Protein–RNA interactions for Protein: P38344

REI1, Cytoplasmic 60S subunit biogenesis factor REI1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
REI1P38344 KSP1YHR082C 3090 nt2.98□□□□□ -1.93
REI1P38344 PSK1YAL017W 4071 nt2.97□□□□□ -1.93
REI1P38344 AI2Q0055 2565 nt2.97□□□□□ -1.93
REI1P38344 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt2.97□□□□□ -1.93
REI1P38344 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt2.97□□□□□ -1.93
REI1P38344 DNL4YOR005C 2835 nt2.97□□□□□ -1.93
REI1P38344 VPS34YLR240W 2628 nt2.97□□□□□ -1.93
REI1P38344 SEF1YBL066C 3447 nt2.97□□□□□ -1.93
REI1P38344 YEL043WYEL043W 2871 nt2.97□□□□□ -1.93
REI1P38344 YLR149CYLR149C 2193 nt2.97□□□□□ -1.93
REI1P38344 ECM21YBL101C 3354 nt2.97□□□□□ -1.93
REI1P38344 YPR089WYPR089W 2667 nt2.96□□□□□ -1.93
REI1P38344 HRD3YLR207W 2502 nt2.96□□□□□ -1.93
REI1P38344 IKI3YLR384C 4050 nt2.96□□□□□ -1.94
REI1P38344 POL3YDL102W 3294 nt2.95□□□□□ -1.94
REI1P38344 ORC2YBR060C 1863 nt2.95□□□□□ -1.94
REI1P38344 PXA2YKL188C 2562 nt2.95□□□□□ -1.94
REI1P38344 YME2YMR302C 2553 nt2.95□□□□□ -1.94
REI1P38344 JSN1YJR091C 3276 nt2.95□□□□□ -1.94
REI1P38344 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.95□□□□□ -1.94
REI1P38344 MPT5YGL178W 2580 nt2.95□□□□□ -1.94
REI1P38344 RGR1YLR071C 3249 nt2.95□□□□□ -1.94
REI1P38344 MMS1YPR164W 4224 nt2.95□□□□□ -1.94
REI1P38344 COS111YBR203W 2775 nt2.95□□□□□ -1.94
REI1P38344 PRP6YBR055C 2700 nt2.94□□□□□ -1.94
REI1P38344 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.94□□□□□ -1.94
REI1P38344 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.94□□□□□ -1.94
REI1P38344 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.94□□□□□ -1.94
REI1P38344 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.94□□□□□ -1.94
REI1P38344 NOP10YHR072W-A 177 nt2.94□□□□□ -1.94
REI1P38344 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.94□□□□□ -1.94
REI1P38344 UTP14YML093W 2700 nt2.94□□□□□ -1.94
REI1P38344 GRR1YJR090C 3456 nt2.94□□□□□ -1.94
REI1P38344 SAP1YER047C 2694 nt2.93□□□□□ -1.94
REI1P38344 YBR184WYBR184W 1572 nt2.93□□□□□ -1.94
REI1P38344 ULI1YFR026C 510 nt2.93□□□□□ -1.94
REI1P38344 FMP16YDR070C 282 nt2.92□□□□□ -1.94
REI1P38344 RPL23BYER117W 414 nt2.92□□□□□ -1.94
REI1P38344 YBL053WYBL053W 375 nt2.92□□□□□ -1.94
REI1P38344 YOR296WYOR296W 3870 nt2.92□□□□□ -1.94
REI1P38344 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.91□□□□□ -1.94
REI1P38344 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.91□□□□□ -1.94
REI1P38344 RPS12YOR369C 432 nt2.91□□□□□ -1.94
REI1P38344 SUL1YBR294W 2580 nt2.91□□□□□ -1.94
REI1P38344 SMY1YKL079W 1971 nt2.91□□□□□ -1.94
REI1P38344 SRO77YBL106C 3033 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 PRP42YDR235W 1635 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 YER138CYER138C 5268 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 YER160CYER160C 5268 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 YJR027WYJR027W 5268 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 YML039WYML039W 5268 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 YML045WYML045W 5268 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 YMR050CYMR050C 5268 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.9□□□□□ -1.94
REI1P38344 SNU13YEL026W 381 nt2.9□□□□□ -1.95
REI1P38344 ECM12YHR021W-A 456 nt2.9□□□□□ -1.95
REI1P38344 snR43snR43 209 nt2.9□□□□□ -1.95
REI1P38344 YIL080WYIL080W 4722 nt2.9□□□□□ -1.95
REI1P38344 RRP12YPL012W 3687 nt2.9□□□□□ -1.95
REI1P38344 PEP3YLR148W 2757 nt2.89□□□□□ -1.95
REI1P38344 YOR218CYOR218C 420 nt2.89□□□□□ -1.95
REI1P38344 TRA1YHR099W 11235 nt2.89□□□□□ -1.95
REI1P38344 RGA2YDR379W 3030 nt2.88□□□□□ -1.95
REI1P38344 CLN3YAL040C 1743 nt2.88□□□□□ -1.95
REI1P38344 YNL114CYNL114C 372 nt2.87□□□□□ -1.95
REI1P38344 RIC1YLR039C 3171 nt2.87□□□□□ -1.95
REI1P38344 RPH1YER169W 2391 nt2.87□□□□□ -1.95
REI1P38344 SWI6YLR182W 2412 nt2.86□□□□□ -1.95
REI1P38344 LCL1YPL056C 306 nt2.86□□□□□ -1.95
REI1P38344 NIP100YPL174C 2607 nt2.86□□□□□ -1.95
REI1P38344 SNF5YBR289W 2718 nt2.85□□□□□ -1.95
REI1P38344 YEL073CYEL073C 324 nt2.85□□□□□ -1.95
REI1P38344 KAP123YER110C 3342 nt2.85□□□□□ -1.95
REI1P38344 RTT10YPL183C 3042 nt2.85□□□□□ -1.95
REI1P38344 DBP10YDL031W 2988 nt2.84□□□□□ -1.95
REI1P38344 YLL007CYLL007C 1998 nt2.84□□□□□ -1.95
REI1P38344 PMP1YCR024C-A 123 nt2.84□□□□□ -1.95
REI1P38344 snR72snR72 98 nt2.84□□□□□ -1.95
REI1P38344 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.84□□□□□ -1.95
REI1P38344 RPB10YOR210W 213 nt2.84□□□□□ -1.95
REI1P38344 IRR1YIL026C 3453 nt2.84□□□□□ -1.95
REI1P38344 TAE2YPL009C 3117 nt2.84□□□□□ -1.95
REI1P38344 SRB8YCR081W 4284 nt2.84□□□□□ -1.95
REI1P38344 MCM10YIL150C 1716 nt2.84□□□□□ -1.96
REI1P38344 CYR1YJL005W 6081 nt2.83□□□□□ -1.96
REI1P38344 CAF120YNL278W 3183 nt2.83□□□□□ -1.96
REI1P38344 RPL34BYIL052C 366 nt2.83□□□□□ -1.96
REI1P38344 YLR012CYLR012C 300 nt2.83□□□□□ -1.96
REI1P38344 YBL109WYBL109W 336 nt2.83□□□□□ -1.96
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