Protein–RNA interactions for Protein: P40547

VID28, Vacuolar import and degradation protein 28, yeastyeast

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Length 921 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VID28P40547 SSQ1YLR369W 1974 nt2.44□□□□□ -2.02
VID28P40547 YFL063WYFL063W 456 nt2.44□□□□□ -2.02
VID28P40547 DGR1YNL130C-A 147 nt2.44□□□□□ -2.02
VID28P40547 DAD3YBR233W-A 285 nt2.44□□□□□ -2.02
VID28P40547 STB4YMR019W 2850 nt2.43□□□□□ -2.02
VID28P40547 HHT1YBR010W 411 nt2.43□□□□□ -2.02
VID28P40547 YCL023CYCL023C 348 nt2.43□□□□□ -2.02
VID28P40547 PEX8YGR077C 1770 nt2.43□□□□□ -2.02
VID28P40547 OSH6YKR003W 1347 nt2.42□□□□□ -2.02
VID28P40547 PHO2YDL106C 1680 nt2.42□□□□□ -2.02
VID28P40547 RPL35AYDL191W 363 nt2.42□□□□□ -2.02
VID28P40547 CSN9YDR179C 489 nt2.42□□□□□ -2.02
VID28P40547 BRP1YGL007W 378 nt2.42□□□□□ -2.02
VID28P40547 RPA34YJL148W 702 nt2.42□□□□□ -2.02
VID28P40547 YKU80YMR106C 1890 nt2.41□□□□□ -2.02
VID28P40547 KRE33YNL132W 3171 nt2.41□□□□□ -2.02
VID28P40547 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.41□□□□□ -2.02
VID28P40547 UFD4YKL010C 4452 nt2.41□□□□□ -2.02
VID28P40547 ZRG8YER033C 3231 nt2.4□□□□□ -2.02
VID28P40547 VPH1YOR270C 2523 nt2.4□□□□□ -2.02
VID28P40547 EDS1YBR033W 2760 nt2.4□□□□□ -2.02
VID28P40547 YDR286CYDR286C 345 nt2.4□□□□□ -2.03
VID28P40547 HTB2YBL002W 396 nt2.4□□□□□ -2.03
VID28P40547 YOR282WYOR282W 321 nt2.4□□□□□ -2.03
VID28P40547 MET18YIL128W 3099 nt2.4□□□□□ -2.03
VID28P40547 SET2YJL168C 2202 nt2.4□□□□□ -2.03
VID28P40547 SSD1YDR293C 3753 nt2.39□□□□□ -2.03
VID28P40547 YGL149WYGL149W 306 nt2.39□□□□□ -2.03
VID28P40547 YHL041WYHL041W 450 nt2.39□□□□□ -2.03
VID28P40547 YBL083CYBL083C 426 nt2.39□□□□□ -2.03
VID28P40547 ORC2YBR060C 1863 nt2.39□□□□□ -2.03
VID28P40547 PSD2YGR170W 3417 nt2.38□□□□□ -2.03
VID28P40547 RIM20YOR275C 1986 nt2.38□□□□□ -2.03
VID28P40547 BRE1YDL074C 2103 nt2.38□□□□□ -2.03
VID28P40547 PAU8YAL068C 363 nt2.38□□□□□ -2.03
VID28P40547 PAU20YOL161C 363 nt2.38□□□□□ -2.03
VID28P40547 YOR333CYOR333C 417 nt2.38□□□□□ -2.03
VID28P40547 SAR1YPL218W 573 nt2.38□□□□□ -2.03
VID28P40547 SLM1YIL105C 2061 nt2.38□□□□□ -2.03
VID28P40547 IRR1YIL026C 3453 nt2.38□□□□□ -2.03
VID28P40547 TOF1YNL273W 3717 nt2.37□□□□□ -2.03
VID28P40547 YFR016CYFR016C 3702 nt2.37□□□□□ -2.03
VID28P40547 NOP14YDL148C 2433 nt2.37□□□□□ -2.03
VID28P40547 VPS34YLR240W 2628 nt2.36□□□□□ -2.03
VID28P40547 VMR1YHL035C 4779 nt2.36□□□□□ -2.03
VID28P40547 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.36□□□□□ -2.03
VID28P40547 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt2.36□□□□□ -2.03
VID28P40547 MNE1YOR350C 1992 nt2.36□□□□□ -2.03
VID28P40547 GRR1YJR090C 3456 nt2.36□□□□□ -2.03
VID28P40547 EFR3YMR212C 2349 nt2.35□□□□□ -2.03
