Protein–RNA interactions for Protein: Q03880

PKR1, V-type ATPase assembly factor PKR1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PKR1Q03880 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.43□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.43□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.43□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.43□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.43□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.43□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.43□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 CMS1YLR003C 876 nt0.43□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 YOP1YPR028W 543 nt0.43□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 LTE1YAL024C 4308 nt0.42□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 snR83snR83 306 nt0.42□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.42□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 IRC2YDR112W 309 nt0.42□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 SNO3YFL060C 669 nt0.42□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 ECM12YHR021W-A 456 nt0.42□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 ARV1YLR242C 966 nt0.42□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 RUF22RUF22 515 nt0.42□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 SNO2YNL334C 669 nt0.42□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 ZIP1YDR285W 2628 nt0.42□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 SAG1YJR004C 1953 nt0.41□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 snR59snR59 78 nt0.41□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 OCA6YDR067C 675 nt0.41□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.41□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 DFG10YIL049W 762 nt0.41□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 YPL080CYPL080C 327 nt0.41□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt0.41□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 FIG4YNL325C 2640 nt0.4□□□□□ -2.34
PKR1Q03880 MDM32YOR147W 1869 nt0.4□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 YML009C-AYML009C-A 327 nt0.4□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 YLL007CYLL007C 1998 nt0.39□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 MKT1YNL085W 2493 nt0.39□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 YDR509WYDR509W 348 nt0.39□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 IES4YOR189W 351 nt0.39□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 SPR2YOR214C 711 nt0.39□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 ATP20YPR020W 348 nt0.39□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 PAC1YOR269W 1485 nt0.39□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 PDE2YOR360C 1581 nt0.38□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 SRB7YDR308C 423 nt0.38□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 ALG13YGL047W 609 nt0.38□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt0.38□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.37□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 YBR032WYBR032W 303 nt0.37□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 SWI5YDR146C 2130 nt0.37□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 SLD3YGL113W 2007 nt0.37□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 VPS52YDR484W 1926 nt0.36□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 SCW11YGL028C 1629 nt0.36□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 YDR115WYDR115W 318 nt0.36□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 RPL37AYLR185W 267 nt0.36□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 GUP1YGL084C 1683 nt0.36□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 YAR009CYAR009C 3591 nt0.36□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 YDL152WYDL152W 366 nt0.35□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt0.35□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.35□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 PAN2YGL094C 3348 nt0.35□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt0.35□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 DBP6YNR038W 1890 nt0.35□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 PXA2YKL188C 2562 nt0.34□□□□□ -2.35
PKR1Q03880 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt0.34□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 YIL059CYIL059C 366 nt0.34□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 YOR364WYOR364W 369 nt0.34□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 ALY2YJL084C 3141 nt0.34□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 HNT1YDL125C 477 nt0.33□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 COX3Q0275 810 nt0.33□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 snR79snR79 84 nt0.32□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 HTB1YDR224C 396 nt0.32□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 LOC1YFR001W 615 nt0.32□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 KAR1YNL188W 1302 nt0.32□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 YSP1YHR155W 3687 nt0.31□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 YER087C-AYER087C-A 552 nt0.31□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 URM1YIL008W 300 nt0.31□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 ACF4YJR083C 930 nt0.31□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 SDH2YLL041C 801 nt0.31□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 COX7YMR256C 183 nt0.31□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.31□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 MMS4YBR098W 2076 nt0.3□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 YEL057CYEL057C 702 nt0.3□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 ABF2YMR072W 552 nt0.3□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 YMR160WYMR160W 2451 nt0.29□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 TDA2YER071C 381 nt0.29□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 PRE4YFR050C 801 nt0.29□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 FMP27YLR454W 7887 nt0.29□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 LYS14YDR034C 2373 nt0.28□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 WAR1YML076C 2835 nt0.28□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 SLY1YDR189W 2001 nt0.28□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 APL2YKL135C 2181 nt0.28□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 YER023C-AYER023C-A 213 nt0.28□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 ISD11YER048W-A 285 nt0.28□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt0.28□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 HIT1YJR055W 495 nt0.28□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 YPR147CYPR147C 915 nt0.28□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 YPR153WYPR153W 423 nt0.28□□□□□ -2.36
PKR1Q03880 YDR114CYDR114C 303 nt0.27□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 YHR054CYHR054C 1065 nt0.27□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.27□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 YOL106WYOL106W 354 nt0.27□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 LCD1YDR499W 2244 nt0.27□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 OST1YJL002C 1431 nt0.26□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 SPO23YBR250W 1572 nt0.26□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 BFR2YDR299W 1605 nt0.26□□□□□ -2.37
PKR1Q03880 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt0.25□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 100 ms