Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Col9a3A2ACT7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Col9a3A2ACT7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms