Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 SCC2YDR180W 4482 nt0.87□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YDL152WYDL152W 366 nt0.86□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 NBP1YLR457C 960 nt0.86□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 RPS18BYML026C 441 nt0.86□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 POP7YBR167C 423 nt0.86□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YGR115CYGR115C 780 nt0.85□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YPT6YLR262C 648 nt0.85□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.85□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 SWS2YNL081C 432 nt0.85□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YPL197CYPL197C 414 nt0.85□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 PAU24YBR301W 363 nt0.85□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 IML1YJR138W 4755 nt0.85□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 SNO3YFL060C 669 nt0.84□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 YGL230CYGL230C 444 nt0.84□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 SNO2YNL334C 669 nt0.84□□□□□ -2.27
YMR226CQ05016 BI4Q0120 1917 nt0.83□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 YGR130CYGR130C 2451 nt0.83□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 CDC24YAL041W 2565 nt0.83□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 PRM8YGL053W 714 nt0.83□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 YAL066WYAL066W 309 nt0.83□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 YML003WYML003W 873 nt0.83□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 YNL146C-AYNL146C-A 195 nt0.83□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 YOP1YPR028W 543 nt0.83□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 DCP2YNL118C 2913 nt0.83□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.82□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 YDR220CYDR220C 294 nt0.82□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 YGL109WYGL109W 324 nt0.82□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 YGR045CYGR045C 363 nt0.82□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 YBR012CYBR012C 420 nt0.82□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 snR83snR83 306 nt0.81□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 AIM9YER080W 1884 nt0.81□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 YDL073WYDL073W 2955 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 NOC3YLR002C 1992 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 snR5snR5 204 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 SRP14YDL092W 441 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 QCR7YDR529C 384 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 YBR063CYBR063C 1215 nt0.8□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 PIG1YLR273C 1947 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 NUP157YER105C 4176 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 ZIP1YDR285W 2628 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 YPR117WYPR117W 7470 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 CYC7YEL039C 342 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 YKL111CYKL111C 336 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 TOF2YKR010C 2316 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 MPT5YGL178W 2580 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 SWI5YDR146C 2130 nt0.79□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 YGL015CYGL015C 393 nt0.78□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 MND1YGL183C 660 nt0.78□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 YGR228WYGR228W 345 nt0.78□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 SDS22YKL193C 1017 nt0.78□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 YPR096CYPR096C 303 nt0.78□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt0.78□□□□□ -2.28
YMR226CQ05016 DOP1YDR141C 5097 nt0.78□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 SET3YKR029C 2256 nt0.77□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 UTP13YLR222C 2454 nt0.77□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 RPC10YHR143W-A 213 nt0.77□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 YLR198CYLR198C 360 nt0.77□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 NUT2YPR168W 474 nt0.77□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 YCL002CYCL002C 792 nt0.77□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 GUP1YGL084C 1683 nt0.77□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 HNT1YDL125C 477 nt0.76□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 YDR509WYDR509W 348 nt0.76□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 YLR271WYLR271W 825 nt0.76□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 YMR254CYMR254C 309 nt0.76□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 YPR099CYPR099C 357 nt0.76□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 PRP16YKR086W 3216 nt0.75□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 SEC1YDR164C 2175 nt0.75□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 YAP3YHL009C 993 nt0.75□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 ANS1YHR126C 480 nt0.75□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 RPL16AYIL133C 600 nt0.75□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 RUF22RUF22 515 nt0.75□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 YNL050CYNL050C 813 nt0.75□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 CSM4YPL200W 471 nt0.75□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 YDR008CYDR008C 351 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 HIT1YJR055W 495 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.74□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 MKT1YNL085W 2493 nt0.73□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 PAN3YKL025C 2040 nt0.73□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 YLR285C-AYLR285C-A 171 nt0.73□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.73□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.73□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 GRX5YPL059W 453 nt0.73□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.73□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 SPO23YBR250W 1572 nt0.72□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 YEL057CYEL057C 702 nt0.72□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.72□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 SCEIQ0160 708 nt0.72□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 DCP1YOL149W 696 nt0.72□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 YOR199WYOR199W 330 nt0.72□□□□□ -2.29
YMR226CQ05016 YDL206WYDL206W 2289 nt0.71□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 snR9snR9 187 nt0.71□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 RTT102YGR275W 474 nt0.71□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 YJR087WYJR087W 351 nt0.71□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 ALY2YJL084C 3141 nt0.7□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 YDL187CYDL187C 330 nt0.7□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 YDL196WYDL196W 330 nt0.7□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 YDR114CYDR114C 303 nt0.7□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 MXR1YER042W 555 nt0.7□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 SPO11YHL022C 1197 nt0.7□□□□□ -2.3
YMR226CQ05016 YJR079WYJR079W 330 nt0.7□□□□□ -2.3
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 45.3 ms