Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa10P31310 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms