Protein–RNA interactions for Protein: P40509

SEC28, Coatomer subunit epsilon, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEC28P40509 SPC110YDR356W 2835 nt1.56□□□□□ -2.16
SEC28P40509 YBP1YBR216C 2025 nt1.56□□□□□ -2.16
SEC28P40509 ALK1YGL021W 2283 nt1.55□□□□□ -2.16
SEC28P40509 YCR001WYCR001W 315 nt1.55□□□□□ -2.16
SEC28P40509 EMC5YIL027C 426 nt1.55□□□□□ -2.16
SEC28P40509 KIP1YBL063W 3336 nt1.55□□□□□ -2.16
SEC28P40509 DCP2YNL118C 2913 nt1.54□□□□□ -2.16
SEC28P40509 YDR509WYDR509W 348 nt1.54□□□□□ -2.16
SEC28P40509 COF1YLL050C 432 nt1.54□□□□□ -2.16
SEC28P40509 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.54□□□□□ -2.16
SEC28P40509 YOL013W-BYOL013W-B 291 nt1.54□□□□□ -2.16
SEC28P40509 YBR174CYBR174C 315 nt1.54□□□□□ -2.16
SEC28P40509 YDR008CYDR008C 351 nt1.53□□□□□ -2.16
SEC28P40509 YIL102CYIL102C 306 nt1.53□□□□□ -2.16
SEC28P40509 VPS55YJR044C 423 nt1.53□□□□□ -2.16
SEC28P40509 YML108WYML108W 318 nt1.53□□□□□ -2.16
SEC28P40509 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.53□□□□□ -2.16
SEC28P40509 SWI5YDR146C 2130 nt1.52□□□□□ -2.17
SEC28P40509 YLR140WYLR140W 327 nt1.52□□□□□ -2.17
SEC28P40509 YNL122CYNL122C 348 nt1.52□□□□□ -2.17
SEC28P40509 SSK2YNR031C 4740 nt1.52□□□□□ -2.17
SEC28P40509 CCH1YGR217W 6120 nt1.51□□□□□ -2.17
SEC28P40509 MTC7YEL033W 420 nt1.51□□□□□ -2.17
SEC28P40509 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.51□□□□□ -2.17
SEC28P40509 YER135CYER135C 393 nt1.51□□□□□ -2.17
SEC28P40509 YGR045CYGR045C 363 nt1.51□□□□□ -2.17
SEC28P40509 POL5YEL055C 3069 nt1.51□□□□□ -2.17
SEC28P40509 EST2YLR318W 2655 nt1.51□□□□□ -2.17
SEC28P40509 YCS4YLR272C 3531 nt1.5□□□□□ -2.17
SEC28P40509 YER084W-AYER084W-A 513 nt1.5□□□□□ -2.17
SEC28P40509 RPF1YHR088W 888 nt1.5□□□□□ -2.17
SEC28P40509 YLR255CYLR255C 354 nt1.5□□□□□ -2.17
SEC28P40509 YLR269CYLR269C 351 nt1.5□□□□□ -2.17
SEC28P40509 YPR177CYPR177C 372 nt1.5□□□□□ -2.17
SEC28P40509 DGR2YKL121W 2559 nt1.5□□□□□ -2.17
SEC28P40509 MSH3YCR092C 3057 nt1.49□□□□□ -2.17
SEC28P40509 UFD2YDL190C 2886 nt1.49□□□□□ -2.17
SEC28P40509 YGR290WYGR290W 444 nt1.49□□□□□ -2.17
SEC28P40509 LAA1YJL207C 6045 nt1.49□□□□□ -2.17
SEC28P40509 MLH3YPL164C 2148 nt1.49□□□□□ -2.17
SEC28P40509 MSN5YDR335W 3675 nt1.48□□□□□ -2.17
SEC28P40509 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.48□□□□□ -2.17
SEC28P40509 YEL057CYEL057C 702 nt1.48□□□□□ -2.17
SEC28P40509 YGL239CYGL239C 315 nt1.48□□□□□ -2.17
SEC28P40509 YHR125WYHR125W 306 nt1.48□□□□□ -2.17
SEC28P40509 YJL015CYJL015C 285 nt1.48□□□□□ -2.17
SEC28P40509 MVP1YMR004W 1536 nt1.48□□□□□ -2.17
SEC28P40509 ZIP1YDR285W 2628 nt1.48□□□□□ -2.17
SEC28P40509 PIK1YNL267W 3201 nt1.47□□□□□ -2.17
SEC28P40509 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.47□□□□□ -2.17
SEC28P40509 NBL1YHR199C-A 222 nt1.47□□□□□ -2.17
SEC28P40509 URM1YIL008W 300 nt1.47□□□□□ -2.17
SEC28P40509 PFD1YJL179W 330 nt1.47□□□□□ -2.17
SEC28P40509 RPL40BYKR094C 387 nt1.47□□□□□ -2.17
SEC28P40509 YOP1YPR028W 543 nt1.47□□□□□ -2.17
SEC28P40509 SPC98YNL126W 2541 nt1.47□□□□□ -2.17
SEC28P40509 FYV8YGR196C 2454 nt1.46□□□□□ -2.18
SEC28P40509 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.46□□□□□ -2.18
SEC28P40509 YOR376WYOR376W 369 nt1.46□□□□□ -2.18
SEC28P40509 PET127YOR017W 2403 nt1.45□□□□□ -2.18
SEC28P40509 YER076W-AYER076W-A 348 nt1.45□□□□□ -2.18
SEC28P40509 BI2Q0110 1272 nt1.45□□□□□ -2.18
SEC28P40509 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt1.45□□□□□ -2.18
SEC28P40509 LOA1YPR139C 903 nt1.45□□□□□ -2.18
SEC28P40509 snR54snR54 86 nt1.45□□□□□ -2.18
SEC28P40509 SEC21YNL287W 2808 nt1.45□□□□□ -2.18
SEC28P40509 SPO23YBR250W 1572 nt1.44□□□□□ -2.18
SEC28P40509 AIM29YKR074W 468 nt1.44□□□□□ -2.18
SEC28P40509 YPL182CYPL182C 384 nt1.44□□□□□ -2.18
SEC28P40509 MAD1YGL086W 2250 nt1.43□□□□□ -2.18
SEC28P40509 MKT1YNL085W 2493 nt1.43□□□□□ -2.18
SEC28P40509 HKR1YDR420W 5409 nt1.43□□□□□ -2.18
SEC28P40509 YDR114CYDR114C 303 nt1.43□□□□□ -2.18
SEC28P40509 PAU2YEL049W 363 nt1.43□□□□□ -2.18
SEC28P40509 NFU1YKL040C 771 nt1.43□□□□□ -2.18
SEC28P40509 YLR171WYLR171W 390 nt1.43□□□□□ -2.18
SEC28P40509 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.43□□□□□ -2.18
SEC28P40509 SEC5YDR166C 2916 nt1.43□□□□□ -2.18
SEC28P40509 SMC4YLR086W 4257 nt1.43□□□□□ -2.18
SEC28P40509 AZF1YOR113W 2745 nt1.43□□□□□ -2.18
SEC28P40509 SGO1YOR073W 1773 nt1.42□□□□□ -2.18
SEC28P40509 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.42□□□□□ -2.18
SEC28P40509 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt1.42□□□□□ -2.18
SEC28P40509 CDC31YOR257W 486 nt1.42□□□□□ -2.18
SEC28P40509 TIM18YOR297C 579 nt1.42□□□□□ -2.18
SEC28P40509 SWI6YLR182W 2412 nt1.42□□□□□ -2.18
SEC28P40509 YLR419WYLR419W 4308 nt1.42□□□□□ -2.18
SEC28P40509 LYS14YDR034C 2373 nt1.42□□□□□ -2.18
SEC28P40509 HIT1YJR055W 495 nt1.41□□□□□ -2.18
SEC28P40509 FYV7YLR068W 456 nt1.41□□□□□ -2.18
SEC28P40509 RPL32YBL092W 393 nt1.41□□□□□ -2.18
SEC28P40509 YSY6YBR162W-A 198 nt1.41□□□□□ -2.18
SEC28P40509 RAD50YNL250W 3939 nt1.41□□□□□ -2.18
SEC28P40509 PMD1YER132C 5262 nt1.41□□□□□ -2.18
SEC28P40509 PXA2YKL188C 2562 nt1.41□□□□□ -2.18
SEC28P40509 ECL1YGR146C 636 nt1.4□□□□□ -2.19
SEC28P40509 NUT1YGL151W 3399 nt1.4□□□□□ -2.19
SEC28P40509 CLU1YMR012W 3834 nt1.4□□□□□ -2.19
SEC28P40509 VPS54YDR027C 2670 nt1.4□□□□□ -2.19
SEC28P40509 GDS1YOR355W 1569 nt1.39□□□□□ -2.19
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