Protein–RNA interactions for Protein: Q8K342

Rassf9, Ras association domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf9Q8K342 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Rassf9Q8K342 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rassf9Q8K342 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rassf9Q8K342 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rassf9Q8K342 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rassf9Q8K342 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rassf9Q8K342 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rassf9Q8K342 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rassf9Q8K342 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rassf9Q8K342 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rassf9Q8K342 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rassf9Q8K342 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rassf9Q8K342 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rassf9Q8K342 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rassf9Q8K342 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rassf9Q8K342 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Rassf9Q8K342 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Rassf9Q8K342 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms