Protein–RNA interactions for Protein: P40422

RPC10, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, yeastyeast

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10P40422 RPL42BYHR141C 321 nt0.05□□□□□ -2.4
RPC10P40422 IMP3YHR148W 552 nt0.05□□□□□ -2.4
RPC10P40422 YLR042CYLR042C 486 nt0.05□□□□□ -2.4
RPC10P40422 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt0.05□□□□□ -2.4
RPC10P40422 RPL42AYNL162W 321 nt0.05□□□□□ -2.4
RPC10P40422 SRP14YDL092W 441 nt0.04□□□□□ -2.4
RPC10P40422 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.04□□□□□ -2.4
RPC10P40422 RTR2YDR066C 591 nt0.04□□□□□ -2.4
RPC10P40422 OCA6YDR067C 675 nt0.04□□□□□ -2.4
RPC10P40422 SBH1YER087C-B 249 nt0.04□□□□□ -2.4
RPC10P40422 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt0.04□□□□□ -2.4
RPC10P40422 BET4YJL031C 984 nt0.04□□□□□ -2.4
RPC10P40422 RFA3YJL173C 369 nt0.04□□□□□ -2.4
RPC10P40422 SMD2YLR275W 333 nt0.04□□□□□ -2.4
RPC10P40422 YBR051WYBR051W 351 nt0.04□□□□□ -2.4
RPC10P40422 ATP15YPL271W 189 nt0.04□□□□□ -2.4
RPC10P40422 AFR1YDR085C 1863 nt0.03□□□□□ -2.4
RPC10P40422 SGD1YLR336C 2700 nt0.03□□□□□ -2.4
RPC10P40422 LSO2YGR169C-A 279 nt0.03□□□□□ -2.4
RPC10P40422 SAY1YGR263C 1275 nt0.03□□□□□ -2.4
RPC10P40422 YJL156W-AYJL156W-A 222 nt0.03□□□□□ -2.4
RPC10P40422 YOL014WYOL014W 375 nt0.03□□□□□ -2.4
RPC10P40422 ROX1YPR065W 1107 nt0.03□□□□□ -2.4
RPC10P40422 SLI15YBR156C 2097 nt0.02□□□□□ -2.41
RPC10P40422 YBR184WYBR184W 1572 nt0.02□□□□□ -2.41
RPC10P40422 NGG1YDR176W 2109 nt0.02□□□□□ -2.41
RPC10P40422 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt0.02□□□□□ -2.41
RPC10P40422 GEP7YGL057C 864 nt0.02□□□□□ -2.41
RPC10P40422 RPL26BYGR034W 384 nt0.02□□□□□ -2.41
RPC10P40422 RSM27YGR215W 333 nt0.02□□□□□ -2.41
RPC10P40422 YGR242WYGR242W 309 nt0.02□□□□□ -2.41
RPC10P40422 PDE2YOR360C 1581 nt0.02□□□□□ -2.41
RPC10P40422 NUT1YGL151W 3399 nt0.01□□□□□ -2.41
RPC10P40422 MKT1YNL085W 2493 nt0.01□□□□□ -2.41
RPC10P40422 YHL002C-AYHL002C-A 489 nt0.01□□□□□ -2.41
RPC10P40422 PAU18YLL064C 363 nt0.01□□□□□ -2.41
RPC10P40422 COX12YLR038C 252 nt0.01□□□□□ -2.41
RPC10P40422 PAU6YNR076W 363 nt0.01□□□□□ -2.41
RPC10P40422 YOL013W-AYOL013W-A 192 nt0.01□□□□□ -2.41
RPC10P40422 PEX34YCL056C 435 nt0.01□□□□□ -2.41
RPC10P40422 ZIP1YDR285W 2628 nt0□□□□□ -2.41
RPC10P40422 PHS1YJL097W 654 nt0□□□□□ -2.41
RPC10P40422 SDH2YLL041C 801 nt0□□□□□ -2.41
RPC10P40422 RPL37AYLR185W 267 nt0□□□□□ -2.41
RPC10P40422 UBC7YMR022W 498 nt0□□□□□ -2.41
RPC10P40422 WAR1YML076C 2835 nt-0□□□□□ -2.41
RPC10P40422 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPC10P40422 SCW11YGL028C 1629 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPC10P40422 snR57snR57 88 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPC10P40422 RUF20RUF20 443 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPC10P40422 YMR324CYMR324C 243 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPC10P40422 RUF22RUF22 515 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPC10P40422 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPC10P40422 SWI5YDR146C 2130 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPC10P40422 SAC3YDR159W 3906 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPC10P40422 YOR192C-BYOR192C-B 5313 nt-0.01□□□□□ -2.41
