Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 YJR098CYJR098C 1971 nt1.72□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 MKT1YNL085W 2493 nt1.72□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 NOP53YPL146C 1368 nt1.72□□□□□ -2.13
VPS54Q12071 RVS161YCR009C 798 nt1.71□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 YDR008CYDR008C 351 nt1.71□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 YGR265WYGR265W 411 nt1.71□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 YNL114CYNL114C 372 nt1.71□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 CDC33YOL139C 642 nt1.71□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 MDM20YOL076W 2391 nt1.71□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 BRR2YER172C 6492 nt1.71□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 HSL1YKL101W 4557 nt1.7□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.7□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 ANS1YHR126C 480 nt1.7□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt1.7□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.7□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 RLM1YPL089C 2031 nt1.69□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 KCS1YDR017C 3153 nt1.69□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 YDR509WYDR509W 348 nt1.69□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 YPL182CYPL182C 384 nt1.69□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 DIE2YGR227W 1578 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 RPL42BYHR141C 321 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 RUF22RUF22 515 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 RPL42AYNL162W 321 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 YNL324WYNL324W 396 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 FMP23YBR047W 528 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 IRE1YHR079C 3348 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 MSH5YDL154W 2706 nt1.68□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 PAU18YLL064C 363 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 PAU6YNR076W 363 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 YOR146WYOR146W 306 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 HDA3YPR179C 1968 nt1.67□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 YOR019WYOR019W 2193 nt1.66□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.66□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 GDS1YOR355W 1569 nt1.66□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 SKI3YPR189W 4299 nt1.66□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 SBE22YHR103W 2559 nt1.65□□□□□ -2.14
VPS54Q12071 SFB2YNL049C 2631 nt1.65□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 RPL31AYDL075W 342 nt1.65□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 TRX1YLR043C 312 nt1.65□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 YLR287CYLR287C 1068 nt1.65□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt1.65□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 UBC7YMR022W 498 nt1.65□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 YOR093CYOR093C 4947 nt1.65□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 ZRG17YNR039C 1818 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 YHL037CYHL037C 402 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 MCM22YJR135C 720 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 YBL071CYBL071C 309 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 RPL32YBL092W 393 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 MRPL50YNR022C 420 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 SPO24YPR036W-A 204 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 MAK10YEL053C 2202 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 DNF3YMR162C 4971 nt1.64□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 YCS4YLR272C 3531 nt1.63□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 CBS1YDL069C 690 nt1.63□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 RTT102YGR275W 474 nt1.63□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt1.63□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 PRM3YPL192C 402 nt1.63□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 OSH6YKR003W 1347 nt1.63□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 HMI1YOL095C 2121 nt1.63□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.62□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 YLR222C-AYLR222C-A 231 nt1.62□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 YCL046WYCL046W 324 nt1.62□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 CAT8YMR280C 4302 nt1.62□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 SDH7YDR511W 402 nt1.61□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 RKM1YPL208W 1752 nt1.61□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 NUP192YJL039C 5052 nt1.61□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 MEC1YBR136W 7107 nt1.61□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 IRA1YBR140C 9279 nt1.6□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 YDL011CYDL011C 324 nt1.6□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 HIT1YJR055W 495 nt1.6□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.6□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 HHT1YBR010W 411 nt1.6□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 FRK1YPL141C 2598 nt1.59□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 SWI5YDR146C 2130 nt1.59□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 RPS24BYIL069C 408 nt1.59□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 PFD1YJL179W 330 nt1.59□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 YJR157WYJR157W 363 nt1.59□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 CDC31YOR257W 486 nt1.59□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 YPR177CYPR177C 372 nt1.59□□□□□ -2.15
VPS54Q12071 PHS1YJL097W 654 nt1.58□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 SPO23YBR250W 1572 nt1.58□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 CTF4YPR135W 2784 nt1.58□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 SXM1YDR395W 2835 nt1.57□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 WIP1YDR374W-A 270 nt1.57□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 RTR1YER139C 681 nt1.57□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 AGA2YGL032C 264 nt1.57□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 EMC5YIL027C 426 nt1.57□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 YIL102CYIL102C 306 nt1.57□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 YBR174CYBR174C 315 nt1.57□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 PXA2YKL188C 2562 nt1.56□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 YGR042WYGR042W 816 nt1.56□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 TIM13YGR181W 318 nt1.56□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 YOP1YPR028W 543 nt1.56□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 SPC110YDR356W 2835 nt1.56□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 LYS14YDR034C 2373 nt1.56□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 DCP2YNL118C 2913 nt1.56□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 KAP122YGL016W 3246 nt1.55□□□□□ -2.16
VPS54Q12071 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt1.55□□□□□ -2.16
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