 nt0.99□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 NUP145YGL092W 3954 nt0.99□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 SHE9YDR393W 1371 nt0.98□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 YDR008CYDR008C 351 nt0.98□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt0.98□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt0.98□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 YKL044WYKL044W 321 nt0.98□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 EAF1YDR359C 2949 nt0.98□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 SPO75YLL005C 2607 nt0.98□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 PIG1YLR273C 1947 nt0.97□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 SRP14YDL092W 441 nt0.97□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 YDR114CYDR114C 303 nt0.97□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 IRC16YPR038W 360 nt0.97□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 YPR039WYPR039W 336 nt0.97□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 MKT1YNL085W 2493 nt0.97□□□□□ -2.25
MSH5Q12175 ILM1YJR118C 612 nt0.96□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 YML003WYML003W 873 nt0.96□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 snR14snR14 160 nt0.96□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 YGR130CYGR130C 2451 nt0.96□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 SMC1YFL008W 3678 nt0.95□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 APL3YBL037W 3078 nt0.95□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 AIM44YPL158C 2277 nt0.95□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 MPT5YGL178W 2580 nt0.95□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 SVS1YPL163C 783 nt0.95□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 STB6YKL072W 2301 nt0.95□□□□□ -2.26
MSH5Q12175 SPO23YBR250W 1572 nt0.95□□□□□ -2.26
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