Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna3O08545 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna3O08545 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna3O08545 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna3O08545 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna3O08545 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna3O08545 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna3O08545 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms