Protein–RNA interactions for Protein: Q04235

TRM12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2, yeastyeast

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM12Q04235 NST1YNL091W 3723 nt1.03□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 YGR265WYGR265W 411 nt1.03□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 VPS55YJR044C 423 nt1.03□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 ABM1YJR108W 372 nt1.03□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 FCF2YLR051C 654 nt1.03□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 HUG1YML058W-A 207 nt1.03□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 SWT1YOR166C 1377 nt1.03□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 MVP1YMR004W 1536 nt1.03□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 YJR029WYJR029W 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.03□□□□□ -2.24
TRM12Q04235 ROM2YLR371W 4071 nt1.03□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 AZF1YOR113W 2745 nt1.02□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.02□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 GAL7YBR018C 1101 nt1.02□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 YOR376WYOR376W 369 nt1.02□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 SLM6YBR266C 453 nt1.02□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 EMC5YIL027C 426 nt1.01□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 RPL34BYIL052C 366 nt1.01□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 SWS2YNL081C 432 nt1.01□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 YCS4YLR272C 3531 nt1.01□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 DGR2YKL121W 2559 nt1.01□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 GMC2YLR445W 567 nt1□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 NOP15YNL110C 663 nt1□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 YPR146CYPR146C 330 nt1□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 YCL046WYCL046W 324 nt1□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 VAM6YDL077C 3150 nt1□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 APL1YJR005W 2103 nt1□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 UFD2YDL190C 2886 nt0.99□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 CDC24YAL041W 2565 nt0.99□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 YFL012WYFL012W 447 nt0.99□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 YJR079WYJR079W 330 nt0.99□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 PPN1YDR452W 2025 nt0.98□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 RAD50YNL250W 3939 nt0.98□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.98□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 DDR48YMR173W 1293 nt0.98□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 SWI5YDR146C 2130 nt0.97□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.97□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 RPS18BYML026C 441 nt0.97□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 CTK3YML112W 891 nt0.97□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 YNL114CYNL114C 372 nt0.97□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 TIM18YOR297C 579 nt0.97□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 HDA3YPR179C 1968 nt0.97□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 SCC2YDR180W 4482 nt0.97□□□□□ -2.25
TRM12Q04235 YLL054CYLL054C 2532 nt0.96□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 ZRG17YNR039C 1818 nt0.96□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 PRM8YGL053W 714 nt0.96□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.96□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.96□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.96□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.96□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 PAU18YLL064C 363 nt0.96□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 BER1YLR412W 825 nt0.96□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.96□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 PAU6YNR076W 363 nt0.96□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 YPR063CYPR063C 423 nt0.96□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 ZIP1YDR285W 2628 nt0.95□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 MUK1YPL070W 1839 nt0.95□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 YDL152WYDL152W 366 nt0.95□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 YDL211CYDL211C 1119 nt0.95□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 QCR7YDR529C 384 nt0.95□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 SGO1YOR073W 1773 nt0.95□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 YGL217CYGL217C 342 nt0.94□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 YKL123WYKL123W 381 nt0.94□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 RPL40BYKR094C 387 nt0.94□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 RPL9BYNL067W 576 nt0.94□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 SVS1YPL163C 783 nt0.94□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 YBR071WYBR071W 636 nt0.94□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 YPR099CYPR099C 357 nt0.94□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.94□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 SLX4YLR135W 2247 nt0.94□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 BUD3YCL014W 4911 nt0.94□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 DOP1YDR141C 5097 nt0.94□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 PAN3YKL025C 2040 nt0.93□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 GDS1YOR355W 1569 nt0.93□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 OCA6YDR067C 675 nt0.93□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 ILM1YJR118C 612 nt0.93□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 YKL044WYKL044W 321 nt0.93□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 YOR248WYOR248W 303 nt0.93□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 IRC16YPR038W 360 nt0.93□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 NUP188YML103C 4968 nt0.93□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 CLU1YMR012W 3834 nt0.93□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 VPS54YDR027C 2670 nt0.92□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 UBP3YER151C 2739 nt0.92□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 PAU2YEL049W 363 nt0.92□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.92□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.92□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 COG4YPR105C 2586 nt0.92□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 TOF2YKR010C 2316 nt0.92□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 SPR3YGR059W 1539 nt0.91□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 MET32YDR253C 576 nt0.91□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt0.91□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 YBR032WYBR032W 303 nt0.91□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 YPR039WYPR039W 336 nt0.91□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 YPR117WYPR117W 7470 nt0.91□□□□□ -2.26
TRM12Q04235 SRP14YDL092W 441 nt0.9□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.9□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.9□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 UBX4YMR067C 1251 nt0.9□□□□□ -2.27
TRM12Q04235 YOP1YPR028W 543 nt0.9□□□□□ -2.27
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