VID28P40547 SPP41YDR464W 4308 nt2.35□□□□□ -2.03
VID28P40547 EMP24YGL200C 612 nt2.35□□□□□ -2.03
VID28P40547 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.35□□□□□ -2.03
VID28P40547 RPL38YLR325C 237 nt2.35□□□□□ -2.03
VID28P40547 RPS17AYML024W 411 nt2.35□□□□□ -2.03
VID28P40547 YNL114CYNL114C 372 nt2.35□□□□□ -2.03
VID28P40547 INO80YGL150C 4470 nt2.35□□□□□ -2.03
VID28P40547 VPS8YAL002W 3825 nt2.34□□□□□ -2.03
VID28P40547 UBP2YOR124C 3819 nt2.34□□□□□ -2.03
VID28P40547 UBR1YGR184C 5853 nt2.34□□□□□ -2.03
VID28P40547 HTL1YCR020W-B 237 nt2.34□□□□□ -2.03
VID28P40547 YDR366CYDR366C 399 nt2.34□□□□□ -2.03
VID28P40547 RPL42BYHR141C 321 nt2.34□□□□□ -2.03
VID28P40547 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.34□□□□□ -2.03
VID28P40547 YLR255CYLR255C 354 nt2.34□□□□□ -2.03
VID28P40547 RPL42AYNL162W 321 nt2.34□□□□□ -2.03
VID28P40547 NUT2YPR168W 474 nt2.34□□□□□ -2.03
VID28P40547 SEC16YPL085W 6588 nt2.33□□□□□ -2.04
VID28P40547 YCR043CYCR043C 384 nt2.33□□□□□ -2.04
VID28P40547 YDR048CYDR048C 315 nt2.33□□□□□ -2.04
VID28P40547 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.33□□□□□ -2.04
VID28P40547 HOP2YGL033W 657 nt2.32□□□□□ -2.04
VID28P40547 YLR053CYLR053C 327 nt2.32□□□□□ -2.04
VID28P40547 MCD1YDL003W 1701 nt2.31□□□□□ -2.04
VID28P40547 SWI6YLR182W 2412 nt2.31□□□□□ -2.04
VID28P40547 HDA3YPR179C 1968 nt2.31□□□□□ -2.04
VID28P40547 HMRA2YCR096C 360 nt2.31□□□□□ -2.04
VID28P40547 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.31□□□□□ -2.04
VID28P40547 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.31□□□□□ -2.04
VID28P40547 PCC1YKR095W-A 267 nt2.31□□□□□ -2.04
VID28P40547 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.31□□□□□ -2.04
VID28P40547 snR51snR51 107 nt2.31□□□□□ -2.04
VID28P40547 KOG1YHR186C 4674 nt2.31□□□□□ -2.04
VID28P40547 RPH1YER169W 2391 nt2.3□□□□□ -2.04
VID28P40547 PXA2YKL188C 2562 nt2.3□□□□□ -2.04
VID28P40547 snR8snR8 190 nt2.3□□□□□ -2.04
VID28P40547 STH1YIL126W 4080 nt2.3□□□□□ -2.04
VID28P40547 NOP53YPL146C 1368 nt2.3□□□□□ -2.04
VID28P40547 YCR102W-AYCR102W-A 198 nt2.29□□□□□ -2.04
VID28P40547 YRB1YDR002W 606 nt2.29□□□□□ -2.04
VID28P40547 YIL102CYIL102C 306 nt2.29□□□□□ -2.04
VID28P40547 COS111YBR203W 2775 nt2.28□□□□□ -2.04
VID28P40547 NPC2YDL046W 522 nt2.28□□□□□ -2.04
VID28P40547 UPS1YLR193C 528 nt2.28□□□□□ -2.04
VID28P40547 YOP1YPR028W 543 nt2.28□□□□□ -2.04
VID28P40547 SWI5YDR146C 2130 nt2.27□□□□□ -2.05
VID28P40547 TRL1YJL087C 2484 nt2.27□□□□□ -2.05
VID28P40547 TIM9YEL020W-A 264 nt2.27□□□□□ -2.05
VID28P40547 CYC7YEL039C 342 nt2.27□□□□□ -2.05
VID28P40547 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt2.27□□□□□ -2.05
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