Protein–RNA interactions for Protein: Q07660

BRE4, Protein BRE4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRE4Q07660 PAA1YDR071C 576 nt2.93□□□□□ -1.94
BRE4Q07660 EMC6YLL014W 327 nt2.93□□□□□ -1.94
BRE4Q07660 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt2.93□□□□□ -1.94
BRE4Q07660 COS111YBR203W 2775 nt2.93□□□□□ -1.94
BRE4Q07660 NUP120YKL057C 3114 nt2.93□□□□□ -1.94
BRE4Q07660 NAB3YPL190C 2409 nt2.92□□□□□ -1.94
BRE4Q07660 RLI1YDR091C 1827 nt2.92□□□□□ -1.94
BRE4Q07660 RPB10YOR210W 213 nt2.92□□□□□ -1.94
BRE4Q07660 snR45snR45 172 nt2.92□□□□□ -1.94
BRE4Q07660 TFC4YGR047C 3078 nt2.91□□□□□ -1.94
BRE4Q07660 ZRG17YNR039C 1818 nt2.91□□□□□ -1.94
BRE4Q07660 PSO2YMR137C 1986 nt2.91□□□□□ -1.94
BRE4Q07660 YNL211CYNL211C 261 nt2.91□□□□□ -1.94
BRE4Q07660 FIR1YER032W 2631 nt2.91□□□□□ -1.94
BRE4Q07660 SSN2YDR443C 4263 nt2.9□□□□□ -1.94
BRE4Q07660 CAF120YNL278W 3183 nt2.9□□□□□ -1.94
BRE4Q07660 SGD1YLR336C 2700 nt2.9□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 PMR1YGL167C 2853 nt2.9□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 86 nt2.9□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 YIL174WYIL174W 228 nt2.9□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.9□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 DNL4YOR005C 2835 nt2.9□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 INP52YNL106C 3552 nt2.9□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 ATP7YKL016C 525 nt2.89□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 VMA9YCL005W-A 222 nt2.89□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 VPH1YOR270C 2523 nt2.89□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 ELG1YOR144C 2376 nt2.89□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 ESL1YIL151C 3357 nt2.87□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 NMD2YHR077C 3270 nt2.87□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 YBT1YLL048C 4986 nt2.87□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 MDM1YML104C 3384 nt2.87□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 snR76snR76 109 nt2.87□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 OST4YDL232W 111 nt2.87□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 YGR050CYGR050C 357 nt2.87□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt2.86□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 GRX8YLR364W 330 nt2.86□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 YBR174CYBR174C 315 nt2.86□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 SRB8YCR081W 4284 nt2.86□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 VPS34YLR240W 2628 nt2.86□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 FLO5YHR211W 3228 nt2.85□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 HAL9YOL089C 3093 nt2.85□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 AKR1YDR264C 2295 nt2.85□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 YDL196WYDL196W 330 nt2.85□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 HYP2YEL034W 474 nt2.85□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 PNC1YGL037C 651 nt2.85□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.85□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 MPH1YIR002C 2982 nt2.85□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 AHC1YOR023C 1701 nt2.85□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 UTP14YML093W 2700 nt2.84□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 YLR149CYLR149C 2193 nt2.84□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 NCA2YPR155C 1851 nt2.84□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 YHR080CYHR080C 4038 nt2.84□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.84□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.84□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 YDR239CYDR239C 2364 nt2.84□□□□□ -1.95
BRE4Q07660 PFF1YBR074W 2931 nt2.83□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 SPO75YLL005C 2607 nt2.83□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.83□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.83□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.83□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.83□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.83□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.83□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.83□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 tL(UAA)QtL(UAA)Q 85 nt2.83□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 CMC4YMR194C-B 222 nt2.83□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 CDC31YOR257W 486 nt2.83□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 RIF1YBR275C 5751 nt2.83□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 PXA2YKL188C 2562 nt2.83□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 SPO14YKR031C 5052 nt2.83□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 GRR1YJR090C 3456 nt2.82□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 SNQ2YDR011W 4506 nt2.82□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt2.82□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt2.82□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 CRS5YOR031W 210 nt2.82□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 PEP3YLR148W 2757 nt2.81□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 SAK1YER129W 3429 nt2.81□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 YPL044CYPL044C 549 nt2.81□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 RPL33AYPL143W 324 nt2.81□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 ROG1YGL144C 2058 nt2.81□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 SEC7YDR170C 6030 nt2.81□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 APL5YPL195W 2799 nt2.8□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 YIL080WYIL080W 4722 nt2.8□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 IKI3YLR384C 4050 nt2.8□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.8□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 VPS35YJL154C 2835 nt2.8□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 SLH1YGR271W 5904 nt2.8□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 FIG4YNL325C 2640 nt2.79□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 NPR3YHL023C 3441 nt2.79□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 snR62snR62 100 nt2.79□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 YBR206WYBR206W 324 nt2.79□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 NIP100YPL174C 2607 nt2.79□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 SPC98YNL126W 2541 nt2.79□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 NOC3YLR002C 1992 nt2.78□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 MOT1YPL082C 5604 nt2.78□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 YCL046WYCL046W 324 nt2.78□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 SEF1YBL066C 3447 nt2.78□□□□□ -1.96
BRE4Q07660 STE6YKL209C 3873 nt2.77□□□□□ -1.97
BRE4Q07660 RGM1YMR182C 636 nt2.77□□□□□ -1.97
BRE4Q07660 SIN3YOL004W 4611 nt2.77□□□□□ -1.97
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