Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.66□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 MAK10YEL053C 2202 nt1.66□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 SSK2YNR031C 4740 nt1.65□□□□□ -2.14
SPE3Q12074 TOF2YKR010C 2316 nt1.65□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 MCM22YJR135C 720 nt1.65□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 AIM29YKR074W 468 nt1.65□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 YNL114CYNL114C 372 nt1.65□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 CDC31YOR257W 486 nt1.65□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 YBR032WYBR032W 303 nt1.65□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 SPO24YPR036W-A 204 nt1.65□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 YPR177CYPR177C 372 nt1.65□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 Q0017Q0017 162 nt1.65□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 snR54snR54 86 nt1.65□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.64□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 ECL1YGR146C 636 nt1.64□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 SYM1YLR251W 594 nt1.63□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.63□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 YLR422WYLR422W 5799 nt1.63□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 OSH6YKR003W 1347 nt1.63□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 HDA3YPR179C 1968 nt1.62□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.62□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 YER135CYER135C 393 nt1.62□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 STF2YGR008C 255 nt1.62□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 KCS1YDR017C 3153 nt1.62□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 MSH5YDL154W 2706 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 BPH1YCR032W 6504 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 URM1YIL008W 300 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 PAU18YLL064C 363 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 PAU6YNR076W 363 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 ATP19YOL077W-A 207 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 PIK1YNL267W 3201 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 VPS15YBR097W 4365 nt1.61□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 PMD1YER132C 5262 nt1.6□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 YDR509WYDR509W 348 nt1.6□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt1.6□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 YCL046WYCL046W 324 nt1.6□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 ZRG17YNR039C 1818 nt1.6□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 YGR130CYGR130C 2451 nt1.59□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 YER076W-AYER076W-A 348 nt1.59□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 HUG1YML058W-A 207 nt1.59□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 HHT1YBR010W 411 nt1.59□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 GAL7YBR018C 1101 nt1.59□□□□□ -2.15
SPE3Q12074 IML1YJR138W 4755 nt1.59□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.59□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 RKM1YPL208W 1752 nt1.59□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 SWI5YDR146C 2130 nt1.58□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 YDR008CYDR008C 351 nt1.58□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 YGL239CYGL239C 315 nt1.58□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 YIL102CYIL102C 306 nt1.58□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 YBR174CYBR174C 315 nt1.58□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 MON2YNL297C 4911 nt1.58□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 BST1YFL025C 3090 nt1.57□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.57□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 NFU1YKL040C 771 nt1.57□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 YPL182CYPL182C 384 nt1.56□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 NCA2YPR155C 1851 nt1.55□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 YER006C-AYER006C-A 318 nt1.55□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 PFD1YJL179W 330 nt1.55□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 YLR456WYLR456W 615 nt1.55□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 ZEO1YOL109W 342 nt1.55□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 ZIP1YDR285W 2628 nt1.54□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 YBP1YBR216C 2025 nt1.54□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 EMC5YIL027C 426 nt1.54□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 CDC33YOL139C 642 nt1.54□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 snR41snR41 95 nt1.54□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 SEC5YDR166C 2916 nt1.53□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 YAR009CYAR009C 3591 nt1.53□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 YLR101CYLR101C 396 nt1.53□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.53□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 TOM22YNL131W 459 nt1.53□□□□□ -2.16
SPE3Q12074 COG4YPR105C 2586 nt1.53□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 MLH3YPL164C 2148 nt1.52□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 YJL022WYJL022W 309 nt1.52□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 RUF22RUF22 515 nt1.52□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 SWI6YLR182W 2412 nt1.52□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 ALK1YGL021W 2283 nt1.52□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 COF1YLL050C 432 nt1.51□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt1.51□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 ERP4YOR016C 624 nt1.51□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 YPL068CYPL068C 882 nt1.51□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 YOP1YPR028W 543 nt1.51□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 SPC98YNL126W 2541 nt1.5□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 MKT1YNL085W 2493 nt1.5□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.5□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 YJL007CYJL007C 315 nt1.5□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 VPS55YJR044C 423 nt1.5□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 YLR140WYLR140W 327 nt1.5□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 RPL32YBL092W 393 nt1.5□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 TTI1YKL033W 3117 nt1.5□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 UBP3YER151C 2739 nt1.5□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 KAP122YGL016W 3246 nt1.49□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 DGR2YKL121W 2559 nt1.49□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.49□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 YBL071CYBL071C 309 nt1.49□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 DIE2YGR227W 1578 nt1.49□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 PET127YOR017W 2403 nt1.49□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 LYS14YDR034C 2373 nt1.48□□□□□ -2.17
SPE3Q12074 SPO23YBR250W 1572 nt1.48□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 79.8 ms