Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
4933402E13RikQ9D4D2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
4933402E13RikQ9D4D2 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms