Protein–RNA interactions for Protein: Q04007

SND1, SRP-independent targeting protein 1, yeastyeast

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Length 877 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SND1Q04007 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt2.39□□□□□ -2.03
SND1Q04007 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.39□□□□□ -2.03
SND1Q04007 BIL1YOR304C-A 231 nt2.39□□□□□ -2.03
SND1Q04007 GIP3YPL137C 3831 nt2.38□□□□□ -2.03
SND1Q04007 YDL062WYDL062W 426 nt2.38□□□□□ -2.03
SND1Q04007 RPS27AYKL156W 249 nt2.38□□□□□ -2.03
SND1Q04007 AIM9YER080W 1884 nt2.37□□□□□ -2.03
SND1Q04007 CSF1YLR087C 8877 nt2.37□□□□□ -2.03
SND1Q04007 PEX4YGR133W 552 nt2.37□□□□□ -2.03
SND1Q04007 YAR029WYAR029W 225 nt2.37□□□□□ -2.03
SND1Q04007 snR36snR36 182 nt2.37□□□□□ -2.03
SND1Q04007 BUD2YKL092C 3315 nt2.37□□□□□ -2.03
SND1Q04007 UBP1YDL122W 2430 nt2.37□□□□□ -2.03
SND1Q04007 RPL37BYDR500C 267 nt2.36□□□□□ -2.03
SND1Q04007 TIM13YGR181W 318 nt2.36□□□□□ -2.03
SND1Q04007 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.36□□□□□ -2.03
SND1Q04007 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.36□□□□□ -2.03
SND1Q04007 SAP190YKR028W 3102 nt2.36□□□□□ -2.03
SND1Q04007 TFC8YPL007C 1767 nt2.36□□□□□ -2.03
SND1Q04007 ALK2YBL009W 2031 nt2.35□□□□□ -2.03
SND1Q04007 CAT2YML042W 2013 nt2.35□□□□□ -2.03
SND1Q04007 snR8snR8 190 nt2.35□□□□□ -2.03
SND1Q04007 SEC16YPL085W 6588 nt2.35□□□□□ -2.03
SND1Q04007 HER1YOR227W 3741 nt2.35□□□□□ -2.03
SND1Q04007 SPF1YEL031W 3648 nt2.35□□□□□ -2.03
SND1Q04007 DFG16YOR030W 1860 nt2.35□□□□□ -2.03
SND1Q04007 VMR1YHL035C 4779 nt2.34□□□□□ -2.03
SND1Q04007 VTC1YER072W 390 nt2.34□□□□□ -2.03
SND1Q04007 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.34□□□□□ -2.03
SND1Q04007 YBL073WYBL073W 312 nt2.34□□□□□ -2.03
SND1Q04007 OST1YJL002C 1431 nt2.34□□□□□ -2.04
SND1Q04007 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.33□□□□□ -2.04
SND1Q04007 HMRA2YCR096C 360 nt2.33□□□□□ -2.04
SND1Q04007 YPL229WYPL229W 621 nt2.33□□□□□ -2.04
SND1Q04007 IRA2YOL081W 9240 nt2.32□□□□□ -2.04
SND1Q04007 WIP1YDR374W-A 270 nt2.32□□□□□ -2.04
SND1Q04007 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt2.32□□□□□ -2.04
SND1Q04007 RPA34YJL148W 702 nt2.32□□□□□ -2.04
SND1Q04007 TMA10YLR327C 261 nt2.32□□□□□ -2.04
SND1Q04007 RPL26AYLR344W 384 nt2.32□□□□□ -2.04
SND1Q04007 IRC23YOR044W 474 nt2.32□□□□□ -2.04
SND1Q04007 STE5YDR103W 2754 nt2.32□□□□□ -2.04
SND1Q04007 PCF11YDR228C 1881 nt2.31□□□□□ -2.04
SND1Q04007 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.31□□□□□ -2.04
SND1Q04007 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.31□□□□□ -2.04
SND1Q04007 HHT1YBR010W 411 nt2.31□□□□□ -2.04
SND1Q04007 ARP7YPR034W 1434 nt2.31□□□□□ -2.04
SND1Q04007 PEX8YGR077C 1770 nt2.31□□□□□ -2.04
SND1Q04007 PLC1YPL268W 2610 nt2.3□□□□□ -2.04
SND1Q04007 COS111YBR203W 2775 nt2.3□□□□□ -2.04
SND1Q04007 ATG9YDL149W 2994 nt2.3□□□□□ -2.04
SND1Q04007 TFC3YAL001C 3483 nt2.3□□□□□ -2.04
SND1Q04007 SEC31YDL195W 3822 nt2.3□□□□□ -2.04
SND1Q04007 GCN4YEL009C 846 nt2.3□□□□□ -2.04
SND1Q04007 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt2.3□□□□□ -2.04
SND1Q04007 YNL114CYNL114C 372 nt2.3□□□□□ -2.04
SND1Q04007 YBP1YBR216C 2025 nt2.29□□□□□ -2.04
SND1Q04007 RPS24AYER074W 408 nt2.29□□□□□ -2.04
SND1Q04007 ISF1YMR081C 1017 nt2.29□□□□□ -2.04
SND1Q04007 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.29□□□□□ -2.04
SND1Q04007 RPL39YJL189W 156 nt2.28□□□□□ -2.04
SND1Q04007 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.28□□□□□ -2.04
SND1Q04007 RPL32YBL092W 393 nt2.28□□□□□ -2.04
SND1Q04007 TOF1YNL273W 3717 nt2.28□□□□□ -2.05
SND1Q04007 GUP1YGL084C 1683 nt2.28□□□□□ -2.05
SND1Q04007 UTP22YGR090W 3714 nt2.27□□□□□ -2.05
SND1Q04007 DAD4YDR320C-A 219 nt2.27□□□□□ -2.05
SND1Q04007 RPL42BYHR141C 321 nt2.27□□□□□ -2.05
SND1Q04007 YIL059CYIL059C 366 nt2.27□□□□□ -2.05
SND1Q04007 PHS1YJL097W 654 nt2.27□□□□□ -2.05
SND1Q04007 RPL42AYNL162W 321 nt2.27□□□□□ -2.05
SND1Q04007 SWI6YLR182W 2412 nt2.26□□□□□ -2.05
SND1Q04007 YER088C-AYER088C-A 324 nt2.26□□□□□ -2.05
SND1Q04007 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.26□□□□□ -2.05
SND1Q04007 MCM22YJR135C 720 nt2.26□□□□□ -2.05
SND1Q04007 SEY1YOR165W 2331 nt2.25□□□□□ -2.05
SND1Q04007 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt2.25□□□□□ -2.05
SND1Q04007 HCH1YNL281W 462 nt2.25□□□□□ -2.05
SND1Q04007 HCS1YKL017C 2052 nt2.25□□□□□ -2.05
SND1Q04007 MSH6YDR097C 3729 nt2.25□□□□□ -2.05
SND1Q04007 BNI1YNL271C 5862 nt2.25□□□□□ -2.05
SND1Q04007 NOP14YDL148C 2433 nt2.25□□□□□ -2.05
SND1Q04007 IRC8YJL051W 2469 nt2.24□□□□□ -2.05
SND1Q04007 SEC63YOR254C 1992 nt2.24□□□□□ -2.05
SND1Q04007 PRE4YFR050C 801 nt2.24□□□□□ -2.05
SND1Q04007 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.24□□□□□ -2.05
SND1Q04007 PDR8YLR266C 2106 nt2.24□□□□□ -2.05
SND1Q04007 VPS34YLR240W 2628 nt2.23□□□□□ -2.05
SND1Q04007 CTR9YOL145C 3234 nt2.23□□□□□ -2.05
SND1Q04007 SSQ1YLR369W 1974 nt2.23□□□□□ -2.05
SND1Q04007 MGA2YIR033W 3342 nt2.23□□□□□ -2.05
SND1Q04007 YFL063WYFL063W 456 nt2.23□□□□□ -2.05
SND1Q04007 YGR265WYGR265W 411 nt2.23□□□□□ -2.05
SND1Q04007 YOL098CYOL098C 3114 nt2.23□□□□□ -2.05
SND1Q04007 HDA3YPR179C 1968 nt2.23□□□□□ -2.05
SND1Q04007 PUT3YKL015W 2940 nt2.22□□□□□ -2.05
SND1Q04007 HSL1YKL101W 4557 nt2.22□□□□□ -2.05
SND1Q04007 ATP7YKL016C 525 nt2.22□□□□□ -2.05
SND1Q04007 YGR250CYGR250C 2346 nt2.22□□□□□ -2.05
SND1Q04007 EFR3YMR212C 2349 nt2.22□□□□□ -2.05
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