Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 PAN3YKL025C 2040 nt2.01□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 VPS34YLR240W 2628 nt2.01□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 GNT1YOR320C 1476 nt2.01□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 RTP1YMR185W 2946 nt2.01□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 PDR8YLR266C 2106 nt2□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 YDR269CYDR269C 324 nt2□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 RPS24BYIL069C 408 nt2□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 YOL159CYOL159C 516 nt2□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 YPL182CYPL182C 384 nt2□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 DAS1YJL149W 1992 nt1.99□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 BTT1YDR252W 450 nt1.99□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 YGL239CYGL239C 315 nt1.99□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.99□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 YPL238CYPL238C 390 nt1.99□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 RTT102YGR275W 474 nt1.98□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 CGI121YML036W 546 nt1.98□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 YOR146WYOR146W 306 nt1.98□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 TOF2YKR010C 2316 nt1.98□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 HCS1YKL017C 2052 nt1.98□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 LRE1YCL051W 1752 nt1.98□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 MGA2YIR033W 3342 nt1.97□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 snR56snR56 88 nt1.97□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 YHR138CYHR138C 345 nt1.97□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 YPL185WYPL185W 396 nt1.97□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.97□□□□□ -2.09
CTI6Q08923 SWF1YDR126W 1011 nt1.96□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 YDR157WYDR157W 402 nt1.96□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 YHR071C-AYHR071C-A 321 nt1.96□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 RPL42BYHR141C 321 nt1.96□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 RPL42AYNL162W 321 nt1.96□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 IRR1YIL026C 3453 nt1.96□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 SPO23YBR250W 1572 nt1.96□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 CFT2YLR115W 2580 nt1.96□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 UBR2YLR024C 5619 nt1.95□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 TFC8YPL007C 1767 nt1.95□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.94□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 RPA34YJL148W 702 nt1.94□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 YLR334CYLR334C 381 nt1.94□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 YOR053WYOR053W 342 nt1.94□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 YBR285WYBR285W 435 nt1.94□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 YDL011CYDL011C 324 nt1.93□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.93□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 YLR434CYLR434C 384 nt1.93□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.92□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.92□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 YNL114CYNL114C 372 nt1.92□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 YPL261CYPL261C 309 nt1.92□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 YLR419WYLR419W 4308 nt1.91□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 SEC63YOR254C 1992 nt1.91□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 YBL073WYBL073W 312 nt1.91□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 GCN2YDR283C 4980 nt1.91□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 BRR2YER172C 6492 nt1.91□□□□□ -2.1
CTI6Q08923 YDR008CYDR008C 351 nt1.9□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 ATG31YDR022C 591 nt1.9□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.9□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 PFD1YJL179W 330 nt1.9□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 TMA7YLR262C-A 195 nt1.9□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 BSC3YLR465C 309 nt1.9□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 RPL32YBL092W 393 nt1.9□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 FMP23YBR047W 528 nt1.9□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 AGC1YPR021C 2709 nt1.9□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 YGR250CYGR250C 2346 nt1.89□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 WIP1YDR374W-A 270 nt1.89□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.89□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 IRE1YHR079C 3348 nt1.89□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 DNF3YMR162C 4971 nt1.89□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 MYO2YOR326W 4725 nt1.88□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 GIM4YEL003W 336 nt1.88□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 TIM13YGR181W 318 nt1.88□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 RPS27AYKL156W 249 nt1.88□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.88□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 YAR047CYAR047C 321 nt1.88□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 RPL9BYNL067W 576 nt1.88□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 YPR012WYPR012W 255 nt1.88□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 CTR9YOL145C 3234 nt1.88□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 TDA9YML081W 3756 nt1.87□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 MSC6YOR354C 2079 nt1.87□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 CHS1YNL192W 3396 nt1.87□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 ABM1YJR108W 372 nt1.87□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 YJR039WYJR039W 3366 nt1.87□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 PMD1YER132C 5262 nt1.87□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 HDA3YPR179C 1968 nt1.87□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 DFG16YOR030W 1860 nt1.86□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 CAT8YMR280C 4302 nt1.86□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 Q0142Q0142 177 nt1.86□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.86□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 MCM22YJR135C 720 nt1.86□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 PAU18YLL064C 363 nt1.86□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.86□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 PAU6YNR076W 363 nt1.86□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 HIR3YJR140C 4947 nt1.86□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 SWI5YDR146C 2130 nt1.85□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 MDM20YOL076W 2391 nt1.85□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 PHS1YJL097W 654 nt1.85□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt1.85□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 YCL046WYCL046W 324 nt1.85□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 UTP21YLR409C 2820 nt1.85□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 YGR130CYGR130C 2451 nt1.84□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 AIM9YER080W 1884 nt1.84□□□□□ -2.11
CTI6Q08923 PAC1YOR269W 1485 nt1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.6 ms