RPC10P40422 BFR2YDR299W 1605 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPC10P40422 SLD3YGL113W 2007 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPC10P40422 QCR9YGR183C 201 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPC10P40422 RPS16AYMR143W 432 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPC10P40422 PET20YPL159C 762 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPC10P40422 YPR153WYPR153W 423 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPC10P40422 YBL100W-BYBL100W-B 5313 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPC10P40422 CHS6YJL099W 2241 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPC10P40422 REF2YDR195W 1602 nt-0.02□□□□□ -2.41
RPC10P40422 VIK1YPL253C 1944 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPC10P40422 HDA3YPR179C 1968 nt-0.03□□□□□ -2.41
RPC10P40422 NPR2YEL062W 1848 nt-0.03□□□□□ -2.42
RPC10P40422 KAR3YPR141C 2190 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPC10P40422 ISD11YER048W-A 285 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPC10P40422 YOR169CYOR169C 465 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPC10P40422 snR13snR13 124 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPC10P40422 SPR2YOR214C 711 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPC10P40422 THO2YNL139C 4794 nt-0.04□□□□□ -2.42
RPC10P40422 KAR1YNL188W 1302 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPC10P40422 MMS4YBR098W 2076 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPC10P40422 IES5YER092W 378 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPC10P40422 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPC10P40422 YOP1YPR028W 543 nt-0.05□□□□□ -2.42
RPC10P40422 BI3Q0115 1554 nt-0.06□□□□□ -2.42
RPC10P40422 YER078W-AYER078W-A 165 nt-0.06□□□□□ -2.42
RPC10P40422 BLS1YLR408C 369 nt-0.06□□□□□ -2.42
RPC10P40422 YPR172WYPR172W 603 nt-0.06□□□□□ -2.42
RPC10P40422 YCR024C-BYCR024C-B 267 nt-0.07□□□□□ -2.42
RPC10P40422 UBC9YDL064W 474 nt-0.08□□□□□ -2.42
RPC10P40422 RPL9AYGL147C 576 nt-0.08□□□□□ -2.42
RPC10P40422 PET111YMR257C 2403 nt-0.08□□□□□ -2.42
RPC10P40422 PRP5YBR237W 2550 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPC10P40422 LSM4YER112W 564 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPC10P40422 POP6YGR030C 477 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPC10P40422 TIM8YJR135W-A 264 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPC10P40422 RPS10BYMR230W 318 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPC10P40422 YOR053WYOR053W 342 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPC10P40422 YOR282WYOR282W 321 nt-0.09□□□□□ -2.42
RPC10P40422 NUP82YJL061W 2142 nt-0.1□□□□□ -2.42
RPC10P40422 HNT1YDL125C 477 nt-0.1□□□□□ -2.43
RPC10P40422 RPL29YFR032C-A 180 nt-0.1□□□□□ -2.43
RPC10P40422 YGR042WYGR042W 816 nt-0.1□□□□□ -2.43
RPC10P40422 snR24snR24 89 nt-0.1□□□□□ -2.43
RPC10P40422 LCD1YDR499W 2244 nt-0.1□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43 ms