Protein–RNA interactions for Protein: Q03180

PIR3, Cell wall mannoprotein PIR3, yeastyeast

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3Q03180 YRB1YDR002W 606 nt1.85□□□□□ -2.11
PIR3Q03180 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.85□□□□□ -2.11
PIR3Q03180 tW(UCA)QtW(UCA)Q 74 nt1.85□□□□□ -2.11
PIR3Q03180 YKL136WYKL136W 399 nt1.85□□□□□ -2.11
PIR3Q03180 YAF9YNL107W 681 nt1.85□□□□□ -2.11
PIR3Q03180 RPL32YBL092W 393 nt1.85□□□□□ -2.11
PIR3Q03180 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.85□□□□□ -2.11
PIR3Q03180 YSY6YBR162W-A 198 nt1.85□□□□□ -2.11
PIR3Q03180 MNE1YOR350C 1992 nt1.85□□□□□ -2.11
PIR3Q03180 YBR184WYBR184W 1572 nt1.85□□□□□ -2.11
PIR3Q03180 MNL2YLR057W 2550 nt1.84□□□□□ -2.11
PIR3Q03180 RPL27BYDR471W 411 nt1.84□□□□□ -2.11
PIR3Q03180 TIM9YEL020W-A 264 nt1.84□□□□□ -2.11
PIR3Q03180 ANS1YHR126C 480 nt1.84□□□□□ -2.11
PIR3Q03180 PHS1YJL097W 654 nt1.84□□□□□ -2.11
PIR3Q03180 YBL083CYBL083C 426 nt1.84□□□□□ -2.11
PIR3Q03180 RPA34YJL148W 702 nt1.83□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 ABM1YJR108W 372 nt1.83□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 RPS27AYKL156W 249 nt1.83□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 TIM18YOR297C 579 nt1.83□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 PHO2YDL106C 1680 nt1.83□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 MCD1YDL003W 1701 nt1.83□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 ARP7YPR034W 1434 nt1.83□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 SNF5YBR289W 2718 nt1.82□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 TOF1YNL273W 3717 nt1.82□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 YDL118WYDL118W 381 nt1.82□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 VPS8YAL002W 3825 nt1.82□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 YKL118WYKL118W 312 nt1.82□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 YPR097WYPR097W 3222 nt1.81□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 YFH1YDL120W 525 nt1.81□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 YDR008CYDR008C 351 nt1.81□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 YDR102CYDR102C 333 nt1.81□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 IRR1YIL026C 3453 nt1.81□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 NOP14YDL148C 2433 nt1.81□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 VPH1YOR270C 2523 nt1.81□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 SLM1YIL105C 2061 nt1.81□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 DFG16YOR030W 1860 nt1.8□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 YLR053CYLR053C 327 nt1.8□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.8□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 ZRG8YER033C 3231 nt1.79□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 RTT107YHR154W 3213 nt1.79□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 YBP1YBR216C 2025 nt1.79□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 TRL1YJL087C 2484 nt1.79□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 VPS34YLR240W 2628 nt1.79□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 YCR043CYCR043C 384 nt1.79□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 MRP10YDL045W-A 288 nt1.79□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt1.79□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 HER1YOR227W 3741 nt1.78□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 SGO1YOR073W 1773 nt1.78□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 PAC1YOR269W 1485 nt1.78□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 YDL062WYDL062W 426 nt1.78□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 NHP2YDL208W 471 nt1.78□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 YHL037CYHL037C 402 nt1.78□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 YNL114CYNL114C 372 nt1.78□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 YNL277W-AYNL277W-A 189 nt1.78□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 HHT1YBR010W 411 nt1.78□□□□□ -2.12
PIR3Q03180 RKM1YPL208W 1752 nt1.77□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 RPL42BYHR141C 321 nt1.77□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 YIL059CYIL059C 366 nt1.77□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 IRC20YLR247C 4671 nt1.77□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 RPL42AYNL162W 321 nt1.77□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 GRR1YJR090C 3456 nt1.77□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 TRM3YDL112W 4311 nt1.77□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 CFT1YDR301W 4074 nt1.76□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 YDR413CYDR413C 576 nt1.76□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 YER097WYER097W 330 nt1.76□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt1.76□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 YDR341CYDR341C 1824 nt1.75□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 CSN9YDR179C 489 nt1.75□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 YHL041WYHL041W 450 nt1.75□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.75□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt1.75□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 MAM33YIL070C 801 nt1.75□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.75□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 CYB5YNL111C 363 nt1.75□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 YOR199WYOR199W 330 nt1.75□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 COS111YBR203W 2775 nt1.75□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 CDC60YPL160W 3273 nt1.74□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 RTT101YJL047C 2529 nt1.74□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.74□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 PLC1YPL268W 2610 nt1.74□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 IST2YBR086C 2841 nt1.73□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 PXA2YKL188C 2562 nt1.73□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 SYH1YPL105C 2550 nt1.73□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 OSH6YKR003W 1347 nt1.73□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 HSH155YMR288W 2916 nt1.73□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 snR36snR36 182 nt1.73□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 NOP53YPL146C 1368 nt1.72□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 USO1YDL058W 5373 nt1.72□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 RPH1YER169W 2391 nt1.72□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 RPL35AYDL191W 363 nt1.72□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 RPL37BYDR500C 267 nt1.72□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 YFL032WYFL032W 321 nt1.72□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.72□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 COA6YMR244C-A 315 nt1.72□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 SAR1YPL218W 573 nt1.72□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 NUT2YPR168W 474 nt1.72□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 SFB2YNL049C 2631 nt1.72□□□□□ -2.13
PIR3Q03180 EFR3YMR212C 2349 nt1.71□□□□□ -2.14
PIR3Q03180 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt1.71□□□□□ -2.14
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 37.6 ms