Protein–RNA interactions for Protein: Q08972

NEW1, [NU+] prion formation protein 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEW1Q08972 RKM1YPL208W 1752 nt2.47□□□□□ -2.01
NEW1Q08972 YDL041WYDL041W 354 nt2.47□□□□□ -2.01
NEW1Q08972 MCD1YDL003W 1701 nt2.47□□□□□ -2.01
NEW1Q08972 IRC8YJL051W 2469 nt2.47□□□□□ -2.01
NEW1Q08972 SEC16YPL085W 6588 nt2.46□□□□□ -2.01
NEW1Q08972 RPA34YJL148W 702 nt2.46□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 YMR324CYMR324C 243 nt2.46□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 TFC3YAL001C 3483 nt2.46□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 DNF1YER166W 4716 nt2.46□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 COX1Q0045 1605 nt2.46□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 ARP7YPR034W 1434 nt2.45□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 SDH2YLL041C 801 nt2.45□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt2.45□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 SAP190YKR028W 3102 nt2.45□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 NPR2YEL062W 1848 nt2.45□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 RAV1YJR033C 4074 nt2.44□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 VPS41YDR080W 2979 nt2.44□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 YSW1YBR148W 1830 nt2.44□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 SCP160YJL080C 3669 nt2.44□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 YDR344CYDR344C 444 nt2.43□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 YGL149WYGL149W 306 nt2.43□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 TAR1YLR154W-C 375 nt2.43□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 YNL205CYNL205C 423 nt2.43□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 YOR170WYOR170W 306 nt2.43□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 snR49snR49 165 nt2.43□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 HCS1YKL017C 2052 nt2.43□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 CRM1YGR218W 3255 nt2.43□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 YDL211CYDL211C 1119 nt2.42□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 DAD4YDR320C-A 219 nt2.42□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 RTC6YPL183W-A 282 nt2.42□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 YBR064WYBR064W 429 nt2.42□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 DAD3YBR233W-A 285 nt2.42□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 SIR4YDR227W 4077 nt2.42□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 SAP185YJL098W 3177 nt2.42□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 VPS35YJL154C 2835 nt2.41□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 RTT107YHR154W 3213 nt2.41□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 snR79snR79 84 nt2.41□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 YNL170WYNL170W 396 nt2.41□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 SNC2YOR327C 348 nt2.41□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 YOR333CYOR333C 417 nt2.41□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 MSS11YMR164C 2277 nt2.41□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 VPH1YOR270C 2523 nt2.41□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 SPO22YIL073C 2928 nt2.41□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 IRA2YOL081W 9240 nt2.4□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 RAD61YDR014W 1944 nt2.4□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 CSF1YLR087C 8877 nt2.4□□□□□ -2.02
NEW1Q08972 IST2YBR086C 2841 nt2.4□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 LSO2YGR169C-A 279 nt2.4□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt2.4□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 YOR302WYOR302W 78 nt2.4□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 SGO1YOR073W 1773 nt2.4□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 GIP3YPL137C 3831 nt2.4□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 UBP15YMR304W 3693 nt2.39□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 HTL1YCR020W-B 237 nt2.39□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 YDR048CYDR048C 315 nt2.39□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.39□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 RIC1YLR039C 3171 nt2.39□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 MNE1YOR350C 1992 nt2.39□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 DBP6YNR038W 1890 nt2.39□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 APL5YPL195W 2799 nt2.38□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 YDL011CYDL011C 324 nt2.38□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 YJL150WYJL150W 303 nt2.38□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 TMA22YJR014W 597 nt2.38□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt2.38□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt2.38□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 KAR3YPR141C 2190 nt2.38□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 CDC24YAL041W 2565 nt2.38□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 TRS65YGR166W 1683 nt2.37□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 SGD1YLR336C 2700 nt2.37□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 RTT101YJL047C 2529 nt2.37□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 TRL1YJL087C 2484 nt2.36□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 VTC3YPL019C 2508 nt2.36□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 YDR286CYDR286C 345 nt2.36□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 RPS24AYER074W 408 nt2.36□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 YER121WYER121W 345 nt2.36□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 RPS18BYML026C 441 nt2.36□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 DGR1YNL130C-A 147 nt2.36□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 RPL32YBL092W 393 nt2.36□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 SEC31YDL195W 3822 nt2.36□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 VPS8YAL002W 3825 nt2.35□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 UBP2YOR124C 3819 nt2.35□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 GRR1YJR090C 3456 nt2.35□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 UTP22YGR090W 3714 nt2.35□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.35□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 MGM1YOR211C 2646 nt2.35□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 CDC27YBL084C 2277 nt2.34□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 YDL185C-AYDL185C-A 228 nt2.34□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.34□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.34□□□□□ -2.03
NEW1Q08972 YLR053CYLR053C 327 nt2.33□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 MVP1YMR004W 1536 nt2.32□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 CDC60YPL160W 3273 nt2.32□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 TOF1YNL273W 3717 nt2.32□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 YGL069CYGL069C 465 nt2.32□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt2.32□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.32□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 YJL135WYJL135W 318 nt2.32□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.32□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 HTB2YBL002W 396 nt2.32□□□□□ -2.04
NEW1Q08972 YPR146CYPR146C 330 nt2.32□□□□□ -2.04
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