Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Slc46a3Q9DC26 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Slc46a3Q9DC26 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms